Zaměstnanci

projekty

Johnson Pokorná Martina, RNDr., PhD.


Funkce:
Profesní zaměření:postdoktorand
E-mail:
Pevná linka: +420 315 639 557
Mobil:
Oddělení: Laboratoř genetiky ryb
Budova: Liběchov/
Linka: 257
Web:

Strukturovaný životopis:

2011

postdoktorand; Laboratoř genetiky ryb  ÚŽFG AV ČR, v.v.i., Liběchov

2011

postdoktorand; Katedra ekologie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze

2007 – 2011

PhD.; Katedra zoologie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze a Laboratoř genetiky ryb, ÚŽFG AV ČR, v.v.i, disertační práce s názvem „Evoluce způsobů určování pohlaví a genomů u šupinatých plazů (Reptilia: Squamata)”

2009

RNDr.;  Katedra zoologie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze

2002 – 2007

Mgr.; obor biologie, zaměření Genetika volně žijících živočichů, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze. Diplomová práce: „Karyotypová evoluce u ještěrů čeledi Eublepharidae, skupiny s různými způsoby determinace pohlaví

1999 – 2006

laboratorní technik; Ústav histologie a embryologie, 1. Lékařská fakulta, Univerzita Karlova v Praze

Specializace:

Hlavním zaměřením našeho výzkumu je studium evoluce mechanismů určování pohlaví; tedy jednoho z nejzákladnějších evolučních procesů, klíčových pro vývoj jednotlivce, stejně jako pro ustanovení vyrovnaného poměru pohlaví v populaci.  Jako modelová skupina pro tento typ výzkumu nám slouží především plazi (Sauropsida), kteří mají velkou variabilitu ve způsobech určování pohlaví. U některých druhů je pohlaví jedince určeno vnějšími podmínkami a pohlavní chromozomy nejsou přítomny, zatímco jiné linie mají dobře diferencované pohlavní chromozomy typu XX/XY či ZZ/ZW. Téma evoluce pohlavně determinačních mechanismů a diferenciace pohlavních chromosomů řešíme s použitím rozličných metod klasické i molekulární cytogenetiky, jako je např. využití fluorescenční in situ hybridizace, laserové mikrodisekce nebo sortování chromosomů na průtokovém cytometru. Podobným přístupem řešíme také otázky evoluce uspořádání genomu napříč fylogenetickým spektrem jednotlivých linií obratlovců.

Zahraniční stáže:

2008, 2009,

2010, 2011

Molecular Cytogenetics Laboratory, Centre for Veterinary Science, Department of Veterinary Medicine, University of Cambridge, Velká Británie (celkem 10 měsíců)

2009

CIBIO – Research Centre in Biodiversity and Genetic Resources, Porto –Vairao, Portugalsko (tři týdny)

2008

Department Systematics and Evolution, Muséum National d’Histoire Naturelle, Paříž, Fracie (dva týdny)

Vědecké spolupráce:

Willem Rens, Malcolm Ferguson-Smith

Department of Veterinary Medicine, University of Cambridge, Velká Británie

Eduard Kejnovský

Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i., Brno

Massimo Giovannoti, Vincenzo Caputo,
Ettore Olmo

Università Politecnica delle Marche, Ancona, Itálie

Vladimir Trifonov

Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Rusko

Karen Ventura

Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazílie

Pedagogická činnost:

Kurz pro magisterské studenty „Evoluce genomu“, Katedra ekologie, PřF UK

Konzultantkou dvou studentek Ph.D. a jedné studentky Bc. studia na Katedře ekologie, PřF UK; v minulosti konzultantkou dvou obhájených bakalářských a dvou obhájených magisterských prací   

Granty:

Minulé i současné: hlavní řešitelka 4 projektů (GAUK, Thermal adaptation in ectotherms - European Science Foundation, Synthesys), člen řešitelského týmu 3 projektů (GAČR, GAUK)

Další kvalifikace:

Osvědčení o odborné způsobilosti k navrhování pokusů a projektů pokusů podle § 15d odst. 3 zákona č. 246/1992 Sb., na ochranu zvířat proti týrání. Evidenční číslo: CZ 02529

