| Anotace |
Budou studovány polymerasami katalyzované syntézy oligonukleotidů a nukleových kyselin (DNA nebo RNA) modifikovaných na bázi pomocí inkorporací modifikovaných nukleosid trifosfátů (NTP). Výchozí NTP budou připravovány vodnými cross-coupling reakcemi. Modifikace na bázi budou zaměřeny na chemicky nebo fotochemicky přepínatelné či aktivovatelné reaktivní skupiny. Rovněž budou studovány další post-syntetické chemické modifikace funkcionalizovaných nukleových kyselin (včetně biokonjugací) a chemické nebo fotochemické přepínání či spouštění reaktivity či cross-linkování s proteiny.
Klíčové citace:
1. Raindlová, V.; Pohl, R.; Šanda, M.; Hocek, M. "Direct polymerase synthesis of reactive aldehyde-functionalized DNA and its conjugation and staining with hydrazines" Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 1064-1066.
2. Macíčková-Cahová, H.; Hocek, M. " Cleavage of adenine-modified functionalized DNA by type II restriction endonucleases" Nucleic Acids Res. 2009, 37, 7612-7622.
3. Cahová, H.; Havran, L.; Brázdilová, P.; Pivoňková, H.; Pohl, R.; Fojta, M.; Hocek, M. "Aminophenyl- and Nitrophenyl-Labeled Nucleoside Triphosphates. Synthesis, Enzymatic Incorporation and Electrochemical Detection" Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 2059-2062.
4. Kielkowski, P.; Macíčková-Cahová, H.; Pohl, R.; Hocek, M. "Transient and switchable (triethylsilyl)ethynyl protection of DNA against cleavage by restriction endonucleases" Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 8727-8730.
|
