Organic Chemistry

Antimikrobiální peptidy (AMP) představují novou skupinu účinných látek proti resistentním patogenům neb tyto zabíjejí bakterie zcela odlišným mechanismem než tradiční antibiotika. Řada nových AMP byla objevena v naší laboratoři. Disertační práce bude zahrnovat izolace nových AMP z  přírodního materiálu a stanovení primární struktury metodami hmotové spektrometrie a Edmanova odbourávání. Podle stanovených sekvencí budou tyto peptidy syntetizovány a chemicky obměňovány s cílem připravit účinnější analoga proti bakteriální infekci. Budou připraveny fluorescenčně značené AMP pro studium interakcí s bakteriálními a eukaryotními buňkami sledované pomocí fluorescenční mikroskopie. Další informace o mechanismu účinku AMP budou získány studiem interakcí nově objevených peptidů s umělými modely biologických membrán. Trojrozměrná struktura AMP bude určována metodami cirkulárního dichroismu a NMR.