Snímek embryonálního myšího srdce z optického tomografu, model kapilár složený z více konfokálních snímků potkaního mozku a snímek mozku bažanta pořízený magnetickou rezonancí.
Oddělení biomatematiky řeší dva tématické okruhy: (1) biologické zobrazování a obrazovou analýzu a (2) biochemii membránových receptorů.
1. Biologické zobrazování a obrazová analýza
zahrnuje výzkum 3D morfologických aspektů fyziologických procesů na mesoskopické, mikroskopické a ultrastrukturální úrovni. Oddělení spolupracuje na řadě takto zaměřených projektů jak v rámci Akademie věd ČR, tak i s jinými pracovišti. Další zájemce o spolupráci vítáme (kontakt: jiri.janacek@fgu.cas.cz).
AKTUÁLNÉ ŘEŠENÉ PROJEKTY
- Rekonstrukce a slícování obrazů získaných multimodálními preklinickými zobrazovacími metodami
- Převodní systém vyvíjejícího se myšího srdce
TÉMATA DLOUHODOBÉHO ZÁJMU
- Vývoj metod 3D analýzy obrazu a stereologických metod včetně implementace (např. původních metod 3D konfokální stereologie použitých pro objemovou analýzu lidských Langerhansových ostrůvků určených k transplantaci)
- Zvyšování obrazového kontrastu optickou cestou (bez barvení vzorků) při mikroskopickém snímání živých buněk a tkání
OSTATNÍ PROJEKTY (výběr)
- Vliv ionizujícího záření na kapilární krevní síť
- Vliv zvýšené koncentrace CO2 na účinnost a ultrastrukturu fotosyntetického aparátu
- Mechanismy zodpovědné za tvorbu extracellulárních bílkovin (kolagen a elastin)
ZOBRAZOVACÍ PROSTŘEDKY A POSTUPY
(původ zkratek viz anglická verze této webové stránky)
- Laserová rastrovací konfokální mikroskopie
- Mikroskopie s dvoufotonovou excitací
- Mikroskopie s buzením druhé harmonické (SHG)
- ‘Bílý‘ laser a hybridní detektory (mikroskop Leica TCS SP8 WLL MP)
- Analýza obnovení fluorescenčního signálu po vysvícení (FRAP), Försterova rezonančního přenosu energie (FRET) a časových konstant fluorescence a fosforescence (FLIM a PLIM), včetně excitačně-emisních spekter (typu λ2)
- Optická projekční tomografie (OPT)
- Mikroskopie využívající osvit tenké vrstvy vzorku (SPIM)
- Mikroskopie s fázovým, modulačním a interferenčním kontrastem
DOSTUPNÉ PROGRAMY A POSTUPY
- Programy pro 3D analýzu obrazu, stereologii a prostorovou statistiku (Amira, Ellipse) rozšířené o původní metody; dekonvoluční programy (Huygens)
- Optické/chemické projasňování pro OPT a SPIM
OTEVŘENÝ PŘÍSTUP K PŘÍSTROJOVÉMU VYBAVENÍ
Oddělení je zapojeno v projektu CzechBioimaging [1] podporujícího otevřený přístup ke svému vybavení a některým dalším přístrojům, např. konfokálnímu mikroskopu s Nipkowovým rotujícím diskem (“Carv II“) [2].
[1] http://www.czech-bioimaging.cz/
[2] http://www.fgu.cas.cz/en/articles/529-czech-bioimaging-2016-2019
2. Biochemie membránových receptorů
Tento tématický okruh zahrnuje studium buněčných a molekulárních mechanizmů desenzitizace. Tento proces se podílí na regulaci intenzity účinku vyvolaném vazbou hormonů na receptory spřažené s G proteiny (GPCR). Receptory spřažené s G proteiny jsou integrálními bílkovinami plazmatické membrány, které zprostředkují přenos extracelulárních signálů do nitra buňky. GPCR hrají klíčovou roli v regulaci řady fyziologických procesů a funkcí. Význam GPCR rovněž dokládá skutečnost, že tyto bílkoviny jsou místem působení téměř poloviny celosvětově předepisovaných léků.
