Organická chemie

Budou připravovány nové nukleotidy, nukleosid trifosfáty a jejich lipofilní maskované profarmaka nesoucí různé fluorescenční značky, které mění vlastnosti v závislosti na okolí. Bude studována jejich enzymová inkorporace do DNA nebo RNA a budou připravovány oligonukleotidové sondy pro detekci interakcí s biomolekulami. U lipofilních profarmak bude studována jejich penetrace do buněk a budou využity pro metabolické značení genomové DNA.


Klíčové citace:
1. Dziuba, D.; Pohl, R.; Hocek, M. "Polymerase synthesis of DNA labelled with benzylidene cyanoacetamide-based fluorescent molecular rotors: fluorescent light-up probes for DNA-binding proteins" Chem. Commun. 2015, 51, 4880-4882.
2. Dziuba, D.; Jurkiewicz, P.; Cebecauer, M.; Hof, M.; Hocek, M. "A Rotational Bodipy-Nucleotide: An Environment-Sensitive Fluorescence-Lifetime Probe for DNA Interactions and Applications in Live-Cell Microscopy" Angew. Chem. Int, Ed. in press. DOI: 10.1002/anie.201507922