Molekulární charakterizace patogenu B. graminis a studium jeho interakcí s obilovinami

Vedoucí práce: Mgr. Miroslav Valárik, Ph.D.

tel.: 585 238 714

email.: valarikueb [dot] cas [dot] cz

Obiloviny jsou jedením z hlavních potravinových zdrojů lidstva, avšak jejich výnos je ohrožován patogeny a nemocemi. B. garminis je patogen způsobující nemoc padlí travní a způsobuje až 40 % ztráty na výnosu.

Předpokládaná pracovní náplň:

• Cílem práce bude molekulární charakterizace patogenu a jeho izolátů pomocí identifikace polymorfních molekulárních markerů.

• Bude studována asociace markerů s virulencí a rezistencí.

• Práce bude zahrnovat bioinformatickou analýzu dostupných sekvencí, práce s databázemi, odvozování DNA markerů, sekvencování a anýzu dat, extrakci DNA a optimalizace PCR markerů.

• Projekt je řešen ve spolupráci s laboratořemi v České republice a Evropě a je podporován MŠMT grantem LD14105.