Hlavní směry našeho výzkumu jsou:
- Úloha buněčné membrány a membránové domény
- Opioidní receptory a drogová závislost
- Vliv monovalentních iontů na delta-opioidní receptory - analýza účinku lithia v živých buňkách a izolovaných buněčných membránách
- GABA-B - signální kaskády
Podrobnější informace naleznete zde.
Aktuální projekty
MPI - nová modalita funkčního zobrazování koregistrovaná s anatomickým zobrazením.
Více
Více
Více
K analýze převodního systému srdečního a jeho vývoje u myší používáme 3D zobrazovací metody a optické mapování.
Více
Pomocí zobrazení s vysokým rozlišením a geometrické morfometrie studujeme vztah anatomie mozku a letových schopností ptáků, abychom umožnili interpretaci paleontologických nálezů neurokranií theropodních dinosaurů.
Více
Úspěchy
Bylo identifikováno nové vazebné místo pro kalmodulin (CaM) a S100A1 u TRPM4, nachází na distální části N-konce.
Více
Měření objemu Langerhansových ostrůvků pomocí optické projekční tomografie a metody Fakír
Více
Více
Více
Více
Zobrazit více
Publikace
Vošahlíková, Miroslava - Roubalová, Lenka - Ujčíková, Hana - Hloušková, Martina - Musil, Stanislav - Alda, M. - Svoboda, Petr
.
Na+/K+-ATPase level and products of lipid peroxidation in live cells treated with therapeutic lithium for different periods in time (1, 7, and 28 days); studies of Jurkat and HEK293 cells
.
Naunyn-Schmiedeberg's Archives of Pharmacology 2019, 392(7), 785-799
.
IF = 2.058
[ASEP]
[
doi
]
Svoboda, Jan - Litvinec, Andrej - Kala, David - Pošusta, Antonín - Vávrová, Lenka - Jiruška, Přemysl - Otáhal, Jakub
.
Strain Differences in Intraluminal Thread Model of Middle Cerebral Artery Occlusion in Rats
.
Physiological Research 2019, 68(1), 37-48
.
IF = 1.701
[ASEP]
[
doi
]
Olejníčková, Veronika - Šaňková, Barbora - Sedmera, David - Janáček, Jiří
.
Trabecular Architecture Determines Impulse Propagation Through the Early Embryonic Mouse Heart
.
Frontiers in physiology 2019, 9(Jan 8)), 1876
.
IF = 3.201
[ASEP]
[
doi
]
Kubínová, Z. - Glanc, N. - Radochová, Barbora - Lhotáková, Z. - Janáček, Jiří - Kubínová, Lucie - Albrechtová, J.
Unbiased estimation of Norway spruce (Picea abies L. Karst.) chloroplast structure: Heterogeneity within needle mesophyll under different irradiance and [CO 2 ]
.
Image Analysis and Stereology 2019, 38(1), 83-94
.
IF = 1.778
[ASEP]
[
doi
]
Krok-Borkowicz, M. - Filová, Elena - Chlupáč, Jaroslav - Klepetář, Jan - Bačáková, Lucie - Pamula, E.
Influence of pore size and hydroxyapatite deposition in poly(L-lactide-co-glycolide) scaffolds on osteoblast-like cells cultured in static and dynamic conditions
.
Materials Letters 2019, 241(Apr 15), 1-5
.
IF = 3.019
[ASEP]
[
doi
]
Janáček; Jiří - Brejchová; Jana - Svoboda; Petr
.
Determination of delta-opioid receptor molecules mobility in living cells plasma membrane by novel method of FRAP analysis
.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. 2019; 1861(7); 1364-1354
.
IF = 3.790
[ASEP]
[
doi
]
Eckhardt, Adam - Novotný, T. - Doubková, Martina - Hronková, Lucia - Vajner, L. - Pataridis, Statis - Hadraba, Daniel - Kulhavá, Lucie - Plencner, Martin - Knitlová, Jarmila - Lišková, Jana - Uhlík, J. - Žaloudíková, M. - Vondrášek, David - Mikšík, Ivan - Ošťádal, M.
Novel contribution to clubfoot pathogenesis: The possible role of extracellular matrix proteins
.
Journal of Orthopaedic Research 2019, 37(3), 769-778
.
