simkovah | Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Pracovní zařazení:

vědecký pracovník

Pracovní skupina:

Centrum strukturní a funkční genomiky rostlin

Publikace:

Počet publikací: 98

2014

Ancient hybridizations among the ancestral genomes of bread wheat

Marcussen, T., Sandve, S.R., Heier, L., Spannagl, M., Pfeifer, M., Rogers, J., Doležel, J., Pozniak, C., Eversole, K., Feuillet, C., Gill, B., Friebe, B., Lukaszewski, A.J., Sourdille, P., Endo, T.R., Kubaláková, M., Číhalíková, J., Dubská, Z., Vrána, J., Šperková, R., Šimková, H., Febrer, M., Clissold, L., McLay, K., Singh, K., Chhuneja, P., Singh, N.K., Khurana, J., Akhunov, E., Choulet, F., Alberti, A., Barbe, V., Wincker, P., Kanamori, H., Kobayashi, F., Itoh, T., Matsumoto, T., Sakai, H., Tanaka, T., Wu, J., Ogihara, Y., Handa, H., Maclachlan, P.R., Sharpe, A., Klassen, D., Edwards, D., Batley, J., Olsen, O.A., Sandve, S.R., Lien, S., Steuernagel, B., Wulff, B., Caccamo, M., Ayling, S., Ramirez-Gonzalez, R.H., Clavijo, B.J., Wright, J., Pfeifer, M., Spannagl, M., Martis, M.M., Mascher, M., Chapman, J., Poland, J.A., Scholz, U., Barry, K., Waugh, R., Rokhsar, D.S., Muehlbauer, G.J., Stein, N., Gundlach, H., Zytnicki, M., Jamilloux, V., Quesneville, H., Wicker, T., Faccioli, P., Colaiacovo, M., Stanca, A.M., Budak, H., Cattivelli, L., Glover, N., Pingault, L., Paux, E., Sharma, S., Appels, R., Bellgard, M., Chapman, B., Nussbaumer, T., Bader, K.C., Rimbert, H., Wang, S., Knox, R., Kilian, A., Alaux, M., Alfam, F., Couderc, L., Guilhot, N., Viseux, C., Loaec, M., Keller, B., Praud, S., Jakobsen, K.S., Wulff, B.B., Steuernagel, B., Mayer, K.F., Olsen, O.A.
SCIENCE 345 1250092 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Genome interplay in the grain transcriptome of hexaploid bread wheat

Pfeifer, M., Kugler, K.G., Sandve, S.R., Zhan, B., Rudi, H., Hvidsten, T.R., Rogers, J., Doležel, J., Pozniak, C., Eversole, K., Feuillet, C., Gill, B., Friebe, B., Lukaszewski, A.J., Sourdille, P., Endo, T.R., Kubaláková, M., Číhalíková, J., Dubská, Z., Vrána, J., Šperková, R., Šimková, H., Febrer, M., Clissold, L., McLay, K., Singh, K., Chhuneja, P., Singh, N.K., Khurana, J., Akhunov, E., Choulet, F., Alberti, A., Barbe, V., Wincker, P., Kanamori, H., Kobayashi, F., Itoh, T., Matsumoto, T., Sakai, H., Tanaka, T., Wu, J., Ogihara, Y., Handa, H., Maclachlan, P.R., Sharpe, A., Klassen, D., Edwards, D., Batley, J., Olsen, O.A., Sandve, S.R., Lien, S., Steuernagel, B., Wulff, B., Caccamo, M., Ayling, S., Ramirez-Gonzalez, R.H., Clavijo, B.J., Wright, J., Pfeifer, M., Spannagl, M., Martis, M.M., Mascher, M., Chapman, J., Poland, J.A., Scholz, U., Barry, K., Waugh, R., Rokhsar, D.S., Muehlbauer, G.J., Stein, N., Gundlach, H., Zytnicki, M., Jamilloux, V., Quesneville, H., Wicker, T., Faccioli, P., Colaiacovo, M., Stanca, A.M., Budak, H., Cattivelli, L., Glover, N., Pingault, L., Paux, E., Sharma, S., Appels, R., Bellgard, M., Chapman, B., Nussbaumer, T., Bader, K.C., Rimbert, H., Wang, S., Knox, R., Kilian, A., Alaux, M., Alfam, F., Couderc, L., Guilhot, N., Viseux, C., Loaec, M., Keller, B., Praud, S., Mayer, K.F., Olsen, O.A.
SCIENCE 345 1250091 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Whole-genome profiling and shotgun sequencing delivers an anchored, gene-decorated, physical map assembly of bread wheat chromosome 6A

