safar | Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Email: safar@ueb.cas.cz
Tel.: +420 585 238 710

Adresa:
Šlechtitelů 31, 783 71, Olomouc - Holice, Česká republika
Místnost č.: 204

Pracovní zařazení:

vědecký pracovník

Pracovní skupina:

Publikace:

Počet publikací: 50

The Wheat Black Jack: Advances towards sequencing the 21 chromosomes of bread wheat

Choulet, F., Caccamo, M., Wright, J., Alaux, M., Šimková, H., Šafář, J., Leroy, P., Doležel, J., Rogers, J., Eversole, K., Feuillet, C.
Genomics of plant genetic resources 405-438 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Structural and functional partitioning of bread wheat chromosome 3B

Choulet, F., Alberti, A., Theil, S., Glover, N., Barbe, V., Daron, J., Pingault, L., Sourdille, P., Couloux, A., Paux, E., Leroy, P., Mangenot, S., Guilhot, N., Le Gouis, J., Balfourier, F., Alaux, M., Jamilloux, V., Poulain, J., Durand, C., Bellec, A., Gaspin, C., Šafář, J., Doležel, J., Rogers, J., Vandepoele, K., Aury, JM., Mayer, K., Berges, H., Quesneville, H., Wincker, P., Feuillet, C.
SCIENCE 345(6194) 1249721 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Expression response of duplicated metallothionein 3 gene to copper stress in Silene vulgaris ecotypes

Nevrtalova, E., Baloun, J., Hudzieczek, V., Cegan, R., Vyskot, B., Doležel, J., Šafář, J., Milde, D., Hobza, R.
PROTOPLASMA 251 1427-1439 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Whole-genome profiling and shotgun sequencing delivers an anchored, gene-decorated, physical map assembly of bread wheat chromosome 6A

Poursarebani, N., Nussbaumer, T., Šimková, H., Šafář, J., Witsenboer, H., van Oeveren, J., Doležel, J., Mayer, K.F.X., Stein, N., Schnurbusch, T.
PLANT JOURNAL 79 334-347 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu

Physical mapping integrated with syntenic analysis to characterize the gene space of the long arm of wheat chromosome 1A.

Lucas, S.J., Akpınar, B.A., Kantar, M., Weinstein, Z., Aydınoglu, F., Šafář, J., Šimková, H., Frenkel, Z., Korol, A., Magni, F., Cattonaro, F., Vautrin, S., Bellec, A., Berges, H., Doležel, J., Budak, H.
PLoS ONE 8 e59542 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
A high density physical map of chromosome 1BL supports evolutionary studies, map-based cloning and sequencing in wheat

Philippe, R., Paux, E., Bertin, I., Sourdille, P., Choulet, F., Laugier, C., Šimková, H., Šafář, J., Bellec, A., Vautrin, S., Frenkel, Z., Cattonaro, F., Magni, F., Scalabrin, S., Martis, M.M., Mayer, K.F.X., Korol, A., Bergès, H., Doležel, J., Feuillet, C.
GENOME BIOLOGY 14 R64 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
A physical map of the short arm of wheat chromosome 1A

Breen, J., Wicker, T., Shatalina, M., Frenkel, Z., Bertin, I., Philippe, R., Spielmeyer, W., Šimková, H., Šafář, J., Cattonaro, F., Scalabrin, S., Magni, F., Vautrin, S., Berges, H., International Wheat Genome Sequencing Consortium, Paux, E., Fahima, T., Doležel, J., Korol, A., Feuillet, C., Keller, B.
PLoS ONE 8 e80272 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu

Genomic diversity in two related plant species with and without sex chromosomes - Silene latifolia and S. vulgaris

Cegan, R., Vyskot, B., Kejnovsky, E., Kubat, Z., Blavet, H., Šafář, J., Doležel, J., Blavet, N., Hobza, R.
PLoS ONE 7(2) e31898 2012 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Functional features of a single chromosome arm in wheat (1AL) determined from its structure

Lucas, S.J., Šimková, H., Šafář, J., Jurman, I., Cattonaro, F., Vautrin, S., Bellec, A., Berges, H., Doležel, J., Budak, H.
FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS 12 173–182 2012 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Chromosomes in the flow to simplify genome analysis

Doležel, J., Vrána, J., Šafář, J., Bartoš, J., Kubaláková, M., Šimková, H.
FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS 12 397-416 2012 Fulltext: PDF link pouze na intranetu

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
poznáváme svět rostlin


	Přijďte za námi do Botanické zahrady v Praze-Troji Botanická zahrada Praha hostí 25.–27. května 2018 Muškátovou burzu, spojenou s prodejem přebytků ze sbírek zahrady. V sobotu 26. května si navíc užijete naše „rostlinné“ aktivity pro děti i dospělé.
	Časopis Živa ocenil olomoucké vědce z ÚEB Ve středu 9. května 2018 vyhlásil časopis Živa ceny za nejlepší články minulého roku. Jednu získal i seriál Nové poznatky v genetice rostlin, jehož autory jsou vědci z našeho olomouckého pracoviště.
	Science to Go: rozmnožování rostlin, matematické kiksy a polární záře Už 21. května 2018 můžete v Praze zajít na akci, na které vás tři mladí vědci seznámí s aktuálními výzkumy ve svých oborech. Doktor Jan Fíla z našeho ústavu bude mluvit o sexuálních hrátkách rostlin.