Ocenění
Medaile Vojtěcha Náprstka pro docenta Krekuleho
29. ledna 2008: Docent Jan Krekule, dlouholetý pracovník našeho ústavu a vynikající popularizátor rostlinné biologie, získal za svou popularizační práci prestižní ocenění - medaili Vojtěcha Náprstka, kterou uděluje Akademie věd České Republiky.
Ministerstvo školství ocenilo výzkum rostlinných hormonů
26. listopadu 2007: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy udělilo Medaili I. stupně doktoru Janu Petráškovi z Ústavu experimentální botaniky. Doktor Petrášek zkoumá, jak je řízen pohyb hormonu auxinu rostlinným tělem. Jde bez přehánění o horké téma dnešní biologie.
Nejvyšší ocenění Akademie věd pro bývalého ředitele ÚEB
15. května 2007: Doktor Jiří Velemínský získal nejvyšší ocenění Akademie věd České Republiky, medaili „De scientia et humanitate optime meritis“.
Medaile G. J. Mendela pro dlouholetou ředitelku ÚEB
15. května 2007: Předseda Akademie věd České republiky, profesor Václav Pačes, udělil Medaili Gregora Johanna Mendela za zásluhy v biologických vědách doktorce Ivaně Macháčkové.