ÚvodPh.D. studium na ÚOCHBArchiv - 2015Organická chemie

Organická chemie

Školitel Prof. Ing. Michal Hocek, CSc. DSc.
Skupina

Michal Hocek

Téma Modifikace DNA komplexy přechodných kovů a vývoj molekulárních nůžek pro genovou terapii
Fakulta FCHT / FPBT VŠCHT, PřF UK
Anotace

Budou připravovány oligonukleotidy nesoucí komplexy přechodných kovů (které umí štěpit fosfodiesterovou vazbu DNA) polymerasovou inkorporací modifikovaných nukleosid trifosfátů nebo chemickou syntézou. Poté bude studováno specifické štěpení dsDNA těmito ON sondami při tvorbě triplexů a studováno jejich potenciální využití jako molekulárních nůžek v genové terapii a genové chirurgii (opravy poškozených genů). Část práce bude prováděna na spolupracujícím pracovišti DCU Dublin u Dr. A. Kelletta. Projekt je financován z ITN grantu EU (projekt ClickGene) a pravidla umožňují účast na tomto projektu pouze pro cizince (kterí nežijí v ČR déle nez 12 měsíců z posledních 5 let).

Klíčové citace:
1. Vrábel, M.; Horáková, P.; Pivoňková, H.; Kalachová, L.; Černocká, H.; Cahová, H.; Pohl, R.; Šebest, P.; Havran, L.; Hocek, M.; Fojta, M. "Base-modified DNA labeled by [Ru (bpy)3]2+ and [Os(bpy)3]2+ complexes: construction by polymerase incorporation of modified nucleoside triphosphates, electrochemical and luminescent properties, and applications" Chem. Eur. J. 2009, 15, 1144-1154.
2. Vaníková, Z.; Hocek, M. "Polymerase Synthesis of Photocaged DNA Resistant against Cleavage by Restriction Endonucleases" Angew. Chem. Int. Ed. 2014, 53, 6734-6737.