Intranet English

Biomatematika

Biomatematika Snímek embryonálního myšího srdce z optického tomografu, model kapilár složený z více konfokálních snímků potkaního mozku a snímek mozku bažanta pořízený magnetickou rezonancí.

Zabýváme se hlavně pořizováním a měřením 3D mikroskopických i makroskopických obrazů biologických objektů – buněčné ultrastruktury, buněk, tkání nebo pletiv, orgánů i celých organismů. Vyvíjíme nové metody hodnocení včetně počítačové implementace.

 

Hlavní směry našeho výzkumu jsou:

  • trojrozměrná analýza obrazu, stereologie, prostorová statistika, trojrozměrné rekonstrukce
  • stereologické metody 1. a 2. řádu: studium rozptylu metod, vývoj nových metod a softwaru, konzultace, školení
  • 3D mikroskopie biologických vzorků:
  1. konfokální a dvoufotonová mikroskopie: analýza dat, aplikace moderních fluorescenčních metod a metod dvoufotonové mikroskopie, kalibrační měření, dekonvoluce, obsluha a údržba dvoufotonového mikroskopu Leica SP AOBS a konfokálních mikroskopů Leica SPE, konzultace, školení
  2. optická projekční tomografie, fluorescenční a transmisní snímání submakroskopických vzorků, projasňování vzorků

Studujeme například anatomii ptačího mozku, převodní systémy srdce, kapiláry lidské placenty, potkaního svalu a mozku, vnitřní stavbu jehlic smrku a buněčné komponenty, např. jaderné struktury a endoplazmatické retikulum.

 

Laboratoř biochemie membránových receptorů

Aktuální projekty

Úspěchy

Publikace

Vošahlíková, Miroslava - Svoboda, Petr . Lithium - therapeutic tool endowed with multiple beneficiary effects caused by multiple mechanisms . Acta Neurobiologiae Experimentalis. 2016, roč. 76, 1, p. 1-19 . IF = 1.708 [ASEP]
Tonar, Z. - Tomášek, P. - Loskot, P. - Janáček, Jiří - Králíčková, M. - Witter, K. Vasa vasorum in the tunica media and tunica adventitia of the porcine aorta . Annals of Anatomy-Anatomischer Anzeiger. 2016, roč. 205, 2016, p. 22-36 . IF = 1.308 [ASEP] [ doi ]
Sládková, J. - Spáčilová, J. - Čapek, Martin - Tesařová, M. - Hansíková, H. - Honzík, T. - Martínek, J. - Zámečník, J. - Kostková, O. - Zeman, J. Analysis of Mitochondrial Network Morphology in Cultured Myoblasts from Patients with Mitochondrial Disorders . Ultrastructural Pathology. 2015, Vol. 39, 5, p. 340-350 . IF = 0.828 [ASEP] [ doi ]
Jirák, D. - Janáček, Jiří - Kear, B. P. A combined MR and CT study for precise quantitative analysis of the avian brain . Scientific Reports. 2015, Vol. 5, Oct 30, p. 16002 . IF = 5.228 [ASEP] [ doi ]
Roubalová, Lenka - Vošahlíková, Miroslava - Brejchová, Jana - Sýkora, Jan - Rudajev, Vladimír - Svoboda, Petr . High Efficacy but Low Potency of delta-Opioid Receptor-G Protein Coupling in Brij-58-Treated, Low-Density Plasma Membrane Fragments . PLoS ONE. 2015, Vol. 10, 8, e0135664 . IF = 3.057 [ASEP] [ doi ]

Fotogalerie oddělení

Kontakty

Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
Oddělení biomatematiky

Vídeňská 1083
14220 Praha 4
tel. +420 241 062 768
 

jiri.janacek@fgu.cas.cz

Lidé

  RNDr. Jiří Janáček, PhD.
vedoucí oddělení
  RNDr. Lucie Kubínová, CSc.
zástupce vedoucího oddělení
  Ing. Martin Čapek, PhD.
vědecký pracovník
  RNDr. Radek Pelc, DPhil.(Oxon)
vědecký pracovník
  RNDr. Barbora Radochová, PhD.
vědecký pracovník
  Alexandr Čerňavský, PhD.
postdoktorand
  Mgr. Daniel Hadraba
postgraduální student
  MUDr. Petr Karen, CSc.
vědecký pracovník
  Ing. Kateřina Špačková
projektový manažer
  Alena Dědičová
technický pracovník
 

 

Laboratoř biochemie membránových receptorů

  Doc. RNDr. Petr Svoboda, DrSc.
vědecký pracovník
  RNDr. Lenka Roubalová, PhD.
vědecký pracovník
  RNDr. Hana Ujčíková, PhD.
vědecký pracovník
  Ing. Miroslava Vošahlíková, PhD.
vědecký pracovník
  Mgr. Jana Brejchová, PhD.
vědecký pracovník
  Ing. Kateřina Stolařová
postgraduální student
  Mgr. Martina Hloušková
postgraduální student
  Mgr. Kristina Cechová
postgraduální student
  Mgr. Michaela Czerneková
postgraduální student
   
   

© 2014 Fyziologický ústav AV ČR