Evropský fond pro regionální rozvoj
Praha & EU Investujeme do Vaší budoucnosti
Operační program: OPPK (Operační program Praha Konkurenceschopnost)
Prioritní osa: 3 - Inovace a podnikání
Oblast podpory: 3.1 - Rozvoj inovačního prostředí a partnerství mezi základnou výzkumu a vývoje a praxí
Číslo výzvy: 11
Číslo projektu: CZ.2.16/3.1.00/21528
Doba trvání projektu: 1. leden 2014 – 30. září 2014
Výše investičních způsobilých výdajů nepřesáhne 13 902 900 Kč.
Projektový tým funguje ve složení:
Cílem projektu je vybavit nově vznikající pracoviště Výzkumné centrum genomiky a proteomiky technologií v podobě:
Účelem pořízení nové technologie je světová excelence a multioborové zaměření nově vznikajícího pracoviště „Výzkumné centrum genomiky a proteomiky“ v rámci ÚEM AV ČR, které bude řešit specifické výzkumné úkoly související s působením znečišťujících látek v ovzduší na lidský genetický materiál a lidské zdraví.
Technologie pořízené v rámci Výzkumného centra genomiky a proteomiky jsou pravidelně využívány pro řešení výzkumných úkolů Ústavu experimentální medicíny AV ČR, v.v.i. (ÚEM AV ČR) i spolupracujících institucí. Mezi grantové projekty, v nichž je vybavení Výzkumného centra využíváno, patří zejména úkoly Grantové agentury ČR (Studium procesů spojených s peroxidací lipidů v modelových lidských buněčných liniích, 16-14631S; Centrum studia toxických vlastností nanočástic, P503/12/G147; Mechanismy toxicity pevných emisí z biopaliv, 13-01438S; Dopady znečištění ovzduší na genom novorozenců, 13-13458S) a Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy ČR (Genomika a proteomika při studiu mechanismů biologických účinků vyráběných nanočástic, LO1508; velká infrastruktura MŠMT: Nanomateriály a nanotechnologie pro ochranu životního prostředí a udržitelnou budoucnost, LM2015073, http://www.nanoenvicz.cz/cs/about-us). Zejména projekt velké infrastrutury umožňuje využít technologií Výzkumného centra při spolupráci jak s domácími, tak se zahraničními odbornými institucemi.
Dále jsou stručně uvedeny výsledky některých studií, v nichž bylo vybavení Výzkumného centra v posledních dvou letech využito.
Změny genové exprese v modelových buněčných liniích po aplikaci polycyklických aromatických uhlovodíků, jejich nitro-derivátů a extraktů z motorových emisí získaných v laboratorních podmínkách byly hodnoceny s využitím systému iScan. Výsledky umožnily identifikovat skupiny genů, biologických procesů a drah, jejichž exprese je zvýšena, nebo snížena jako odpověď po působení testovaných látek. Získaná data byla následně využita pro popis mechanismů spojených s reakcí modelových systémů na působení testovaných látek. Výsledky byly publikovány ve dvou článcích v International Journal of Molecular Sciences (Rossner Jr. et al., Int. J. Mol. Sci. 2016, 17, 1393; Libalova et al., Int J Mol Sci 2016, 17, 1833).
Analýza exprese vybraných transkriptů a indukce alternativního sestřihu po inhalační expozici oxidu zinečnatému byla provedena u experimentálních myší. Genová exprese byla hodnocena v plicní tkáni, přičemž byla využita technologie sekvenování nové generace (systém MiSeq) doplněná o detekci transkripčních variant studovaných genů relevantních k biologické odpovědi organismu po působení nanočástic.
Vliv odlišných podmínek životního prostředí na genovou expresi byl studován u novorozenců a jejich matek pocházejích z lokalit s odlišnou úrovní znečištění ovzduší (Karviná, České Budějovice). Pro analýzu změn hladin genové exprese byl využit systém iScan. Získaná data umožnila popsat rozdíly v odpovědi organismu vyvolané odlišnými podmínkami prostředí, včetně hodnocení biologických procesů a drah.
Studie vlivu různých typů nanočástic (oxidu titaničitého, oxidu zinečnatého, oxidu křemičitého, stříbra) v modelovém systému lidských monocytů se kromě jiného zaměřuje na analýzu diferenciální genové exprese s využitím systému iScan. Studie je dále doplněna hodnocením parametrů imunitní odpovědi a poškození DNA.
