Laboratoř je vybavena pro moderní proteomické analýzy: 1D a 2D electroforéza včetně skenerů a odpovídajícího software pro analýzu dat z gelů; nLC spojené s vysokorozlišujícím hmotnsotním spektrometrem (Q-TOF) a nezbytný sftware pro analýzu proteinů (včetně databází a softwaru prohledávajícho databáze).

Specifikace vybavení

• Plošná gelová elektroforéza: SDS-PAGE, IEF, 2D; dokumentace gelů (skenery Pharos FX a GS 800 densitometer) (BioRad)
• MaXis - high-resolution tandem mass spectrometry (Q-TOF) (Bruker Daltonics) s přesností stanovení hmoty 1 ppm a méně a rozlišením 40.000 FWHM
• EASY-nLC - nanoLC system
• Proteomic software (Proteinscape, Mascot) + proteomic databases

Prováděné proteomické analýzy:

• Proteomická analýza tkáně (využívající 1D a 2D elektroforézu ve spojení s nanoLC a MS)
• Cílená analýza proteinů/peptidů (spoty apod.)
• Určení specifických proteinů/peptidů ve vzorcích (tkáních apod.) včetně stanovení změn jejich zastoupení
• Analýza posttraslačních modifikací proteinů/peptidů (např. glykace, deamidace apod.)

Kontakt: prof. Ing. Ivan Mikšík, DrSc., tel: +420 296 433 2534, email: miksik@biomed.cas.cz

web laboratoře: http://proteo.natureblink.com/index.htm