Intranet English

Analýza fyziologicky aktivních látek

Analýza fyziologicky aktivních látek Proteiny zubní dřeně rozdělené pomocí dvourozměrné elektroforézy (výřez) a barvené stříbrem.

Hlavní směry výzkumu:

  • vývoj nových separačních metod, například:
    • afinitní elektromigrační methody
    • aplikace zlatých nanočástic v kapilárních elektromigračních metodách
    • forenzní aplikace (včetně spojení CE-MS)
  • analýza pojivových tkání - proteomická a fyziologická analýza biologických vzorků; identifikace mnoha proteinů, například:
    • proteom lidských zubů ve vztahu k zubnímu kazu
    • nerozpustné proteiny skořápky ptačích vajec, obzvláště kutikuly
    • analýza posttraslačních modifikací proteinů
    • určení látek vznikajících během glykační reakce včetně stanovení místa jejich alokace
    • identifikace změn proteinů v závislosti na věku – oxidace a deamidace proteinů
  • analýza širokého spektra biologicky důležitých látek ve spolupráci s mnoha odděleními Ústavu, různých ústavů v ČR a rovněž v mezinárodní spolupráci (např. proteiny, steroidy, pigmenty)
  • proteomická laboratoř Fyziologického ústavu AV ČR

Aktuální projekty

Úspěchy

Publikace

Svobodová, Jana - Kofroňová, Olga - Benada, Oldřich - Král, V. - Mikšík, Ivan . Separation of oligopeptides, nucleobases, nucleosides and nucleotides using capillary electrophoresis/electrochromatography with sol–gel modified inner capillary wall . Journal of Chromatography A. 2017, roč. 1517, p. 185-194 . IF = 3.981 [ASEP] [ doi ]
Ošťádal, M. - Lišková, Jana - Hadraba, Daniel - Eckhardt, Adam . Possible Pathogenetic Mechanisms and New Therapeutic Approaches of Pes Equinovarus . Physiological Research. 2017, roč. 66, 3, p. 403-410 . IF = 1.461 [ASEP]
Mikšík, Ivan . Capillary electrochromatography of proteins and peptides (2006–2015) . Journal of Separation Science. 2017, roč. 40, 1, p. 251-271 . IF = 2.557 [ASEP] [ doi ]
Mikšík, Ivan - Sedláková, Pavla - Pataridis, Statis - Bortolotti, F. - Gottardo, R. Proteins and their modifications in a medieval mummy . Protein Science. 2016, roč. 25, 11, p. 2037-2044 . IF = 2.523 [ASEP] [ doi ]
Jágr, Michal - Eckhardt, Adam - Pataridis, Statis - Foltán, R. - Myšák, J. - Mikšík, Ivan . Proteomic analysis of human tooth pulp proteomes – Comparison of caries-resistant and caries-susceptible . Journal of Proteomics. 2016, roč. 145, Aug 11, p. 127-136 . IF = 3.914 [ASEP] [ doi ]
Duval, C. - Cassey, P. - Lovell, P.G. - Mikšík, Ivan - Reynolds, S.J. - Spencer, K.A. Maternal influence on eggshell maculation: implications for cryptic camouflaged eggs . Journal of Ornithology. 2016, roč. 157, 1, p. 303-310 . IF = 1.468 [ASEP] [ doi ]
Ošťádal, M. - Eckhardt, Adam - Herget, J. - Mikšík, Ivan - Dungl, P. - Chomiak, J. - Frydrychová, M. - Burian, M. Proteomic analysis of the extracellular matrix in idiopathic pes equinovarus . Molecular and Cellular Biochemistry. 2015, Vol. 401, 1-2, p. 133-139 . IF = 2.613 [ASEP] [ doi ]
Maurer, G. - Portugal, S. J. - Hauber, M. E. - Mikšík, Ivan - Russell, D. G. D. - Cassey, P. First light for avian embryos: eggshell thickness and pigmentation mediate variation in development and UV exposure in wild bird eggs . Functional Ecology. 2015, Vol. 29, 2, p. 209-218 . IF = 5.21 [ASEP] [ doi ]
Ujčíková, Hana - Eckhardt, Adam - Kagan, Dmytro - Roubalová, Lenka - Svoboda, Petr . Proteomic analysis of post-nuclear supernatant fraction and percoll-purified membranes prepared from brain cortex of rats exposed to increasing doses of morphine . Proteome Science 2014, roč. 12, feb 14, p. 11. ISSN 1477-5956. IF = 1.725 [ASEP] [ doi ]
Mikšík, Ivan - Sedláková, Pavla - Pataridis, Statis - Bortolotti, F. - Gottardo, R. - Tagliaro, F. Prince Cangrande’s Collagen: Study of Protein Modification on the Mummy of the Lord of Verona, Italy (1291–1329 AD) . Chromatographia 2014, roč. 77, 21-22, p. 1503-1510. ISSN 0009-5893. IF = 1.411 [ASEP] [ doi ]

Fotogalerie oddělení

Hewlett-Packard (Agilent) HPLC/MSD 1100 System. Detectors: DAD, fluorescence, mass spectrometer (quadrupole), radioactive and evaporative light-scattering (Polymer Labs.). Agilent LC-MSD Trap XCT-ultra Proteomic software (SpectrumMill). Hewlett-Packard (Agilent) HPLC/MSD 1100 System. Detectors: DAD, fluorescence, mass spectrometer (quadrupole), radioactive and evaporative light-scattering (Polymer Labs.). Agilent LC-MSD Trap XCT-ultra Proteomic software (SpectrumMill).
CE-MS coupling (Beckman P/ACE 5000 and Agilent MSD 1100) CE-MS coupling (Beckman P/ACE 5000 and Agilent MSD 1100)
Capillary electrophoresis: two systems by Beckman (5500 and 5000) with three detectors: UV, DAD and LIF (laser-induced fluorescence) Capillary electrophoresis: two systems by Beckman (5500 and 5000) with three detectors: UV, DAD and LIF (laser-induced fluorescence)
Celá fotogalerie

Kontakty

Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
Oddělení analýzy fyziologicky aktivních látek
Vídeňská 1083
14220 Praha 4
tel. +420 241 062 534
fax. +420 241 062 558
 

 

 

Lidé

 

​​doc. Ing. Tomáš Čajka, Ph.D.

vedoucí oddělení
  Mgr. Adam Eckhardt, Ph.D.
zástupce vedoucího oddělení
  Prof. Ing. Ivan Mikšík, DrSc.
vědecký pracovník
  RNDr. Michal Jágr., Ph.D.
vědecký pracovník
  Ing. Jana Svobodová, Ph.D.
vědecký pracovník
  Mgr. Pavla Sedláková, Ph.D.
vědecký pracovník
  Ing. Statis Pataridis
vědecko-technický pracovník
  Mgr. Lucie Kulhavá
postgraduální student
  Mgr. Armenuhi Kirakosjanová
technický pracovník

© 2014 Fyziologický ústav AV ČR