Intranet English

Proteinové struktury

Proteinové struktury

http://www.biomed.cas.cz/d312/index.php?section=home

Naše skupina se zabývá strukturní biologií (vztahy mezi strukturou a funkcí určitých skupin bílkovin), konkrétně se zaměřujeme na proteiny, které se účastní přenosu signálu v buňce. Mezi metody, které využíváme, patří příprava proteinů a jejich komplexů, základní biofyzikální charakterizace, charakterizace mezimolekulových interakcí a studium struktury a interakčních povrchů. Všechny tyto metody nám umožňují lépe pochopit detaily, jak je regulována aktivita a funkce protein-proteinových komplexů. Zabýváme se především výzkumem v těchto oblastech:

 

  • Strukturní biologie 14-3-3 proteinů a jejich vazebných partnerů
  • Studium DNA-vazebné domény transkripčního faktoru FOXO4
  • Mechanismus regulace Ask kinas
  • Interakce cytoplasmatických domén TRP kanálů

Aktuální projekty

Kalmodulin a S100A1 interagují s N-koncem kanálu TRPM3

TRPM3 patří do TRP rodiny kationtově-propustných iontových kanálů účastnících se mnoha důležitých biologických funkcí. Identifikovali jsme několik pozitivně nabitých zbytků, které mají zásadní vliv na vazbu kalmodulinu a proteinu S100A1.  Více

Úspěchy

Publikace

Kacířová, Miroslava - Košek, Dalibor - Kádek, Alan - Man, Petr - Večeř, J. - Herman, P. - Obšilová, Veronika - Obšil, Tomáš . Structural Characterization of Phosducin and Its Complex with the 14-3-3 Protein . Journal of Biological Chemistry. 2015, Vol. 290, 26, p. 16246-16260 . IF = 4.573 [ASEP] [ doi ]
Gryčová, Lenka - Holendová, Blanka - Lánský, Zdeněk - Bumba, Ladislav - Jirků, Michaela - Boušová, Kristýna - Teisinger, Jan . Ca2+ Binding Protein S100A1 Competes with Calmodulin and PIP2 for Binding Site on the C-Terminus of the TPRV1 Receptor . ACS Chemical Neuroscience. 2015, Vol. 6, 3, p. 386-392 . IF = 4.362 [ASEP] [ doi ]
Boušová, Kristýna - Jirků, Michaela - Bumba, Ladislav - Bednárová, Lucie - Šulc, Miroslav - Franěk, M. - Vyklický ml., Ladislav - Vondrášek, Jiří - Teisinger, Jan . PIP2 and PIP3 interact with N-terminus region of TRPM4 channel . Biophysical Chemistry. 2015, Vol. 205, Oct 2015, p. 24-32 . IF = 1.986 [ASEP] [ doi ]
Obšilová, Veronika - Kopecká, Miroslava - Košek, Dalibor - Kacířová, M. - Kylarová, Salome - Řežábková, L. - Obšil, T. Mechanisms of the 14-3-3 protein function: regulation of protein function through conformational modulation . Physiological Research 2014, roč. 63, suppl.1, s155-s164. ISSN 0862-8408. IF = 1.293 [ASEP]
Košek, Dalibor - Kylarová, Salome - Pšenáková, Katarína - Řežábková, L. - Herman, P. - Večeř, J. - Obšilová, Veronika - Obšil, T. Biophysical and Structural Characterization of the Thioredoxin-binding Domain of Protein Kinase ASK1 and Its Interaction with Reduced Thioredoxin . Journal of Biological Chemistry 2014, roč. 289, 35, p. 24463-24474. ISSN 0021-9258. IF = 4.573 [ASEP] [ doi ]
Kopecká, Miroslava - Košek, Dalibor - Kukačka, Zdeněk - Řežábková, Lenka - Man, Petr - Novák, Petr - Obšil, T. - Obšilová, Veronika . Role of the EF-hand-like Motif in the 14-3-3 Protein- mediated Activation of Yeast Neutral Trehalase Nth1 . Journal of Biological Chemistry 2014, roč. 289, 20, p. 13948-13961. ISSN 0021-9258. IF = 4.573 [ASEP] [ doi ]
Wald, Tomáš - Osičková, Adriana - Šulc, Miroslav - Benada, Oldřich - Semerádtová, A. - Řežábková, Lenka - Veverka, Václav - Bednárová, Lucie - Malý, J. - Macek, Pavel - Šebo, Peter - Slabý, Ivan - Vondrášek, Jiří - Osička, Radim . Intrinsically Disordered Enamel Matrix Protein Ameloblastin Forms Ribbon-like Supramolecular Structures via an N-terminal Segment Encoded by Exon 5 . Journal of Biological Chemistry, 2013, Vol. 288, 31, p. 22333-22345 . IF = 4.651 [ASEP] [ doi ]
Vácha, P. - Zusková, Iva - Bumba, Ladislav - Večeř, J. - Obšilová, Veronika - Obšil, T. Detailed kinetic analysis of the interaction between the FOXO4–DNA-binding domain and DNA . Biophysical Chemistry, 2013, Vol. 184, DEC 31, p. 68-78 . IF = 2.283 [ASEP] [ doi ]
Macáková, Eva - Kopecká, Miroslava - Kukačka, Zdeněk - Veisová, Dana - Novák, Petr - Man, Petr - Obšil, T. - Obšilová, Veronika . Structural basis of the 14-3-3 protein-dependent activation of yeast neutral trehalase Nth1 . Biochimica et Biophysica Acta. General Subjects, 2013, Vol. 1830, 10, p. 4491-4499 . IF = 3.848 [ASEP] [ doi ]
Janoušková, Hana - Ray, A.M. - Noulet, F. - Lelong-Rebel, I. - Choulier, L. - Schaffner, F. - Lehmann, M. - Martin, S. - Teisinger, Jan - Dontenwill, M. Activation of p53 pathway by Nutlin-3a inhibits the expression of the therapeutic target alpha 5 integrin in colon cancer cells . Cancer letters, 2013, Vol. 336, 2, p. 307-318 . IF = 4.258 [ASEP] [ doi ]

Fotogalerie oddělení

Celá fotogalerie

Kontakty

Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
Oddělení proteinových struktur

Vídeňská 1083
14220 Praha 4
tel. +420 241 062 191
fax. +420 241 062 477
 

veronika.obsilova@fgu.cas.cz

Lidé

RNDr. Veronika Obšilová, Ph.D.
vedoucí oddělení

Prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.
vědecký pracovník

RNDr. Miroslava Alblová (roz. Kopecká), Ph.D.
vědecký pracovník

Ing. Jan Teisinger, CSc.
vědecký pracovník

Ing. Michaela Jirků
postgraduální student
Mgr. Kristýna Boušová
postgraduální student
Mgr. Salome Kylarová
postgraduální student
Mgr. Dana Kalábová (roz. Žáková) 
postgraduální student

Mgr. Miroslava Kacířová
postgraduální student

Mgr. Olívia Petrvalská
postgraduální student
Mgr. Katarína Pšenáková
postgraduální student

Bc. Aneta Šmídová
pregraduální student
Bc. Kateřina Jarosilová
pregraduální student
Simona Krausová
technický pracovník

 

 

© 2014 Fyziologický ústav AV ČR