Organická chemie

Budou připravovány nové modifikované nukleosid trifosfáty a studovány jejich polymerasami katalyzované inkorporace do oligonukleotidů, DNA a RNA. Modifikace na bázi budou zahrnovat reaktivní funkční skupiny schopné reagovat s aminokyselinovými postranními řetězci. Budou využity v selekci kovalentních aptamerů – nukleových kyselin schopných specifické vazby a kovalentního cross-linkování s cílovými proteiny.

Klíčové citace:
1. Dadová, J.; Orság, P.; Pohl, R.; Brázdová, M.; Fojta, M.; Hocek, M. "Vinylsulfonamide and acrylamide modification of DNA for cross-linking with proteins" Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 10515-10518.
2. Diafa, S.; Hollenstein, M. " Generation of Aptamers with an Expanded Chemical Repertoire " Molecules, 2015, 20, 16643-16671.