Organická chemie

Budou studovány polymerasami katalyzované syntézy oligonukleotidů a nukleových kyselin (DNA nebo RNA) modifikovaných na bázi pomocí inkorporací modifikovaných nukleosid trifosfátů (NTP). Výchozí NTP budou připravovány vodnými cross-coupling reakcemi. Modifikace na bázi budou zahrnovat redox-aktivní skupiny pro elektrochemickou detekci, fluorescenční skupiny a chemicky reaktivní skupiny pro biokonjugace. Rovněž budou studovány další post-syntetické chemické modifikace funkcionalizovaných nukleových kyselin. Potenciální aplikace zahrnují bioanalýzu, diagnostiku a chemickou biologii.

Klíčové citace:

Raindlová, V.; Pohl, R.; Šanda, M.; Hocek, M.:
Direct polymerase synthesis of reactive aldehyde-functionalized DNA and its conjugation and staining with hydrazines.
Angew. Chem. Int. Ed., 2010, in press (DOI: 10.1002/anie.200905556).

Cahová, H.; Havran, L.; Brázdilová, P.; Pivoňková, H.; Pohl, R.; Fojta, M.; Hocek, M.:
Aminophenyl- and Nitrophenyl-Labeled Nucleoside Triphosphates. Synthesis, Enzymatic Incorporation and Electrochemical Detection.
Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 2059-2062.