Tomáš Martan, Ph.D.

Professional activities:

2008: Long-term stay - CiS Institut für Mikrosensorik GmbH
2007: Post-doc, Institute of Photonics and Electronics, Academy of Sciences of the Czech Republic.

Education:

2007: Post-doc, Institute of Photonics and Electronics, Academy of Sciences of the Czech Republic.

2001 - 2006: Czech Technical University in Prague- Faculty of Electrical Engineering, Department of Electromagnetic Field, Branch of study: Radioelectronics, Ph.D. – doctoral thesis: Generation of supercontinuum in nonlinear mcrostructure optical fibre

1994 - 2001: Czech Technical University in Prague- Faculty of Electrical Engineering, Department of Electromagnetic Field, MS degree – diploma thesis: Nonlinear network for generation of solitons

Selected past projects:

Co-principal investigator of the projects:

• FOGS - Fibre Optic Gas Sensing

Řešitel projektů:

• Taperovaná optická vlákna pro lokální detekci fyzikálně-chemických veličin

Member of the projects:

• COST - Novel and Reliable Optical Fibre Sensor Systems for Future Security and Safety Applications (OFSeSa)
• Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
• Ramanovské vláknové zesilovače s časově multiplexovaným čerpáním
• Teoretický a experimentální výzkum kónicky zúžených optických vláken pro senzorové aplikace
• Nelineární jevy v mikrostrukturních optických vláknech a jejich potenciální aplikace v budoucích komunikačních systémech
• Mikrostrukturní vlákna pro optické komunikace a senzory
• Měření amplitudy a fáze optických pulsů kmitočtově rozlišenou metodou s optickou závěrkou a mikrostrukturním optickým vláknem

Publications:

Books:

1. Novotný, K., Martan, T., Šístek, J.: Systémy pro optické komunikace, skriptum, 1. ed., Vydavatelství ČVUT, Praha, 2003, 120 p. ISBN 80-01-02810-0.

Journal papers:

1. T. Martan, J. Aubrecht, O. Podrazký, Vl. Matějec, I. Kašík, Detection of hydrocarbons using suspended core microstructured optical fiber, Sensors and Actuators B: Chemical; Vol. 202 (10/2014) 123–128.
2. I. Kašík, O. Podrazký, J. Mrázek, T. Martan, V. Matějec, K. Hoyerová, M. Kamínek: „In vivo optical detection of pH in microscopic tissue samples of Arabidopsis thaliana“, Materials Science & Engineering C 33 (2013) 4809-4815.
3. J. Pokorný, T. Martan, A. Foletti: “High capacity optical channels for bioinformation transfer: Acupuncture meridians“, Journal of Acupuncture and Meridian Studies 5 (2012) 34-41
4. V. Matějec, M. Jelínek, F. Todorov, M. Chomát, V. Kubeček, D. Berková, T. Martan: „Effect of Sol-gel modifications on characteristics of silica spherical microresonators“, Sensor Letters 9 (2011) 2265-2267 
5. F. Todorov, J. Čtyroký, M. Jelínek, M. Chomát, V. Matějec, V. Kubeček, T. Martan, D. Berková: „Bottle microresonators fabricated by shaping optical fibers with a beam of a CO2 laser“, Sensor Letters 9 (2011) 2279-2282 
6. Kašík, I., Mrázek, J., Martan, T., Pospíšilová, M., Podrazký, O., Matějec, V., Hoyerová, K., Kamínek, M.: "Fiber-optic pH detection in small volumes of biosamples", Analytical and Bioanalytical Chemistry 398 (2010) 1883-1889. 
7. Martan, T., Pospíšilová, M., Aubrecht, J., Mrázek, J., Podrazký, O., Kašík, I., Matějec, V.: "Tapered optical fibres for local pH detection", Journal of Physics (JPCS), Vol. 206, No. 1 (2010) 0120171-0120172. ISSN 1742-6588. 
8. Martan, T., Will, M.: "Miniaturized remission sensor for carbon dioxide detection", Journal of Physics (JPCS), Vol. 206, No. 1, 2010, pp. 0120161-0120161. ISSN 1742-6588. 
9. Martan, T.: "Zúžená optická vlákna", Jemná mechanika a optika, Roč. 55, č.4 (2010), s. 111-114. ISSN 0447-6441 
10. Martan, T., Kanka, J., Kasik, I., Matejec, V.: "Theoretical analysis and preparation of tapered suspended core microstructure fibers", Int. J. Optomechatronics 3 (3) (2009) 233-249. 
11. Martan, T.: "Historie solitonových vln a jejich využití v optické komunikační technice", Dějiny věd a techniky, DVT 37, č.1 (2004), s. 1-22.

