ÚvodPhD studium na ÚOCHBTémata 2018Fyzikální a výpočetní chemie

Fyzikální a výpočetní chemie

Školitel Prof. RNDr. Pavel Jungwirth, DSc.
Skupina

Pavel Jungwirth

Téma Simulace translokačních procesů v buněčných membránách
Fakulta PřF UK, FCHT / FPBT VŠCHT
Anotace

´Disertační práce se soustředí na molekulové simulace s cílem popsat na molekulové úrovni klíčové procesy spojené s přenosem molekul přes buněčnou membránu. Práce se zvlášť soustředí na vliv oxidačního stresu, iontů a specifických membránových peptide, které se uplatňují při různých nemocech.
Předpokládané znalosti  rozsahu magisterského vzdělání v chemické fyzice, biofyzice, či fyzikální chemie. Dobrá znalost angličtiny.

Membrány, peptidy, molekulová dynamika.

References:
Timr S., Pleskot R., Kadlec J., Kohagen M., Magarkar A., Jungwirth P.:
Membrane Binding of Recoverin: From Mechanistic Understanding to Biological Functionality.
ACS Central Science 3 (2017) 868.

Melcrová A., Pokorná S., Pullanchery S., Kohagen M., Jurkiewicz P., Hof M., Jungwirth P., Cremer P.S.: The Complex Nature of Calcium Cation Interactions with Phospholipid Bilayers.
Scientific Reports 6 (2016) 38035.

Robison A.D., Sun S., Poyton M.F., Johnson G.A., Pellois J.-P., Jungwirth P., Vazdar M., Cremer P.S.: Polyarginine Interacts More Strongly and Cooperatively than Polylysine With Phospholipid Bilayers. Journal of Physical Chemistry B 120 (2016) 9287.

Allolio C., Baxova K., Vazdar M., Jungwirth P.: Guanidinium Pairing Facilitates Membrane Translocation. Journal of Physical Chemistry B 120 (2016) 143.