http://www.biomed.cas.cz/d312/index.php?section=home
Naše skupina se zabývá strukturní biologií (vztahy mezi strukturou a funkcí určitých skupin bílkovin), konkrétně se zaměřujeme na proteiny, které se účastní přenosu signálu v buňce. Mezi metody, které využíváme, patří příprava proteinů a jejich komplexů, základní biofyzikální charakterizace, charakterizace mezimolekulových interakcí a studium struktury a interakčních povrchů. Všechny tyto metody nám umožňují lépe pochopit detaily, jak je regulována aktivita a funkce protein-proteinových komplexů. Zabýváme se především výzkumem v těchto oblastech:
- Strukturní biologie 14-3-3 proteinů a jejich vazebných partnerů
- Mechanismus regulace proteinkinas CaMKK1, CaMKK2 a ASK1
- Studium inhibice proteasy caspasy-2 pomocí proteinu 14-3-3
- Studium DNA-vazebné domény transkripčního faktoru FOXO4
Aktuální projekty
Náš výzkum umožnil strukturní náhled na komplexy ASK1 kinasy s jejími dvěma přirozenými inhibitory: proteinem 14-3-3 a thioredoxinem. Naše data by mohla být důležitá k porozumění procesu inhibice ASK1 stejně tak jako úlohu proteinů 14-3-3 v regulaci ostatních enzymů.
Více
Regulátor G-proteinové signalizace (RGS3) se váže na Gα-GTP komplex a zvyšuje tak jeho vnitřní GTPasovou aktivitu - ukončuje přenos signálu. Fosducin (Pdc) je vysoce konzervovaný fosfoprotein, který hraje důležitou roli v regulaci G-proteinové signalizace, kontroly transkripce a regulaci krevního tlaku. Pdc i RGS3 jsou negativně regulovány fosforylací a vazbou proteinu 14-3-3.
Více
Naše výsledky poskytují strukturní pohled na aktivaci kvasničné neutrální trehalasy Nth1 prostřednictvím proteinů 14-3-3. Naše data by mohla být důležitá k porozumění procesu aktivace Nth1 stejně tak jako úloze proteinů 14-3-3 v regulaci ostatních enzymů.
Více
Úspěchy
Our new paper in JBC: August 2016 Structural Insight into the 14-3-3 Protein-Dependent Inhibition of Protein Kinase ASK1.
Petrvalska O, Kosek D, Kukacka Z, Tosner Z, Man P, Vecer J, Herman P, Obsilova V and Obsil T. J. Biol. Chem. jbc.M116.724310.
First Published on August 11, 2016, doi:10.1074/jbc.M116.724310
Více
Kacirova M, Kosek D, Kadek A, Man P, Vecer J, Herman P, Obsilova V and Obsil T
J. Biol. Chem. jbc.M115.636563. First Published on May 13, 2015, doi:10.1074/jbc.M115.636563
Více
Prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D. byl jmenován profesorem na Přírodovědecké fakultě UK, obor Fyzikální chemie. Profesorská promoce proběhla 18.12.2014.
Více
Více
Kopecka M, Kosek D, Kukacka Z, Rezabkova L, Man P, Novak P, Obsil T, Obsilova V.
J Biol Chem. 2014 May 16;289(20):13948-61.
Více
Zobrazit více
Publikace
Kirubakaran, P. - Pfeiferová, L. - Boušová, Kristýna - Bednárová, L. - Obšilová, Veronika - Vondrášek, J.
Artificial proteins as allosteric modulators of PDZ3 and SH3 in two-domain constructs: A computational characterization of novel chimeric proteins
.
Proteins-Structure, Function and Bioinformatics. 2016, roč. 84, 10, p. 1358-1374
.
IF = 2.397
[ASEP]
[
doi
]
Petrvalská, Olivia - Košek, Dalibor - Kukačka, Zdeněk - Tošner, Z. - Man, Petr - Večeř, J. - Herman, P. - Obšilová, Veronika - Obšil, Tomáš
.
Structural Insight into the 14-3-3 Protein-dependent Inhibition of Protein Kinase ASK1 (Apoptosis Signal-regulating kinase 1)
.
Journal of Biological Chemistry. 2016, roč. 291, 39, p. 20753-20765
.
IF = 4.125
[ASEP]
[
doi
]
Jirků, Michaela - Lánský, Zdeněk - Bednárová, L. - Šulc, Miroslav - Monincová, L. - Majer, P. - Vyklický ml., Ladislav - Vondrášek, J. - Teisinger, Jan - Boušová, Kristýna
.