Certifikát o absolvovaném školení na operátora fluorescenčního cytometru BD FACS Aria III cell sorter a BD FACS Diva 6.1.3 software

Vybrané publikace:

2014

Johnson Pokorná M, Kratochvíl L (2014) What was the ancestral sex-determining mechanism in amniote vertebrates? Biological Reviews DOI: 10.1111/brv.12156

 

Koubová M, Johnson Pokorná M, Rovatsos M, Farkačová K, Altmanová M, Kratochvíl L (2014) Sex determination in madagascar geckos of the genus Paroedura (Squamata: Gekkonidae): are differentiated sex chromosomes indeed so evolutionary stable? Chromosome Research 22: 441-452

 

Rovatsos M, Altmanová M, Johnson Pokorná M, Kratochvíl L (2014) Novel X-linked genes revealed by qPCR in the Green Anole, Anolis carolinensis. G3: Genes Genomes Genetics 114.014084

http://www.g3journal.org/content/4/11/2107.full.pdf+html

 

Johnson Pokorná M, Rovatsos M, Kratochvíl L (2014) Sex chromosomes and karyotype of the (nearly) mythical creature, the Gila Monster, Heloderma suspectum (Squamata: Helodermatidae). Plos One 9 e104716

http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0104716

 

Pokorná M, Altmanová M, Kratochvíl L (2014) Multiple sex chromosomes in the light of female meiotic drive in amniote vertebrates. Chromosoe Research 22: 35-44

http://link.springer.com/article/10.1007/s10577-014-9403-2#page-1

 

Pokorná M, Rens W, Rovatsos M, Kratochvíl L (2014) A ZZ/ZW sex chromosome system in the Thick-Tailed Gecko (Underwoodisaurus milii; Squamata: Gekkota: Carphodactylidae), a member of the ancient gecko lineage. Cytogenetic and Genome Research 142: 190-196

 

Rovatsos M, Altmanová M, Pokorná M, Kratochvíl L (2014) Conserved sex chromosomes across adaptively radiated Anolis lizards. Evolution 68: 2079-2085

 

Rovatsos M, Pokorná M, Altmanová M, Kratochvíl L (2014) Cretaceous park of sex determination: sex chromosomes are conserved across iguanas. Biology Letters 10: 20131093

2012

Pokorná M, Giovannotti M, Kratochvíl L, Caputo V, Olmo E, Ferguson-Smith MA, Rens W. Conservation of chromosomes syntenic with avian autosomes in squamate reptiles revealed by comparative chromosome painting. Chromosoma 121: 409-418

2011

Pokorná M, Kratochvíl L, Kejnovský E. Microsatellite distribution on sex chromosomes at different stages of heteromorphism and heterochromatinization in two lizard species (Squamata: Eublepharidae: Coleonyx elegans and Lacertidae: Eremias velox). BMC Genetics 12: 91  http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2156-12-90.pdf

2011

Pokorná M, Giovannotti M, Kratochvil L, Kasai F, Trifonov VA, O'Brien PCM, Caputo V, Olmo E, Ferguson-Smith MA, Rens W. Strong conservation of the bird Z chromosome in reptilian genomes is revealed by comparative painting despite 275 My divergence. Chromosoma 120: 455-468

2010

Pokorná M, Rábová M, Ráb P,  Ferguson-Smith MA, Rens W, Kratochvíl L. Differentiation of sex chromosomes and karyotypic evolution in the eye-lid geckos (Squamata: Gekkota: Eublepharidae), a group with different modes of sex determination. Chromosome Research 18: 809–820

2009

Pokorná M, Kratochvíl L. Phylogeny of sex-determining mechanisms in squamate reptiles: Are sex chromosomes an evolutionary trap? Zoological Journal of the Linnean Society 156: 168-183

 

mapy.cz

LIBĚCHOV
PRAHA
BRNO

  Liběchov
Rumburská 89
277 21 Liběchov
tel.: 315 639 532
fax: 315 639 510
Praha
Vídeňská 1083
142 20 Praha 4-Krč
tel.: 267 090 501
fax: 267 090 500
Brno
Veveří 97
602 00 Brno 2
tel.: 532 290 136
fax: 541 212 988
i.zemanova@iach.cz