Laboratoř reprodukce rostlin
Témata výzkumu
Zabýváme se zejména molekulárními základy kvetení u rodu Chenopodium a cytoplazmatickou pylovou sterilitou u Silene vulgaris. Oba tyto rostlinné modely patří do stejného řádu - Caryophyllales. Studium rostlinné reprodukce a molelulární evoluce rostlin navázalo na předchozí výzkum genetické diverzity středoevropských planých rostlin.
-
Rod Chenopodium (merlík) zahrnuje dlouhodenní i krátkodenní druhy. Mezi krátkodenní druhy patří Chenopodium rubrum, tradiční modelová rostlina sloužící k výzkumu kvetení již více než třicet let. C. rubrum může být fotoperiodicky indukováno ke kvetení již ve stádiu semenáčku ve stáří pěti dnů. Abychom objasnili tento zajímavý jev, identifikovali jsme merlíkové homology genů CONSTANS a Flowering locus T, které plní klíčové úlohy během fotoperiodické indukce kvetení u Arabidopsis thaliana. V současnosti studujeme jejich expresi v průběhu indukce kvetení u semenáčků merlíku a u starších rostlin s pravými listy.
Během analýzy intronů genů FT jsme zjistili, že tyto sekvence nesou fylogenetickou informaci použitelnou při objasňování příbuzenských vztahů v rámci rodu Chenopodium. -
Druhým projektem je výzkum cytoplazmatické pylové sterility u silenky obecné (Silene vulgaris). Studujeme rozdíly v transkripci mitochondriálních genů u přirozených populací tohoto druhu v Evropě a hledáme mitochondriální geny odpovědné za pylovou sterilitu.
-
Spolupracujeme s Radomírou Vaňkovou při studiu funkce rostlinných hormonů cytokininů v průběhu stresu. Využíváme přitom zkušeností s kvantitatitivní RT PCR, získaných během studia kvetení.
Pracovníci
vedoucí skupinyvedoucí vědecký pracovník
- RNDr. Helena Štorchová CSc.
odborný pracovník
- Ing. Oushadee Abeyawar... MSc
postdoktorand
- Dipl. Nat Manuela Krüger PhD.
Výzkumné projekty
- Diamanty v prachu. Genetické základy květní indukce u zástupců rodu Chenopodium s kontrastní odpovědí na fotoperiodu. , GA ČR , Helena Štorchová
- Evoluce diploidně-polyploidního komplexu Chenopodium album agg. Společná anebo paralelní evoluce severoamerických a euroasijských druhů? , MŠMT , Helena Štorchová
- Tower of Babel: Mitochondrial-nuclear interactions in the gynodioecious species Silene vulgaris investigated with transcriptomics. , GA ČR , Helena Štorchová
- The role of hybridization and polyploidization in the evolution in Chenopodium album aggregate: From biosystematics to gene expression , GA ČR , Helena Štorchová
- Regulace kvetení u rodu Chenopodium studovaná pomocí transkriptomiky , GA ČR , Helena Štorchová
- Hunters or gardeners? Probing plant-microbe interactions in rootless carnivorous Utricularia from a transcriptomic perspective , GA ČR , Helena Štorchová
- Analýza genů, které určují cytoplazmatickou pylovou sterilitu u silenky obecné , MŠMT , Helena Štorchová
- Dynamika mitochondriálního genomu a polymorfismus transkripčních profilů u Silene vulgaris , GA ČR , Helena Štorchová
- Koexistence nativních a inokulovaných arbuskulárně mykorhizních hub v kořenech hostitelských rostlin , GA ČR , Helena Štorchová
- Identifikace genů účastnících se fotoperiodické indukce kvetení u rodu Chenopodium a studium jejich exprese , GA ČR , Helena Štorchová
Publikace
2019
- PLANT ECOLOGY AND DIVERSITY In press 2019
2018
- MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION 129 189-201 2018
- BMC GENOMICS In press 2018
2017
- JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 68 1599-1612 2017
- PLoS ONE 12(7) e0181525 2017
- PLoS ONE 12(8) e0183470 2017
- INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 18 2429 2017
- MYCORRHIZA 27 577-585 2017
2016
- G3: GENES, GENOMES, GENETICS 6 3065-3076 2016
2015
- MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS 290 1-9 2015