IF = 3.043
[ASEP]
[
doi
]
Čočková; Z. - Ujčíková; Hana - Telenský; P. - Novotný; J.
Protein profiling of SH-SY5Y neuroblastoma cells: The effect of rhein
.
Journal of Biosciences. 2019; 44(4)); UNSP88
.
IF = 1.823
[ASEP]
[
doi
]
Beyrand; V. - Voeten; D. F. A. E. - Bureš; S. - Fernandez; V. - Janáček; Jiří - Jirák; D. - Rauhut; O. - Tafforeau; P.
Multiphase progenetic development shaped the brain of flying archosaurs
.
Scientific Reports. 2019; 9(Jul 25)); 10807
.
IF = 4.011
[ASEP]
[
doi
]
Bačáková; Markéta - Pajorová; Julia - Brož; Antonín - Hadraba; Daniel - Lopot; F. - Zavaďáková; A. - Vištejnová; L. - Beňo; M. - Kostič; I. - Jenčová; V. - Bačáková; Lucie
.
A two-layer skin construct consisting of a collagen hydrogel reinforced by a fibrin-coated polylactide nanofibrous membrane
.
International Journal of Nanomedicine. 2019; 14(2019); 5033-5050
.
IF = 4.471
[ASEP]
[
doi
]
Vošahlíková, Miroslava - Ujčíková, Hana - Hloušková, Martina - Musil, Stanislav - Roubalová, Lenka - Alda, M. - Svoboda, Petr
.
Induction of oxidative stress by long-term treatment of live HEK293 cells with therapeutic concentration of lithium is associated with down-regulation of delta-opioid receptor amount and function
.
Biochemical Pharmacology 2018, roč. 154, Aug, p. 452-463
.
IF = 4.825
[ASEP]
[
doi
]
Vetrík, Miroslav - Pařízek, Martin - Hadraba, Daniel - Kukačková, Olivia - Brus, Jiří - Hlídková, Helena - Kománková, Lucie - Hodan, Jiří - Sedláček, Ondřej - Šlouf, Miroslav - Bačáková, Lucie - Hrubý, Martin
.
Porous heat-treated polyacrylonitrile scaffolds for bone tissue engineering
.
ACS Applied Materials and Interfaces 2018, roč. 10, 10, p. 8496-8506
.
IF = 8.456
[ASEP]
[
doi
]
Prats-Galino, A. - Čapek, Martin - Reina, M. A. - Cvetko, E. - Radochová, Barbora - Tubbs, R.S. - Damjanovska, M. - Pintaric, T.S.
3D reconstruction of peripheral nerves from optical projection tomography images: A method for studying fascicular interconnections and intraneural plexuses
.
Clinical Anatomy 2018, roč. 31, 3, p. 424-431
.
IF = 1.813
[ASEP]
[
doi
]
Pajorová, Julie - Bačáková, Markéta - Musílková, Jana - Brož, Antonín - Hadraba, Daniel - Lopot, F. - Bačáková, Lucie
.
Morphology of a fibrin nanocoating influences dermal fibroblast behavior
.
International Journal of Nanomedicine 2018, roč. 13, June, p. 3367-3380
.
IF = 4.471
[ASEP]
[
doi
]
Meznaric, M. - Eržen, I. - Karen, Petr - Cvetko, E.
Effect of ageing on the myosin heavy chain composition of the human sternocleidomastoid muscle
.
Annals of Anatomy-Anatomischer Anzeiger 2018, roč. 216, March, p. 95-99
.
IF = 2.241
[ASEP]
[
doi
]
Kubínová, Z. - Janáček, Jiří - Lhotáková, Z. - Šprtová, Miroslava - Kubínová, Lucie - Albrechtová, Jana
.
Norway spruce needle size and cross section shape variability induced by irradiance on a macro- and microscale and CO2 concentration
.
Trees: structure and function 2018, roč. 32, 1, p. 231-244
.
IF = 1.799
[ASEP]
[
doi
]
Kohutiar, Matej - Eckhardt, Adam - Mikšík, Ivan - Šantorová, J. - Wilhelm, Jiří
.
Proteomic analysis of peroxynitrite-induced protein nitration in isolated beef heart mitochondria
.
