Projekt FZÚ, v.v.i. zajišťuje provoz několika serverů Sun Fire v klastru, jehož současná konfigurace je:

• LUNA 1: Sun Fire X4600 s procesory AMD Opteron, operační systém Linux
• LUNA 3: Sun Fire X4600 s procesory AMD Opteron, operační systém Linux
• APOLLO 1 až 4: Sun Fire V20z s procesory AMD Opteron, operační systém Linux
• APOLLO 7 : Sun Fire V40z s procesory AMD Opteron, operační systém Linux

Popis počítačů je uveden níže.

Systém je možné používat pro zpracování sériových i paralelních programů.

Umožnit akademické obci využívat relativně výkonné výpočetní prostředky, především víceprocesorové systémy s velkou sdílenou pamětí. Servery Sun X4600 mají po 32 CPU a 256 GB paměti!

Přihlášku, stažitelnou ve formátu PDF, pošlete na adresu

Fyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
J. Chudoba
Na Slovance 2
182 21 Praha 8

Uživatelé výpočetního projektu Luna informují provozovatele emailem (chudoba@fzu.cz) o svých publikacích, k jejichž vytvoření přispěly i výpočty na Luně .

Procesory: AMD Opteron 8356 se 4 jádry (architektura AMD64)

Procesory: AMD Opteron 880 (64 bit)  s dvěma jádry (Hypertransportní technologie)

Procesory: AMD Opteron 252 (64 bit)   (Hypertransportní technologie)

Procesor: Intel Xeon s dvěma jádry

Operační systém

Solaris 10 (na Sun Fire V890) a na jednom Sun Fire X4600), Linux RedHat ES 5(na ostatních serverech)

Management zdrojů

Grid N1 Computing

Software package

Sun Studio 12 Compiler Collection, Performance Library

Standardní software

C , C++ , FORTRAN , Java

Překladače Intel

Intel

Překladače PGI (pouze na Apollo 7)

PGI

Software pro ladění výkonu

Performance Analyzer

Software pro paralelizované programy

OpenMP, MPICH

Dále jsou nainstalovány tyto programové produkty:

MAPLE

NAG

GAUSSIAN

CFD-ACE+

Paralelní programy mohou na všech serverech systému Luna využívat rozhraní OpenMP nebo MPI.

OpenMP  je univerzální paralelní programovací model pro víceprocesorové systémy se sdílenou pamětí. Na serverech Luna/Apollo je součástí softwarového prostředí SunStudio12. Podrobný anglický návod k programování v OpenMP na serverech Sun Fire je na této stránce nebo stručněji česky na stránce MFF UK .

Rozhraní MPI je ve verzi 2 na serveru Luna 2 součástí balíku Sun HPC 7.1.; dokumentace je na této stránce.

Na serverech s procesory AMD Opteron se MPI (v implementaci MPICH2) používá takto:

• Program doporučujeme přeložit překladačem mpif77, mpif90 z adresáře /usr/local/mpich2-1.0.7

• Přeložený program lze používat na serverech Luna1, Luna3 a Apollech

• implementace je v adresáři /opt/pgi/linux86-64/7.1/mpi/mpich .

• Dokumentace je na této stránce.

Dále je v adresářích /usr/local/mpich1 instalována volně přístupná verze mpich1.2.7p1 a v adresářích /usr/local/mpich2  volně přístupná verze mpich2-1.0.2p .

Dokumentace je na stránkach  docs.sun.com . Vybraná dokumentace je ve formátu  PDF : 

• FORTRAN Programming Guide

• FORTRAN User's Guide

• FORTRAN LIBRARY Reference

• FORTRAN95 Interval Arithmetic Programming Reference 

• Připojení k  Luna1  -  pouze pomocí  ssh .




• Uživatelské prostředí  na  Luně  je předmětem průběžné aktualizace a optimalizace, a je postupně vytvářeno. Nejsou zatím např. instalovány žádné kvóty na diskový prostor, což klade určité nároky na sebekázeň uživatelů.




• Jako systém dávkových úloh je používán SunGridEngine (SGE).




• Domovské adresáře uživatelů jsou na diskovém poli a jsou zálohovány jednou týdně na disky Luny.

Statistika využití je na adrese  Statistika .

Prosíme uživatele, kteří mají nějaké poznatky týkající se porovnání výkonu  SunFire X4600 a SunFire V40z  s jinými stroji, na nichž už spouštěli své úlohy, aby je před eventuální publikací sdělili  Ing. Petru Ryšavému ( VUMS Computers ), který posoudí objektivitu výsledků a případně pomůže s optimalizací překladu úlohy.

Výkazy Luna, Apollo

Uživatelé