Poursarebani, N., Nussbaumer, T., Šimková, H., Šafář, J., Witsenboer, H., van Oeveren, J., Doležel, J., Mayer, K.F.X., Stein, N., Schnurbusch, T.
PLANT JOURNAL 79 334-347 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Major haplotype divergence including multiple germin-like protein genes, at the wheat Sr2 adult plant stem rust resistance locus

Mago, R., Tabe, L., Vautrin, S., Šimková, H., Kubaláková, M., Upadhyaya, N., Berges, H., Kong, X., Breen, J., Doležel, J., Appels, R., Ellis, J.G., Spielmeyer, W.
BMC PLANT BIOLOGY 14 379 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Next-generation sequencing of flow-sorted wheat chromosome 5D reveals lineage-specific translocations and widespread gene duplications

Lucas, S.J., Akpınar, B.A., Šimková, H., Kubaláková, M., Doležel, J., Budak, H.
BMC GENOMICS 15 1080 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu

2013

Comparative analysis of syntenic genes in grass genomes reveals accelerated rates of gene structure and coding sequence evolution in polyploid wheat

Akhunov, E.D., Sehgal, S., Liang, H., Wang, S., Akhunova, A.R., Kaur, G., Li, W., Forrest, K.L., See, D., Šimková, H., Ma, Y., Hayden, M.J., Luo, M., Faris, J.D., Doležel, J., Gill, B.S.
PLANT PHYSIOLOGY 161 252–265 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Genotype-specific SNP map based on whole chromosome 3B sequence information from wheat cultivars Arina and Forno

Shatalina, M., Wicker, T., Buchmann, J.P., Oberhaensli, S., Šimková, H., Doležel, J., Keller, B.
PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL 11 23-32 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Physical mapping integrated with syntenic analysis to characterize the gene space of the long arm of wheat chromosome 1A.

Lucas, S.J., Akpınar, B.A., Kantar, M., Weinstein, Z., Aydınoglu, F., Šafář, J., Šimková, H., Frenkel, Z., Korol, A., Magni, F., Cattonaro, F., Vautrin, S., Bellec, A., Berges, H., Doležel, J., Budak, H.
PLoS ONE 8 e59542 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
A radiation hybrid map of chromosome 1D reveals synteny conservation at a wheat speciation locus

Michalak de Jimenez, M.K., Bassi, F.M., Ghavami, F., Simons, K., Dizon, R., Seetan, R.I., Alnemer, L.M., Denton, A.M., Doğramacı, M., Šimková, H., Doležel, J., Seth, K., Luo, M.-C., Dvorak, J., Gu, Y.Q., Kianian, S.F.
FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS 13 19-32 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Development of COS-SNP and HRM markers for high-throughput and reliable haplotype-based detection of Lr14a in durum wheat (Triticum durum Desf.)

Terracciano, I., Maccaferri, M., Bassi, F., Mantovani, P., Sanguineti, M.C., Salvi, S., Šimková, H., Doležel, J., Massi, A., Ammar, K., Kolmer, J., Tuberosa, R.
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 126 1077-1101 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu

první
předchozí
...
2
3
4(current)
5
6
...
další
poslední

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
poznáváme svět rostlin

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
poznáváme svět rostlin

Ing. Hana Šimková, CSc.

Profile

Hana Šimková CS

2014

2013

Nová expozice v Pevnosti poznání odhaluje kód života

Úspěšný první rok Aplikační laboratoře pro zemědělský výzkum

Vychází kniha o biologovi a teologovi Karlu Benešovi


	Nová expozice v Pevnosti poznání odhaluje kód života Hledání kódu života. Tak se jmenuje nová část expozice v Pevnosti poznání, kterou ve spolupráci s tímto interaktivním muzeem vědy připravilo olomoucké pracoviště našeho ústavu.
	Úspěšný první rok Aplikační laboratoře pro zemědělský výzkum První aplikační laboratoř Akademie věd ČR, propojující české vědce se šlechtiteli a zemědělskou sférou, slaví rok od svého vzniku. A rozhodně má co oslavovat – o její služby je mimořádně velký zájem.
	Vychází kniha o biologovi a teologovi Karlu Benešovi Kolegové a rodina profesora Beneše pokřtili v Praze knihu o jeho životě i práci. Je nám ctí, že jsme mohli jako ústav podpořit vydání publikace, kterou si tato zajímavá osobnost rozhodně zaslouží.