Intranet English

Genetika modelových onemocnění

Genetika modelových onemocnění

Metabolický syndrom je definován jako současný výskyt několika rizikových faktorů diabetu 2. typu a kardiovaskulárních chorob; jedná se hlavně o obezitu, inzulinovou rezistenci, vysoké hladiny triglyceridů a LDL cholesterolu a hypertenzi. Tyto rizikové faktory jsou podmíněny mnoha geny s malými účinky a jejich interakcemi s faktory prostředí. Celogenomové asociační studie u velkých souborů pacientů a kontrol, založené na hypotéze „běžné polymorfizmy – běžné choroby“, zatím odhalily jen malou část heritability komplexních patofyziologických znaků.

Statisticky významné varianty jsou typicky asociované s nepatrnou fenotypickou variabilitou bez klinické relevance. Analýzy zvířecích modelů lidských komplexních chorob tak mohou představovat užitečnou alternativu, neboť umožňují kontrolu genetického pozadí a faktorů prostředí a genetické manipulace experimentálních zvířat pro in vivo funkční studie. Spontánně hypertenzní potkani kmene SHR jsou nejčastěji používaným modelem esenciální hypertenze a asociovaných metabolických poruch, typických pro metabolický syndrom. I když se nedá očekávat, že by metabolický syndrom byl podmíněn stejnými geny u potkanů a lidí, je pravděpodobné, že tyto geny budou součástí mezidruhově konzervovaných metabolických drah. Lze tedy předpokládat, že odhalení genů podmiňujících patofyziologické procesy na buněčné úrovni u potkana přispěje k lepšímu pochopení patogeneze a terapie obdobných chorob u lidí.

Výzkum našeho oddělení je zaměřen na tyto projekty:

  • Odhalení genů regulujících hemodynamické a metabolické znaky u kmene SHR.
  • Odhalení nových genů kódujících mitochondriální proteiny a analýza jejich úlohy v patogenezi metabolického syndromu.
  • Vytváření nových zvířecích modelů s využitím vysoce efektivních metod transgeneze a inaktivace genů.
  • Analýza úlohy zánětlivých procesů a oxidačního stresu v patogenezi metabolického syndromu
  • a možnost farmakologických intervencí.

 

Současná grantová podpora.

Aktuální projekty

Vývoj nových technik transgeneze u potkana

Během několika posledních let byly vyvinuty nové efektivní techniky pro transgenezi potkana a pro inaktivaci genů. Naše oddělení se podílelo na optimalizaci transgeneze pomocí transpozonových vektorů Sleeping Beauty. Více

Vazebné a korelační analýzy intermediárních fenotypů u kmene SHR s cílem odhalit kandidátní geny podmiňující patofyziologické znaky

Genetické analýzy komplexních patofyziologických znaků u rekombinantních inbredních (RI) kmenů umožňují využít dostupných genotypů a mnoha intermediárních fenotypů. Tyto intermediární fenotypy jsou jednodušeji geneticky podmíněny a mohou tak být využity pro spojení variability na úrovni DNA s komplexními patofyziologickými znaky. Mezi nejčastěji používané intermediární fenotypy patří profily genové exprese (transkriptom), variabilita v množství proteinů (proteom), metabolitů (metabolom), atd.  Více

Genetické a korelační analýzy mitochondriálního proteomu

Mitochondrie hrají důležitou úlohu v patogenezi řady chorob. Funkce většiny mitochondriálních proteinů není známá. Cílem projektu je nalezení nových mitochondriálních proteinů, jejich funkce a úlohy v patogenezi metabolických poruch u potkana. Více

Publikace

Wang, M. - Sips, P. - Khin, E. - Rotival, M. - Sun, X. - Ahmed, R. - Widjaja, A. A. - Schafer, S. - Yusoff, P. - Choksi, P. K. - Ko, N. S. J. - Singh, M. K. - Epstein, D. - Guan, Y. - Houštěk, Josef - Mráček, Tomáš - Nůsková, Hana - Mikell, B. - Tan, J. - Pesce, F. - Kolář, František - Bottolo, L. - Mancini, M. - Hubner, N. - Pravenec, Michal - Petretto, E. - MacRae, C. - Cook, S. A. Wars2 is a determinant of angiogenesis . Nature Communications. 2016, roč. 7, Jul, p. 12061 . IF = 11.329 [ASEP] [ doi ]
Abdelmagid, N. - Bereczky-Veress, B. - Atanur, S. - Musilová, Alena - Zídek, Václav - Saba, L. - Warnecke, A. - Khademi, M. - Studahl, M. - Aurelius, E. - Hjalmarsson, A. - Garcia-Dias, A. - Denis, C. V. - Bergström, N. - Sköldenberg, B. - Kockum, I. - Aitman, T. - Hübner, N. - Olsson, T. - Pravenec, Michal - Diez, M. Von Willebrand Factor Gene Variants Associate with Herpes simplex Encephalitis . PLoS ONE. 2016, roč. 11, 5, e0155832 . IF = 3.057 [ASEP] [ doi ]
Harrall, K. K. - Kechris, K. J. - Tabakoff, B. - Hoffman, P.L. - Hines, L. M. - Tsukamoto, H. - Pravenec, Michal - Printz, M. - Saba, L. M. Uncovering the liver’s role in immunity through RNA co-expression networks . Mammalian Genome. 2016, roč. 27, 9-10, p. 469-484 . IF = 2.078 [ASEP] [ doi ]
Liška, F. - Peterková, Renata - Peterka, Miroslav - Landa, Vladimír - Zídek, Václav - Mlejnek, Petr - Šilhavý, Jan - Šimáková, Miroslava - Křen, Vladimír - Starker, C.G. - Voytas, D.F. - Izsvák, Z. - Pravenec, Michal . Targeting of the Plzf Gene in the Rat by Transcription Activator-Like Effector Nuclease Results in Caudal Regression Syndrome in Spontaneously Hypertensive Rats . PLoS ONE. 2016, roč. 11, 10, e0164206 . IF = 3.057 [ASEP] [ doi ]
Liška, F. - Chylíková, B. - Janků, M. - Šeda, Ondřej - Vernerová, Z. - Pravenec, Michal - Křen, Vladimír . Splicing mutation in Sbf1 causes nonsyndromic male infertility in the rat . Reproduction. 2016, roč. 152, 3, p. 215-223 . IF = 3.184 [ASEP] [ doi ]

Kontakty

Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
Oddělení genetiky modelových onemocnění

Vídeňská 1083
14220 Praha 4
tel. +420 241 062 297
fax. +420 241 062 488
 

pravenec@fgu.cas.cz

Lidé

Ing. Michal Pravenec, DrSc.
vedoucí oddělení

Ing. Václav Zídek, CSc.

zástupce vedoucího oddělení

Ing. Vladimír Landa, CSc.
vědecký pracovník

Ing. Miroslava Šimáková, PhD.

vědecký pracovník

Ing. Petr Mlejnek, PhD.
vědecký pracovník
Ing. Jan Šilhavý, PhD.
vědecký pracovník
  Ing. Petr Svoboda
postgraduální student
Alena Musilová
technický pracovník

© 2014 Fyziologický ústav AV ČR