2017

Kolesnikova S., Hubálek M., Bednárová L., Cvačka J., Curtis E.A.:
Multimerization rules for G-quadruplexes.
Nucleic Acids Research 45 (15): 8684-8696, 2017.

Rejšek J., Vrkoslav V., Pokorný V., Přibyl V., Cvačka J.:
Ion Source with Laser Triangulation for Ambient Mass Spectrometry of Nonplanar Samples.
Analytical Chemistry 89 (21): 11452-11459, 2017.

Rajpurohit S., Hanus R., Vrkoslav V., Behrman E.L., Bergland A.O., Petrov D., Cvačka J., Schmidt P.S.:
Adaptive dynamics of cuticular hydrocarbons in Drosophila.
Journal of Evolutionary Biology 30 (1): 66-80, 2017.

Kovaříček P., Vrkoslav V., Plšek J., Bastl Z., Fridrichová M., Drogowska K., Kalbáč M.:
Extended characterization methods for covalent functionalization of graphene on copper.
Carbon 118: 200-207, 2017.

Bojarová P., Chytil P., Mikulová B., Bumba L., Konefal R., Pelantová H., Krejzová J., Slámová K., Petrásková L., Kotrchová L., Cvačka J., Etrych T., Křen V.:
Glycan-decorated HPMA copolymers as high-affinity lectin ligands.
Polymer Chemistry 8 (17): 2647-2658, 2017.

Tichá A., Stanchev S., Škerle J., Began J., Ingr M., Švehlová K., Polovinkin L., Růžička M., Bednárová L., Hadravová R., Poláchová E., Rampírová P., Březinová J., Kašička V., Majer P., Stříšovský K.:
Sensitive Versatile Fluorogenic Transmembrane Peptide Substrates for Rhomboid Intramembrane Proteases.
Journal of Biological Chemistry 292 (7): 2703-2713, 2017.

Bertolotti B., Sutkeviciute I., Ambrosini M., Ribeiro-Viana R., Rojo J., Fieschi F., Dvořáková H., Kašáková M., Parkan K., Hlaváčková M., Nováková K., Moravcová J.:
Polyvalent C-glycomimetics based on L-fucose or D-mannose as potent DC-SIGN antagonists.
Organic & Biomolecular Chemistry 15 (18): 3995-4004, 2017.

Hanáková Z., Hošek J., Kutil Z., Temml V., Landa P., Vaněk T., Schuster D., Dall'Acqua S., Cvačka J., Polanský O., Šmejkal K.:
Anti-inflammatory Activity of Natural Geranylated Flavonoids: Cyclooxygenase and Lipoxygenase Inhibitory Properties and Proteomic Analysis.
Journal of Natural Products 80 (4): 999-1006, 2017.

Kalužíková A., Vrkoslav V., Harazim E., Hoskovec M., Plavka R., Buděšínský M., Bosáková Z., Cvačka J.:
Cholesteryl esters of ω-(O-acyl)-hydroxy fatty acids in vernix caseosa.
Journal of Lipid Research 58 (8): 1579-1590, 2017.

Machová I., Hubálek M., Lepšík M., Bednárová L., Pazderková M., Kopecký V. Jr., Snášel J., Dostál J., Pichová I.:
The Role of Cysteine Residues in Catalysis of Phosphoenolpyruvate Carboxykinase from Mycobacterium tuberculosis.
PLoS ONE 12: e0170373, 2017.

Adla S.K., Slavíková B., Šmídková M., Tloušťová E., Svoboda M., Vyklický V., Krausová B., Hubálková P., Nekardová M., Holubová K., Valeš K., Buděšínský M., Vyklický ml. L., Chodounská H., Kudová E.:
Physicochemical and biological properties of novel amide-based steroidal inhibitors of NMDA receptors.
Steroids 117: 52-61, 2017.

Dresler J., Krůtová M., Fučíková A., Klimentová J., Hrůzová V., Ďuráčová M., Houdková K., Salovská B., Matějková J., Hubálek M., Pajer P., Píša L., Nyč O.:
Analysis of proteomes released from in vitro cultured eight Clostridium difficile PCR ribotypes revealed specific expression in PCR ribotypes 027 and 176 confirming their genetic relatedness and clinical importance at the proteomic level.
Gut Pathogens 9: 45, 2017.

Johnson N., Březinová J., Stephens E., Burbridge E., Freeman M., Adrain C., Stříšovský K.:
Quantitative proteomics screen identifies a substrate repertoire of rhomboid protease RHBDL2 in human cells and implicates it in epithelial homeostasis.
Scientific Reports 7: 7283, 2017.

Pajer P., Dresler J., Kabickova H., Píša L., Aganov P., Fučík K., Elleder D., Hron T., Kuželka V., Velemínský P., Klimentová J., Fučíková A., Pejchal J., Hrabáková R., Beneš V., Rausch T., Dundr P., Pilin A., Čabala R., Hubálek M., Stříbrný J., Antwerpen M.H., Meyer H.:
Characterization of Two Historic Smallpox Specimens from a Czech Museum.
Viruses 9 (8): 200, 2017.

Škultétyová Ĺ., Ustinova K., Kutil Z., Nováková Z., Pavlíček J., Mikesova J., Trapl D., Baranová P., Havlínová B., Hubálek M., Lánský Z., Bařinka C.:
Human histone deacetylase 6 shows strong preference for tubulin dimers over assembled microtubules.
Scientific Reports 7: 11547, 2017.

Lubyová B., Hodek J. Zábranský A., Prouzová H., Hubálek M., Hirsch I., Weber J.:
PRMT5: A novel regulator of Hepatitis B virus replication and an arginine methylase of HBV core.
PLoS ONE 12 (10): e0186982, 2017.

Tretyachenko V., Vymětal J., Bednárová L., Kopecký V. Jr., Hofbauerová K., Jindrová H., Hubálek M., Souček R., Konvalinka J., Vondrášek J., Hlouchová K.:
Random protein sequences can form defined secondary structures and are well-tolerated in vivo.
Scientific Reports 7: 15449, 2017.

Valentová K., Káňová K., Di Meo F., Pelantová H., Chambers, Christopher S., Rydlová L., Petrásková L., Křenková A., Cvačka J., Trouillas P., Křen V.:
Chemoenzymatic Preparation and Biophysical Properties of Sulfated Quercetin Metabolites.
International Journal of Molecular Sciences 18 (11): 2231, 2017.

Goel P., Jumpertz T., Mikles, David C., Tichá A., Nguyen M.T.N., Verhelst S., Hubálek M., Johnson D.C., Bachovchin D.A., Ogorek I., Pietrzik C.U., Stříšovský K., Schmidt B., Weggen S.:
Discovery and Biological Evaluation of Potent and Selective N-Methylene Saccharin-Derived Inhibitors for Rhomboid Intramembrane Proteases.
Biochemistry 56 (51): 6713-6725, 2017.

Vizcaíno J.A., Walzer M., Jiménez R.C., Bittremieux W., Bouyssié D., Carapito C., Corrales F., Ferro M., Heck A.J.R., Horvatovich P., Hubálek M., Lane L., Laukens K., Levander F., Lisacek F., Novák P., Palmblad M., Piovesan D., Pühler A., Schwämmle,V., Valkenborg D., van Rijswijk M., Vondrášek J., Eisenacher M., Martens L., Kohlbacher O.:
A community proposal to integrate proteomics activities in ELIXIR.
F1000Research 6: 875, 2017.