The characterization of a novel S100A1 binding site in the N-terminus of TRPM1
.
International Journal of Biochemistry and Cell Biology. 2016, roč. 78, Sep 2016, p. 186-193
.
IF = 3.505
[ASEP]
[
doi
]
Kylarová, Salome - Košek, Dalibor - Petrvalská, Olivia - Pšenáková, Katarína - Man, Petr - Večeř, J. - Herman, P. - Obšilová, Veronika - Obšil, Tomáš
.
Cysteine residues mediate high‐affinity binding of thioredoxin to ASK1
.
FEBS Journal. 2016, roč. 283, 20, p. 3821-3838
.
IF = 3.902
[ASEP]
[
doi
]
Jirků, Michaela - Bumba, Ladislav - Bednárová, Lucie - Kubala, M. - Šulc, Miroslav - Franěk, M. - Vyklický ml., Ladislav - Vondrášek, Jiří - Teisinger, Jan - Boušová, Kristýna
.
Characterization of the part of N-terminal PIP2 binding site of the TRPM1 channel
.
Biophysical Chemistry. 2015, Vol. 207, Dec, p. 135-142
.
IF = 2.363
[ASEP]
[
doi
]
Kacířová, Miroslava - Košek, Dalibor - Kádek, Alan - Man, Petr - Večeř, J. - Herman, P. - Obšilová, Veronika - Obšil, Tomáš
.
Structural Characterization of Phosducin and Its Complex with the 14-3-3 Protein
.
Journal of Biological Chemistry. 2015, Vol. 290, 26, p. 16246-16260
.
IF = 4.258
[ASEP]
[
doi
]
Boušová, Kristýna - Jirků, Michaela - Bumba, Ladislav - Bednárová, Lucie - Šulc, Miroslav - Franěk, M. - Vyklický ml., Ladislav - Vondrášek, Jiří - Teisinger, Jan
.
PIP2 and PIP3 interact with N-terminus region of TRPM4 channel
.
Biophysical Chemistry. 2015, Vol. 205, Oct 2015, p. 24-32
.
IF = 2.363
[ASEP]
[
doi
]
Gryčová, Lenka - Holendová, Blanka - Lánský, Zdeněk - Bumba, Ladislav - Jirků, Michaela - Boušová, Kristýna - Teisinger, Jan
.
Ca2+ Binding Protein S100A1 Competes with Calmodulin and PIP2 for Binding Site on the C-Terminus of the TPRV1 Receptor
.
ACS Chemical Neuroscience. 2015, Vol. 6, 3, p. 386-392
.
IF = 4.348
[ASEP]
[
doi
]
Obšilová, Veronika - Kopecká, Miroslava - Košek, Dalibor - Kacířová, M. - Kylarová, Salome - Řežábková, L. - Obšil, T.
Mechanisms of the 14-3-3 protein function: regulation of protein function through conformational modulation
.
Physiological Research 2014, roč. 63, suppl.1, s155-s164. ISSN 0862-8408.
IF = 1.293
[ASEP]
Košek, Dalibor - Kylarová, Salome - Pšenáková, Katarína - Řežábková, L. - Herman, P. - Večeř, J. - Obšilová, Veronika - Obšil, T.
Biophysical and Structural Characterization of the Thioredoxin-binding Domain of Protein Kinase ASK1 and Its Interaction with Reduced Thioredoxin
.
Journal of Biological Chemistry 2014, roč. 289, 35, p. 24463-24474. ISSN 0021-9258.
IF = 4.573
[ASEP]
[
doi
]
Zobrazit více
Superpozice ab inicio molekulární obálky získané ze SAXS měření s teoretickým modelem ASK1-TBD:TRX1 komplexu. Kosek et al. (2014).
A) Identifikace klíčových fosforylačních míst zodpovědných za aktivaci neutrální trehalasy Nth1 proteinem Bmh1. B) Pokles kinetiky výměny vodíku za deuterium indukované vazbou proteinu Bmh1 pro peptid zahrnující vápníkovou doménu, který se nachází na vazebném rozhraní obou proteinů. C) Struktura s nízkým rozlišením komplexu Nth1:Bmh1 získaná z měření maloúhlového rozptylu světla SAXS. Veisova et al. (2012), Macakova et al. (2013), Kopecka et al. (2014).
Protein 14-3-3 interaguje s N- i C-koncovými Gtβγ vazebnými rozhraními fosducinu. Kacirova et al. (2015).