Physiological Research 2018, roč. 67, 2, p. 239-250
.
IF = 1.701
[ASEP]
Holáň, Vladimír - Cechová, Kristína - Zajícová, Alena - Kössl, Jan - Heřmánková, Barbora - Boháčová, Pavla - Hájková, Michaela - Krulová, Magdaléna - Svoboda, Petr - Javorková, Eliška
.
The Impact of Morphine on the Characteristics and Function Properties of Human Mesenchymal Stem Cells
.
Stem Cell Reviews and Reports 2018, 14(6), 801-811
.
IF = 4.697
[ASEP]
[
doi
]
Eržen, I. - Janáček, Jiří - Kreft, M. - Kubínová, Lucie - Cvetko, E.
Capillary Network Morphometry of Pig Soleus Muscle Significantly Changes in 24 Hours After Death
.
Journal of Histochemistry and Cytochemistry 2018, roč. 66, 1, p. 23-31
.
IF = 2.370
[ASEP]
[
doi
]
Dvořák, J. - Švihlík, J. - Kybic, J. - Radochová, Barbora - Janáček, Jiří - Kukal, J. - Borovec, J. - Habart, D.
Volume estimation from single images: an application to pancreatic islets.
Image Analysis and Stereology 2018, 37(3), 191-204
.
IF = 1.778
[ASEP]
[
doi
]
Czerneková, Michaela - Jönsson, K. I. - Hajer, J. - Devetter, Miloslav
.
Evaluation of extraction methods for quantitative analysis of tardigrade populations in soil and leaf litter
.
Pedobiologia 2018, roč. 70, Sep, p. 1-5
.
IF = 1.833
[ASEP]
[
doi
]
Czerneková, Michaela - Janelt, K. - Student, S. - Jönsson, K. I. - Poprawa, I.
A comparative ultrastructure study of storage cells in the eutardigrade Richtersius coronifer in the hydrated state and after desiccation and heating stress
.
PLoS ONE 2018, roč. 13, 8, článku e0201430
.
IF = 2.776
[ASEP]
[
doi
]
Cechová, Kristína - Hloušková, Martina - Javorková, Eliška - Roubalová, Lenka - Ujčíková, Hana - Holáň, Vladimír - Svoboda, Petr
.
Up-regulation of mu-, delta- and kappa-opioid receptors in concanavalin A-stimulated rat spleen lymphocytes
.
Journal of Neuroimmunology 2018, 321(Aug 15), 12-23
.
IF = 2.832
[ASEP]
[
doi
]
Boušová, Kristýna - Herman, P. - Večeř, J. - Bednárová, L. - Monincová, L. - Majer, P. - Vyklický ml., Ladislav - Vondrášek, J. - Teisinger, Jan
.
Shared CaM- and S100A1-binding epitopes in the distal TRPM4 N terminus
.
FEBS Journal 2018, roč. 285, 3, p. 599-613
.
IF = 4.739
[ASEP]
[
doi
]
Ziegler, A. - Neues, F. - Janáček, Jiří - Beckmann, F. - Epple, M.
Mineral in skeletal elements of the terrestrial crustacean Porcellio scaber: SR mu CT of function related distribution and changes during the moult cycle
.
Arthropod Structure & Development. 2017, roč. 46, 1, p. 63-76
.
IF = 1.696
[ASEP]
[
doi
]
Vošahlíková, Miroslava - Ujčíková, Hana - Chernyavskiy, Oleksandr - Brejchová, Jana - Roubalová, Lenka - Alda, M. - Svoboda, Petr
.
Effect of therapeutic concentration of lithium on live HEK293 cells; increase of Na+/K+-ATPase, change of overall protein composition and alteration of surface layer of plasma membrane
.
Biochimica et Biophysica Acta. General Subjects. 2017, roč. 1861, 5, p. 1099-1112
.
IF = 3.679
[ASEP]
[
doi
]
Ujčíková, Hana - Hloušková, Martina - Cechová, Kristina - Stolařová, Kateřina - Roubalová, Lenka - Svoboda, Petr
.
Determination of mu-, delta- and kappa-opioid receptors in forebrain cortex of rats exposed to morphine for 10 days: Comparison with animals after 20 days of morphine withdrawal
.
