ÚvodPh.D. studium na ÚOCHBTémata 2019Analytická chemie

Analytická chemie

Školitel doc. RNDr. Josef Cvačka, Ph.D.
Skupina

Hmotnostní spektrometrie (Dr. Josef Cvačka)

Téma Lipidomika novorozeneckého mázku
Fakulta PřF UK
Anotace

Novorozenecký mázek (vernix caseosa) je bílý až nažloutlý biofilm, který pokrývá pokožku lidského plodu během posledního trimestru těhotenství a obvykle zůstává přítomen i na kůži novorozence. Mázek je nezbytný pro prenatální vývoj pokožky a její postnatální adaptaci. Skládá se z odloučených korneocytů obalených lipidovou matricí, má antibakteriální vlastnosti a vykazuje pozoruhodnou schopnost hojit rány. Pro klinickou praxi se hledají umělé náhražky mázku, které by pomáhaly předčasně narozeným dětem s nezralou kůží nebo pacientům s popáleninami či chronickými ranami. Aby bylo možné umělý mázek navrhnout, je třeba nejprve dobře pochopit jeho vznik a chemické složení [1-4].

V tomto projektu chceme prostudovat komplexní složení novorozeneckého mázku pomocí lipidomiky. Nejprve budou vyvinuty metody založené na přímém zavádění vzorku („shotgun lipidomics“) a kapalinové chromatografii („HPLC-based lipidomics“), a to s ohledem na extrémní složitost směsi lipidů a přítomnost vysoce hydrofobních sloučenin s dlouhými alifatickými řetězci. Cílené i necílené metody analýzy budou aplikovány na vzorky reprezentující různé doby gestace během posledního trimestru těhotenství. K měření budou využity špičkové hmotnostní spektrometry, data budou vyhodnocována pomocí specializovaných programů a statistických metod vícerozměrné analýzy. Projekt slibuje získání unikátních dat, které přispějí k lepšímu pochopení tvorby a vývoje lidské kůže.

Reference:
1/ R.Míková et al., Newborn Boys and Girls Differ in the Lipid Composition of Vernix Caseosa. PLoS ONE 9(6): e99173 (2014)
2/ L.Šubčíková et al., Analysis of 1,2-diol diesters in vernix caseosa by high-performance liquid chromatography - atmospheric pressure chemical ionization mass spectrometry, J. Chromatogr. A, 1378, 8–18 (2015).
3/ A.Kalužíková et al., Cholesteryl esters of ω-(O-acyl)-hydroxy fatty acids in vernix caseosa, J. Lip. Res., 58, 1579–1590 (2017).
4/ E.Harazim et al., Nonhydroxylated 1-O-acylceramides in vernix caseosa, J. Lipid Res., 59, 2164–2173 (2018).