Snímek embryonálního myšího srdce z optického tomografu, model kapilár složený z více konfokálních snímků potkaního mozku a snímek mozku bažanta pořízený magnetickou rezonancí.
Zabýváme se hlavně pořizováním a měřením 3D mikroskopických i makroskopických obrazů biologických objektů – buněčné ultrastruktury, buněk, tkání nebo pletiv, orgánů i celých organismů. Vyvíjíme nové metody hodnocení včetně počítačové implementace.
Hlavní směry našeho výzkumu jsou:
- trojrozměrná analýza obrazu, stereologie, prostorová statistika, trojrozměrné rekonstrukce
- stereologické metody 1. a 2. řádu: studium rozptylu metod, vývoj nových metod a softwaru, konzultace, školení
- 3D mikroskopie biologických vzorků:
- konfokální a dvoufotonová mikroskopie: analýza dat, aplikace moderních fluorescenčních metod a metod dvoufotonové mikroskopie, kalibrační měření, dekonvoluce, obsluha a údržba dvoufotonového mikroskopu Leica SP AOBS a konfokálních mikroskopů Leica SPE, konzultace, školení
- optická projekční tomografie, fluorescenční a transmisní snímání submakroskopických vzorků, projasňování vzorků
Studujeme například anatomii ptačího mozku, převodní systémy srdce, kapiláry lidské placenty, potkaního svalu a mozku, vnitřní stavbu jehlic smrku a buněčné komponenty, např. jaderné struktury a endoplazmatické retikulum.
Aktuální projekty
K analýze převodního systému srdečního a jeho vývoje u myší používáme 3D zobrazovací metody a optické mapování.
Více
Pomocí zobrazení s vysokým rozlišením a geometrické morfometrie studujeme vztah anatomie mozku a letových schopností ptáků, abychom umožnili interpretaci paleontologických nálezů neurokranií theropodních dinosaurů.
Více
Úspěchy
Publikace
Vošahlíková, Miroslava - Svoboda, Petr
.
Lithium - therapeutic tool endowed with multiple beneficiary effects caused by multiple mechanisms
.
Acta Neurobiologiae Experimentalis. 2016, roč. 76, 1, p. 1-19
.
IF = 1.708
[ASEP]
Tonar, Z. - Tomášek, P. - Loskot, P. - Janáček, Jiří - Králíčková, M. - Witter, K.
Vasa vasorum in the tunica media and tunica adventitia of the porcine aorta
.
Annals of Anatomy-Anatomischer Anzeiger. 2016, roč. 205, 2016, p. 22-36
.
IF = 1.308
[ASEP]
[
doi
]
Sládková, J. - Spáčilová, J. - Čapek, Martin - Tesařová, M. - Hansíková, H. - Honzík, T. - Martínek, J. - Zámečník, J. - Kostková, O. - Zeman, J.
Analysis of Mitochondrial Network Morphology in Cultured Myoblasts from Patients with Mitochondrial Disorders
.
Ultrastructural Pathology. 2015, Vol. 39, 5, p. 340-350
.
IF = 0.828
[ASEP]
[
doi
]
Jirák, D. - Janáček, Jiří - Kear, B. P.
A combined MR and CT study for precise quantitative analysis of the avian brain
.
Scientific Reports. 2015, Vol. 5, Oct 30, p. 16002
.
IF = 5.228
[ASEP]
[
doi
]
Roubalová, Lenka - Vošahlíková, Miroslava - Brejchová, Jana - Sýkora, Jan - Rudajev, Vladimír - Svoboda, Petr
.
High Efficacy but Low Potency of delta-Opioid Receptor-G Protein Coupling in Brij-58-Treated, Low-Density Plasma Membrane Fragments
.
PLoS ONE. 2015, Vol. 10, 8, e0135664
.
IF = 3.057
[ASEP]
[
doi
]
Fernandez, V. - Buffetaut, E. - Suteethorn, V. - Rage, J. C. - Tafforeau, P. - Kundrát, Martin
.
Evidence of Egg Diversity in Squamate Evolution from Cretaceous Anguimorph Embryos
.
PLoS ONE. 2015, Vol. 10, 7, e0128610
.
IF = 3.057
[ASEP]
[
doi
]
Wilhelm, Jiří - Ivica, Josko - Veselská, Zdeňka - Uhlík, Jiří - Vajner, Luděk
.
Changes in the composition of fatty acids and lipofuscin-like pigments during development of rat heart
.
Physiological Research. 2015, Vol. 64, 5, p. 643-651
.
IF = 1.618
[ASEP]
Michálek, Jan
.
Total Variation-Based Reduction of Streak Artifacts, Ring Artifacts and Noise in 3D Reconstruction from Optical Projection Tomography
.
Microscopy and Microanalysis. 2015, Vol. 21, 6, p. 1602-1615
.
IF = 1.73
[ASEP]
[
doi
]
Kubínová, Lucie - Janáček, Jiří
.
Confocal stereology: an efficient tool for measurement of microscopic structures
.
Cell and Tissue Research. 2015, Vol. 360, 1, p. 13-28
.
IF = 2.948
[ASEP]
[
doi
]
Brejchová, Jana - Sýkora, Jan - Ostašov, Pavel - Merta, Ladislav - Roubalová, Lenka - Janáček, Jiří - Hof, Martin - Svoboda, Petr
.
TRH-receptor mobility and function in intact and cholesterol-depleted plasma membrane of HEK293 cells stably expressing TRH-R-eGFP
.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. 2015, Vol. 1848, 3, p. 781-796
.
IF = 3.687
[ASEP]
[
doi
]
Zobrazit více
A: Laserový konfokální mikroskop Leica SPE s jednofotonovou excitací. B: Laserový konfokální mikroskop Leica SP2 AOBS MP s jedno- i dvoufotonovou excitací.