PLoS ONE. 2017, roč. 12, 10, článku e0186797
.
IF = 2.766
[ASEP]
[
doi
]
Techniková, L. - Tunák, M. - Janáček, Jiří
.
New objective system of pilling evaluation for various types of fabrics
.
Textile Institute. Journal. 2017, roč. 108, 1, p. 123-131
.
IF = 1.174
[ASEP]
[
doi
]
Ošťádal, M. - Lišková, Jana - Hadraba, Daniel - Eckhardt, Adam
.
Possible Pathogenetic Mechanisms and New Therapeutic Approaches of Pes Equinovarus
.
Physiological Research. 2017, roč. 66, 3, p. 403-410
.
IF = 1.324
[ASEP]
Mašková, P. - Radochová, Barbora - Lhotáková, Z. - Michálek, Jan - Lipavská, H.
Nonstructural carbohydrate-balance response to long-term elevated CO2 exposure in European beech and Norway spruce mixed cultures: biochemical and ultrastructural responses
.
Canadian Journal of Forest Research. 2017, roč. 47, 11, p. 1498-1494
.
IF = 1.887
[ASEP]
[
doi
]
Lišková, Jana - Hadraba, Daniel - Filová, Elena - Koňařík, M. - Pirk, J. - Jelen, K. - Bačáková, Lucie
.
Valve interstitial cell culture: Production of mature type I collagen and precise detection
.
Microscopy Research and Technique. 2017, roč. 80, 8, p. 936-942
.
IF = 1.087
[ASEP]
[
doi
]
Kubínová, Lucie - Radochová, Barbora - Lhotáková, Z. - Kubínová, Z. - Albrechtová, J.
Stereology, an unbiased methodological approach to study plant anatomy and cytology: Past, present and future
.
Image Analysis and Stereology.. 2017, roč. 36, 3, p. 187-205
.
IF = 1.424
[ASEP]
[
doi
]
Koshel, E. I. - Cheluskin, P. S. - Melnikov, A. S. - Serdobintsev, P. Y. - Stolbovaia, A. Y. - Saifitdinova, A. F. - Scheslavskiy, V. I. - Chernyavskiy, Oleksandr - Gaginskaya, E. R. - Koshevoy, I. O. - Tunik, S. P.
Lipophilic phosphorescent gold(I) clusters as selective probes for visualization of lipid droplets by two-photon microscopy
.
Journal of Photochemistry and Photobiology A-Chemistry. 2017, roč. 332, Jan 1, p. 122-130
.
IF = 2.891
[ASEP]
[
doi
]
Jirák, D. - Janáček, Jiří
.
Volume of the crocodilian brain and endocast during ontogeny
.
PLoS ONE. 2017, roč. 12, 6, článku e0178491
.
IF = 2.766
[ASEP]
[
doi
]
Hadraba, Daniel - Janáček, Jiří - Filová, Eva - Lopot, F. - Paesen, R. - Fanta, O. - Jarman, A. - Nečas, A. - Ameloot, M. - Jelen, K.
Calcaneal Tendon Collagen Fiber Morphometry and Aging
.
Microscopy and Microanalysis.. 2017, roč. 23, 5, p. 1040-1047
.
IF = 2.124
[ASEP]
[
doi
]
Czerneková, Michaela - Jönsson, K. I. - Chajec, Ł. - Student, S. - Poprawa, I.
The structure of the desiccated Richtersius coronifer (Richters, 1903)
.
Protoplasma. 2017, roč. 254, 3, p. 1367-1377
.
IF = 2.457
[ASEP]
[
doi
]
Bačáková, Markéta - Pajorová, Julie - Stránská, D. - Hadraba, Daniel - Lopot, F. - Riedel, Tomáš - Brynda, Eduard - Žaloudková, Margit - Bačáková, Lucie
.
Protein nanocoatings on synthetic polymeric nanofibrous membranes designed as carriers for skin cells
.
International Journal of Nanomedicine. 2017, roč. 12, Feb, p. 1143-1160
.
IF = 4.370
[ASEP]
[
doi
]
Czerneková, Michaela - Jönsson, K. I.
Mitosis in storage cells of the eutardigrade Richtersius coronifer
.
