Intranet English

Metabolomika

Metabolomika

Servisní oddělení zajišťuje metabolomickou analýzu biologických materiálů (především krevního séra a plazmy) metodami kapalinové chromatografie ve spojení s hmotnostní spektrometrií (LC–MS):

  • Kombinovaná necílená a cílená analýza komplexních lipidů
  • Kombinovaná necílená a cílená analýza polárních metabolitů a látek pocházejících z vnějšího prostředí (exposom)
  • Cílená analýza specifických nízkoabundantních lipidů ve spolupráci s Oddělením tukové tkáně

 

Pro kombinované necílené a cílené analýzy je používaná kapalinová chromatografie ve spojení s vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrií (Thermo Q Exactive Plus). Cílená analýza specifických lipidů je prováděna pomocí kapalinové chromatografie ve spojení s analyzátorem typu kvadrupól/lineární iontová past operující v módu monitorování více reakcí (SCIEX QTRAP 5500).

 

Oddělení dále provádí zpracování metabolomických dat pomocí nejmodernějších softwarových programů, vč. identifikace lipidů, polárních metabolitů a dalších detekovaných sloučenin pomocí knihoven MS/MS spekter. Sloučení necílených a cílených metabolomických postupů umožňuje detekci velkého počtu metabolitů a v řadě případů i jejich absolutní kvantifikaci.

 

Získaná data jsou dále zpracována pomocí jednorozměrných nebo vícerozměrných statistických metod.

Kontakty

Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
Oddělení Metabolomiky

Vídeňská 1083
142 20 Praha 4

tel.: +420 241 062 187

fax: +420 241 062 280

 
tomas.cajka@fgu.cas.cz

Lidé

doc. Ing. Tomáš Čajka, Ph.D.
vedoucí oddělení
 

Mgr. Petra Domašinská

odborný pracovník

 

Ing. Veronika Palůchová

odborný pracovník

 

© 2014 Fyziologický ústav AV ČR