Evropská federace chemického inženýrství je jedna z nejdůležitějších profesních institucí v oboru chemie. Prof. Jiří Drahoš úspěšně vykonával funkci prezidenta již po jedeno (dvouleté) období. V září roku 2007 byl znovuzvolen jako do funkce prezidenta EFCE na období 2008-2009. Na další období byl zvolen do Výkonné rady  EFCE.