Při testech biokompatibility nanovlákenných systémů funkcionalizovaných krevními deriváty in vitro na vybraných buněčných typech (lidské mesenchymální kmenové buňky, myší fibroblasty, myší keratynocyty) a následné optimalizaci kultivačních podmínek byla kromě jiného studována diferenciace buněk s využitím technologie XMAP (systém Bio-Plex).
Výsledky výše uvedených studií jsou připravovány k publikací v zahraničních odborných časopisech.
Automatický sběrač buněk, další systém pořízený v rámci Výzkumného centra, je rutinně využíván Oddělením transplantační imunologie i dalšími pracovišti ÚEM AV ČR k vyhodnocování proliferace myších a lidských leukocytů periferní krve a ke stanovování proliferace mesenchymálních kmenových buněk.Výsledky těchto studií byly publikovány v řadě odborných časopisů (Heřmánková et al., Immunobiology 2016, 221, 129; Čejka et al., Oxid. Med. Cell.Longev., Volume 2016, ID5843809, 2016; Trošan et al., Stem Cells Dev. 2016, 25, 874; Holáň et al., Stem Cell Rev. 2016 12, 654.
V současné době probíhá až do 30. září 2019 tzv. období udržitelnosti projektu. V období udržitelnosti jsou pořízené technologie nadále využívány k projektům základního výzkumu příjemce, nemohou být využívány komerčním způsobem, musí zůstat v majetku příjemce a pojištěny. Současně musí ÚEM i nadále plnit závazné monitorovací ukazatele produkce publikaci a vytvoření a udržení nových pracovních míst, ke kterým se zavázal, jakož i naplňovat publicity programu. O plnění projektu v době udržitelnosti se podává řídícímu orgánu každoročně monitorovací zpráva.
24. 9. 2014
Tisková zpráva k ukončení projektu
30. 7. 2014
K dnešnímu dni byl již do oddělení genetické ekotoxikologie dodán Systém pro sekvenování a čipovou analýzu, na kterém příslušná laboratoř zahajuje po úvodním zaškolení zkušební provoz. V opakovaném výběrovém řízení byli vybráni dodavatelé dalších technologií pořizovaných v rámci toho projektu – jedná se o Automatický sběrač buněk a o Sestavu pro měření proteinů. Jsou oboustranně podepsány kupní smlouvy a probíhá dodací lhůta.
15. 4. 2014
Dne 15. 4. 2014 od 13.00 hodin proběhne otevírání obálek s nabídkami v rámci zadávacího řízení na 3 části výzkumné technologie projektu. Ihned poté následuje zasedání hodnoticí komise určené pro výběr nejvhodnějšího dodavatele zadávaných výzkumných technologií.
24. 2. 2014
Tisková zpráva k zahájení projektu
21. 2. 2014
Kompletní zadávací dokumentace k zadávacímu řízení na dodávku všech 3 částí výzkumné technologie byla po zapracování připomínek řídicího orgánu OPPK zveřejněna na stránkách operačního programu (www.oppk.cz), v databázi TED a ve Věstníku veřejných zakázek.
Název zakázky: Dodání technologií pro projekt Výzkumné centrum genomiky a proteomiky
ID Formuláře: 480215
Evidenční číslo zakázky: 377370
Evidenční číslo formuláře: 7402011077370
Datum uveřejnění ve VVZ: 24. 02. 2014
Datum odeslání do TED: 24. 02. 2014
Typ: Řádný
Číslo a datum zveřejnění v TED: 2014/S 041-067803 zveřejněno 27. 02. 2014
27. 1. 2014
Po vzájemné spolupráci členů realizačního týmu, výzkumných garantů projektu a externího zpracovatele zadávacího řízení (společnost eNovation s.r.o.) byla zpracována zadávací dokumentace k zadávacímu řízení na dodávku 3 částí speciální výzkumné technologie v oblasti genomiky a proteomiky. Tato zadávací dokumentace byla včetně všech požadovaných příloh předána řídicímu orgánu OPPK ke kontrole.
© Copyright 2018. All Rights Reserved. Stránky vytvořila agentura WebMotion.
