Servisní oddělení zajišťuje metabolomickou analýzu biologických materiálů (především krevního séra a plazmy) metodami kapalinové chromatografie ve spojení s hmotnostní spektrometrií (LC–MS):

• Kombinovaná necílená a cílená analýza komplexních lipidů
• Kombinovaná necílená a cílená analýza polárních metabolitů a látek pocházejících z vnějšího prostředí (exposom)
• Cílená analýza specifických nízkoabundantních lipidů ve spolupráci s Oddělením tukové tkáně

Pro kombinované necílené a cílené analýzy je používaná kapalinová chromatografie ve spojení s vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrií (Thermo Q Exactive Plus). Cílená analýza specifických lipidů je prováděna pomocí kapalinové chromatografie ve spojení s analyzátorem typu kvadrupól/lineární iontová past operující v módu monitorování více reakcí (SCIEX QTRAP 5500).

Oddělení dále provádí zpracování metabolomických dat pomocí nejmodernějších softwarových programů, vč. identifikace lipidů, polárních metabolitů a dalších detekovaných sloučenin pomocí knihoven MS/MS spekter. Sloučení necílených a cílených metabolomických postupů umožňuje detekci velkého počtu metabolitů a v řadě případů i jejich absolutní kvantifikaci.

Získaná data jsou dále zpracována pomocí jednorozměrných nebo vícerozměrných statistických metod.