Díky pochopení a finanční podpoře vedení Akademie věd ČR se podařilo zrekonstruovat rozsáhlý depozitář v areálu Ústavu struktury a mechaniky hornin AV ČR pro potřeby MÚA AV ČR a v roce 2016 tam přestěhovat tuto výjimečnou knihovnu, která je Masarykovým odkazem. Vstřícný krok Akademie věd ČR se stal prvním impulsem k záchraně historicky a badatelsky cenného fondu, do kterého se následně zapojil i stát.
Přes opakované žádosti se teprve na jaře roku 2017 podařilo od státu získat finanční prostředky na podporu projektu Zpřístupnění Knihovny T. G. Masaryka. Mimořádná dotace vlády ČR na základě vládního usnesení č. 353/2017 umožní v letech 2017–2019 systematicky katalogizovat obsáhlou a mimořádnou knihovnu prvního československého prezidenta. Vláda přislíbila podpořit také druhou, závěrečnou etapu projektu plánovanou na léta 2020 a 2021, což vyžaduje ročně zkatalogizovat alespoň 40 000 svazků. Důraz je kladen na zachování původního řádu (oborové třídění bylo převzato do signatur) a podchycení výjimečných svazků s podpisy Masarykovy rodiny, dedikacemi uměleckých osobností té doby a četného poznámkového aparátu, kterým prezident Masaryk opatřoval knihy, jež sám přečetl. Všechny výjimečné nálezy bychom rádi zaznamenali tak, aby byly snadno vyhledatelné.
V listopadu 2017 přibylo stěhování pracovníků MÚA včetně knihovny z budovy Na Florenci do nového sídla v libeňské Gabčíkově ulici. Tím byly všechny části knihoven stmeleny a fondy se tak na vyžádání zpřístupňují v badatelně MÚA k prezenčnímu studiu. Hlavním cílem projektu je zveřejnit (v souborných katalozích AV ČR a NK ČR) a zpřístupnit (v badatelně MÚA) výjimečný a historicky cenný knihovní fond, jehož základ položil sám prezident T. G. Masaryk.
