Sekce Optika se zaměřuje především - na výzkum fyzikálních vlastností klasických a kvantových aspektů šíření optického záření - na výzkum funkčních optických struktur, materiálů a technologií.
Ve směru klasické optiky je řešena problematika - interferometrie - holografie - koherenčního a statistického chování světelných svazků - fraktálové optiky. Současně jsou rozvíjeny nové moderní přístupy zaměřené na netradiční aplikace zahrnující rentgenovou optiku pro synchrotronní záření, optické systémy a zařízení pro vědeckou sféru, medicínu apod.
V oblasti kvantové optiky je výzkum zaměřen - na různé typy zdrojů kvantově korelovaných fotonových párů - na experimentální charakterizaci překryvů, ”fidelity” a “purity” kvantových stavů.
Současně je řešena problematika detekce a charakterizace slabého a ultraslabého záření až do úrovně jednoho fotonu a problematika kvantové teleportace a klonování.
Ve směru funkčních optických struktur a materiálů je realizován - výzkum vybraných dopovaných oxidů a jejich povrchů - vícevrstvých systémů - nanostrukturovaných keramik a krystalů.
Pozornost je soustředěna na charakterizaci uvedených struktur pomocí optických a nanomechanických metod.
Významnou součástí je navazující výzkum a vývoj původních technologií přípravy funkčních optických struktur a materiálů pomocí depozičních metod nízkoteplotního plazmatu a pulzní laserové ablace.