ÚvodPhD studium na ÚOCHBArchiv - 2017Organická chemie

Organická chemie

Školitel Prof. Ing. Michal Hocek, CSc. DSc.
Skupina

Michal Hocek

Téma Modifikace DNA reaktivními skupinami pro biokonjugace a cross-linky
Fakulta FCHT / FPBT VŠCHT, PřF UK
Anotace

Budou připravovány DNA nesoucí reaktivní skupiny ve velkém žlábku polymerasovou inkorporací modifikovaných nukleosid trifosfátů. Dále budou studovány bioorthogonální reakce těchto funkčních skupin v DNA, zejména cross-linkování s proteiny, připojování dalších užitečných funkčních skupin a jejich využití v chemické biologii a diagnostice.

Klíčové citace:
1. Raindlová, V.; Pohl, R.; Šanda, M.; Hocek, M. "Direct polymerase synthesis of reactive aldehyde-functionalized DNA and its conjugation and staining with hydrazines" Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 1064-1066.
2. Dadová, J.; Orság, P.; Pohl, R.; Brázdová, M.; Fojta, M.; Hocek, M. "Vinylsulfonamide and acrylamide modification of DNA for cross-linking with proteins" Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 10515-10518.
3. Dadová, J.; Vrábel, M.; Adámik, M.; Brázdová, M.; Pohl, R.; Fojta, M.; Hocek, M. "Azidopropyl-vinylsulfonamide as a new bifunctional click reagent for bioorthogonal conjugations. Application for DNA-protein crosslinking" Chem. Eur. J. 2015, 21, 16091-16102.
4. Olszewska, A.; Pohl, R.; Brázdová, M.; Fojta, M.; Hocek, M. "Chloroacetamide-linked nucleotides and DNA for cross-linking with peptides and proteins" Bioconjug. Chem. 2016, 27, 2089–2094.