Conference papers:

1. T. Martan , J. Mrázek, S. Görlandt, Fiber-optic transmission system for CO2 detection, Proceedings of EUROPT(R)ODE XII, Conference on Optical Chemical Sensors & Biosensors, GS-15, (April, 2014), Athens, Greece.
2. T. Martan, J. Aubrecht, O. Podrazky, Fiber-optic detection of UV radiation, Conference on Optical Chemical Sensors & Biosensors, OS-6, (April, 2014), Athens, Greece.
3. M. Miler, T. Martan: „Axial intensity distribution of converging spherical wave behind an elliptic aperture“, The International Society for Optical Engineering (SPIE) 8074, 2011, 807411
4. J. Mrázek, I. Kašík, J. Nekola, T. Martan, O. Podrazký, M. Pospíšilová, V. Matějec: „Preparation and characterisation of sensing layers for pH detection in living plant cells“, The International Society for Optical Engineering (SPIE) 8073, 2011, 807318 
5. T. Martan, J. Aubrecht, O. Podrazký, I. Kašík, V. Matějec, J. Kaňka: „Microstructure optical fibres for detection of gaseous analytes“, The International Society for Optical Engineering (SPIE) 8073, 2011, 80731O 
6. M. Pospíšilová, J. Aubrecht, T. Martan, J. Mrázek, I. Kašík, V. Matějec: „Dependence of detected intensity of fluorescence of dye on optical fiber tapered tip diameter“, The International Society for Optical Engineering (SPIE) 8073, 2011, 80731C 
7. V. Matějec, F. Todorov, M. Jelínek, M. Fibrich, M. Chomát, V. Kubeček, I. Bartoň, T. Martan, D. Berková: „Preparation of spherical optical microresonators and their resonance spectra in air and gaseous acetone“, Photonics, Devices and Systems V (SPIE) 8306, 2011, 830605 
8. F. Todorov, J. Čtyroký, V. Matějec, M. Chomát, D. Berková, I. Kašík, T. Martan, V. Kubeček, M. Jelínek, M. Fibrich: „Preparation and characterization of bottle optical microresonators with circular and hexagonal cross-sections“, Photonics, Devices and Systems V (SPIE) 8306, 2011, 83060Q 
9. Martan, T., Will, M.: "Planar Sensor for Detection of Carbon Dioxide", EUROPT(R)ODE X - Conference on Optical Chemical Sensors and Biosensors 2010, p.170 (P112). ISBN 978-80-86269-20-7. 
10. Will, M., Martan, T., Broderson O.: "Silicon Microsensor as Integrated readout Platform for Colorimetric and Fluorescence Based Opto-Chemical Transducers", EUROPT(R)ODE X - Conference on Optical Chemical Sensors and Biosensors 2010, p.89 (P031). ISBN 978-80-86269-20-7. 
11. Kašík, I., Martan, T., Pospíšilová, M., Podrazký, O., Mrázek, J., Matějec, Vl.: "PH Detection of Plant Cell Cultures by Using Tapered Fiber Probes", EUROPT(R)ODE X - Conference on Optical Chemical Sensors and Biosensors 2010, p. 77. ISBN 978-80-86269-20-7. 
12. Martan, T., Podrazký, O., Aubrecht, J., Kašík, I., Mrázek, J., Pospíšilová, M., Matějec, V. Kaňka, J.: "Tapered Steering-Wheel Microstructured Optical Fibre for Methane Detection", EUROPT(R)ODE X - Conference on Optical Chemical Sensors and Biosensors 2010, p. 76. ISBN 978-80-86269-20-7. 
13. Aubrecht, J. , Martan, T., Podrazký, O., Matějec, V., Kaňka, J.: "Speciální mikrostrukturní optická vlákna pro detekci plynných látek", OPTICKÉ KOMINIKACE 2010, Praha (2010). ISBN 978-80-86742-29-8. 
14. Kašík, I., Martan, T., Podrazký, O., Mrázek, J., Pospíšilová, M., Matějec, V: "Local Detection of pH Using Fibre Tapers", Optics+Optoelectronics Conference SPIE 7356, 20-23 April 2009, Prague (poster). 
