Organic Chemistry

Projekt je zaměřen na studium DNA a RNA oligonukleotidů s internukleotidovou vazbou s vynucenou konformací, která je důsledkem stereoizomerie nebo stericky částečně bráněné rotace kolem jednoduché vazby. Různé typy rigidizovaných vazeb mají za následek vznik entropicky výhodnějších preorganizovaných konformací cukr-fosfátové páteře v DNA a RNA oligonukleotidech, které mohou zásadním způsobem ovlivnit vzájemné interakce oligonukleotidů a interakce s proteiny. Studium vlastností různých typů modifikované cukr-fosfátové páteře v DNA nebo RNA oligonukleotidech pokročilými fyzikálně-chemickými a teoretickými metodami by umožnilo vysvětlit, na molekulární úrovni, chování těcho modifikací v relevantních biologických experimentech. Přínosem projektu bude vypracování nových syntetických postupů v oblasti chemie fosfonových kyselin a rozšíření poznatků o vztazích mezi strukturou a vlastnostmi modifikované cukr-fosfátové páteře. Dále předpokládáme využití DNA a RNA oligonukleotidů s preorganizovanou strukturou v diagnostice a v neposlední řadě jako možných kandidátů pro genovou terapii.