Laboratoř buněčné biologie
Buněčná morfogeneze a přenos signálů - GTPázy a jejich regulátory v rostlinné buňce
Hlavní oblastí zájmu naší laboratoře je buněčná morfogeneze a s ní spojené regulační procesy v rostlinných buňkách. U rostlin, jejichž buňky nemohou migrovat, je morfogeneze výsledkem procesu orientovaného buněčného dělení a orientovaného buněčného růstu. V naší práci se soustřeďujeme na vnitrobuněčné molekulární mechanizmy morfogeneze, které se projevují například při klíčení a růstu pylové láčky či vývoji embrya. Bílkoviny, které se účastní těchto procesů, jsou, přes velké rozdíly ve struktuře a chování buněk rostlin, hub a živočichů, velmi podobné (Žárský a Cvrčková, 1997; Cvrčková et al., 2001).
Pomocí cDNA knihoven a RT-PCR jsme identifikovali několik GTPáz patřících do rodiny Ras, jež se exprimují v pylu vyšších rostlin. Vedle řady Rab bílkovin účastnících se regulace transportu membránových váčků jsme charakterizovali také Rho/Rac GTPázu (u rostlin nazvaná Rop), která se pravděpodobně účastní organizace aktinového cytoskeletu při vývoji pylu. S využitím mikroinjekcí GTP/GDP do pylových láček jsme dokázali, že GTPázy regulují buněčnou polaritu (Eliáš et al., 2001). Nově jsme naklonovali a částečně charakterizovali fosfolipázy D (PLD) exprimované v pylu tabáku jako potenciální efektory GTPáz. Dokázali jsme, že kyselina fosfatidová produkovaná fosfolipázou D se účastní procesu růstu rostlinné buňky (Potocký et al., 2003). Na výzkumu PLD naše laboratoř úzce spolupracuje s kolegy z VŠCHT (Dr. O. Valentová).
Pomocí funkční komplementace teplotně senzitivního kvasinkového mutanta sec19-1 jsme charakterizovali Rab GDP disociační inhibitor (Rab GDI) z Arabidopsis thaliana - (Žárský et al. 1997) a nyní jsme se zaměřili na komplex Rab geranylgeranyltransferázy, který se podílí na posttranslační prenylaci Rab GTPáz. Ve spolupráci s kolegy z Katedry fyziologie rostlin PřF UK (Dr. Fatima Cvrčková) pracujeme na charakterizaci rodiny rostlinných forminů, které se podílejí na tvorbě aktinových filament a dalších procesů. Zaměřujeme na studium rostlinných homologů komplexu Exocyst (v ostatních eukaryotech se účastní lokalizace exocytózy) a funkci PLD při růstu rostlinné buňky (Eliáš et al., 2003; Potocký et al., 2003).
Pracovníci
vedoucí skupinyvedoucí vědecký pracovník
- RNDr. Viktor Žárský CSc.
vědecký pracovník
- RNDr. Michal Hála Ph.D.
- Doc. RNDr. Jiří Luštinec CSc.
- Ing. Martin Potocký Ph.D.
- Mgr. Hana Soukupová Ph.D.
vědecký asistent
- Tamara Pečenková Ph.D.
- Mgr. Lukáš Synek PhD.
odborný pracovník
- Mgr. Edita Drdová
- Mgr. Jitka Ortmannová
postdoktorand
- Mgr. Lucie Brejšková PhD.
doktorand
- Mgr. Matyáš Fendrych
- Roman Pleskot
- Mgr. Martina Růžičková
- Mgr. Juraj Sekereš
laborant
Výzkumné projekty
- Multiscale analysis of signalling phospholipids and their interaction protein partners in the regulation of plant tip growth , GA ČR , Martin Potocký
- Funkce rostlinného poutacího komplexu exocyst v exocytóze, buněčném dělení a biogenezi buněčné stěny , GA ČR , Michal Hála
- Exocyst, poutací komplex sekretorických váčků, v polarizaci transportu auxinu , GA ČR , Lukáš Synek
- Charakterizace vybraných příslušníků nových skupin rostlinných forminů - třídy II a třídy III. , GA ČR , Viktor Žárský
- Chracterisation of NADPH oxidase from tobacco pollen and its role in regulation of polar cell expansion , GA ČR , Martin Potocký
- Transkriptom mutanta exo70A1 a buněčné funkce EXO70A1, předpokládané podjednotky exocystu , GA AV , Lukáš Synek
- Transkriptom mutanta exo70A1 a buněčné funkce EXO70A1, podjednotky komplexu exocyst, u Arabidopsis thaliana , GA AV , Lukáš Synek
Publikace
2012
- PLANT CELL 24 4703-4716 2012
2011
- PLANT JOURNAL 66 669-679 2011 (External fulltext)
- JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 2011 (External fulltext)
2010
- BIOCHEMICAL SOCIETY TRANSACTIONS 38 723-728 2010 Fulltext: veřejný PDF odkaz
- PLANT JOURNAL 62 494-507 2010 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
- NEW PHYTOLOGIST 188 150-160 2010 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
- PLANT CELL 2010 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
- PLANT JOURNAL 62(4) 615-27 2010
- JOURNAL OF CELL SCIENCE 123 1209-1215 2010 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
2009
- CELL BIOLOGY INTERNATIONAL 33 113-118 2009 Fulltext: veřejný PDF odkaz