15. Kašík, I., Martan, T., Podrazký, O., Mrázek, J., Pospíšilová, M., Matějec, V: "Local Detection of pH Using Fibre Tapers", Optics+Optoelectronics Conference SPIE 7356, 20-23 April 2009, Prague, 7356-70. 
16. Martan, T., Pospíšilová, M., Aubrecht, J., Mrázek, J., Podrazký, O., Kašík, I., Matějec, V, Kaňka, J.: "Tapered Optical Fibres for Local pH Detection", Workshop on Information Optics, Paris, July 20-24, 2009 (oral). 
17. Martan, T., Will, M.: "Miniaturized remission sensor for carbon dioxide detection", Workshop on Information Optics, Paris, July 20-24, 2009 (poster). 
18. Martan, T., Kašík, I., Podrazký, O., Mrázek, J., Pospíšilová, M., Aubrecht, J., Matějec, V., Kaňka, J.: "Local Detection of pH Using Optical Fibre Probes", Proc. 6th Journees Maghreb-Europe, Les Materiaux et Leurs Applications aux Dispositifs Capteurs (MADICA), Enset-Rabat, 30.10.2008- 1.11.2008 A53-1 – A53-2 (oral) 
19. Martan, T., Will, M., Müller, R., Brodersen, O., Mohr, G.: "Optical Sensor for Concentration Measurement of Carbon Dioxide Based on Sensitive Polymer Layer", 6th Journees Maghreb-Europe, Les Materiaux et Leurs Applications aux Dispositifs Capteurs (MADICA), Enset-Rabat, Morocco 30.10.2008- 1.11.2008, PI-34-1 – PI-34-2 (poster) 
20. Martan, T., Kaňka, J., Kašík, I., Matějec, V.: "Tapered optical fibres for sensing", Proc. SPIE 7138, Photonics Prague 2008, Prague, August 2008, 71380Z-1 – 71380Z-6. 
21. Will, M., Martan, T., Müller, R., Brodersen, O., Mohr, G.: "Optical Sensor Based on Sensitive Polymer Layer", Proc. SPIE 7138, Photonics Prague 2008, Prague, August 2008, 7138 0A-1 – 7138 0A-7. 
22. Martan, T., Podrazký, O., Kašík, I., Pospíšilová, M., Matějec, V. Kaňka, J.: "Fibre–Optic Local Detection of pH", EUROPT(R)ODE IX - Conference on Optical Chemical Sensors and Biosensors 2008, Dublin, 30.3.2008-2.4.2008, p. 276 (poster). 
23. Podrazký, O., Mrázek, J., Seidl, M., Kašík, I., Tobiška, P., Matějec, V., Martan, T., Aubrecht, J.: "Optical principle of pH measurement for detection of auxin flow through cellular membrane", Proc. SPIE 6585 Optical Sensing Technology and Applications, Prague, April 2007, 65850YI-6580Y. 7. 
24. Martan, T., Honzátko, P., Kaňka, J., Novotný, K. "Workplace for manufacturing devices based on optical fiber tapers", Proc. SPIE 15th Czech-Slovak-Polish Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics, Vol. 6609 (2007),  66090K.1-66090K.5. ISBN 978-0-8194-6748-5. 
25. Martan, T., Novotný, K., Honzátko, P., Kaňka, J.: "Apparatus for Tapering Optical Fibers", Applied Electronics 2005, 402-403. ISBN 80-7043-369-8. 
26. Peterka, P., Dymák P., Honzátko, P., Matějec, V., Kaňka J., Martan, T., Vraný, B., Káčik, D., W. Pardem, W., Lyytikainen, K.: "Měření chromatické disperze a dvojlomu mikrostrukturních optických vláken", OPTICKÉ KOMINIKACE 2004, 137–143, ISBN 80-86742-06-7. 
27. Martan, T.: "Measurement of Nonlinear Interaction of Voltage KdV Solitons", Poster 2003, CTU Prague, p. EI21. 
28. Kaňka, J., Honzátko, P., Matějec, V. Kašík, I., Martan, T.: "Mikrostrukturní optická vlákna", OPTICKÉ KOMINIKACE 2002, Tech-Market 2002, 41-50. ISBN 80-86114-48-1.