Vedoucí práce: Mgr. Miroslav Valárik, Ph.D.
tel.: 585 238 714
email.: valarikueb [dot] cas [dot] cz
Obiloviny jsou jedením z hlavních potravinových zdrojů lidstva, avšak jejich výnos je ohrožován patogeny a nemocemi. B. garminis je patogen způsobující nemoc padlí travní a způsobuje až 40 % ztráty na výnosu.
Předpokládaná pracovní náplň:
Cílem práce bude molekulární charakterizace patogenu a jeho izolátů pomocí identifikace polymorfních molekulárních markerů.
Bude studována asociace markerů s virulencí a rezistencí.
Práce bude zahrnovat bioinformatickou analýzu dostupných sekvencí, práce s databázemi, odvozování DNA markerů, sekvencování a anýzu dat, extrakci DNA a optimalizace PCR markerů.
Projekt je řešen ve spolupráci s laboratořemi v České republice a Evropě a je podporován MŠMT grantem LD14105.