Zoological Journal of the Linnean Society. 2016, roč. 178, 4, p. 888-896
.
IF = 2.711
[ASEP]
[
doi
]
Czerneková, Michaela - Jönsson, K. I.
Experimentally Induced Repeated Anhydrobiosis in the Eutardigrade Richtersius coronifer
.
PLoS ONE. 2016, roč. 11, 11, článku e0164062
.
IF = 2.806
[ASEP]
[
doi
]
Pearce, P. - Brownbill, P. - Janáček, Jiří - Jirkovská, M. - Kubínová, Lucie - Chernyavsky, I. L. - Jensen, O. E.
Image-Based Modeling of Blood Flow and Oxygen Transfer in Feto-Placental Capillaries
.
PLoS ONE. 2016, roč. 11, 10, článku e0165369
.
IF = 2.806
[ASEP]
[
doi
]
Kohutiar, Matej - Ivica, Josko - Vytášek, R. - Skoumalová, A. - Illner, Jan - Šantorová, P. - Wilhelm, Jiří
.
Comparison of the effects of tert-butyl hydroperoxide and peroxynitrite on the oxidative damage to isolated beef heart mitochondria
.
Physiological Research. 2016, roč. 65, 4, p. 617-626
.
IF = 1.461
[ASEP]
Filová, Eva - Jakubcová, Barbora - Danilová, I. - Kuželová Košťáková, E. - Jarošíková, T. - Chernyavskiy, Oleksandr - Hejda, J. - Handl, M. - Beznoska, Jiří - Nečas, A. - Rosina, J. - Amler, Evžen
.
Polycaprolactone foam functionalized with chitosan microparticles – a suitable scaffold for cartilage regeneration.
Physiological Research. 2016, roč. 65, 1, p. 121-131
.
IF = 1.461
[ASEP]
Wilhelm, Jiří - Vytášek, Richard - Uhlík, Jiří - Vajner, Luděk
.
Oxidative Stress in the Developing Rat Brain due to Production of Reactive Oxygen and Nitrogen Species
.
Oxidative Medicine and Cellular Longevity. 2016, roč. 2016, 2016, p. 5057610
.
IF = 4.593
[ASEP]
[
doi
]
Manakov, D. - Ujčíková, Hana - Pravenec, Michal - Novotný, J.
Alterations in the cardiac proteome of the spontaneously hypertensive rat induced by transgenic expression of CD36
.
Journal of Proteomics. 2016, roč. 145, Aug 11, p. 177-186
.
IF = 3.914
[ASEP]
[
doi
]
Ujčíková, Hana - Vošahlíková, Miroslava - Roubalová, Lenka - Svoboda, Petr
.
Proteomic analysis of protein composition of rat forebrain cortex exposed to morphine for 10 days; comparison with animals exposed to morphine and subsequently nurtured for 20 days in the absence of this drug
.
Journal of Proteomics. 2016, roč. 145, Aug 11, p. 11-23
.
IF = 3.914
[ASEP]
[
doi
]
Brejchová, Jana - Vošahlíková, Miroslava - Roubalová, Lenka - Parenti, M. - Mauri, M. - Chernyavskiy, Oleksandr - Svoboda, Petr
.
Plasma membrane cholesterol level and agonist-induced internalization of delta-opioid receptors; colocalization study with intracellular membrane markers of Rab family\\n
.
Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 2016, roč. 48, 4, p. 375-396
.
IF = 2.576
[ASEP]
[
doi
]
Techniková, L. - Tunák, M. - Janáček, Jiří
.
Pilling evaluation of patterned fabrics based on a gradient field method
.
Indian Journal of Fibre & Textile Research. 2016, roč. 41, 1, p. 97-101
.
IF = 0.430
[ASEP]
Kolesová, H. - Čapek, Martin - Radochová, Barbora - Janáček, Jiří - Sedmera, David
.
Comparison of different tissue clearing methods and 3D imaging techniques for visualization of GFP-expressing mouse embryos and embryonic hearts
.
Histochemistry and Cell Biology. 2016, roč. 146, 2, p. 142-152
.
IF = 2.553
[ASEP]
[
doi
]
Tonar, Z. - Tomášek, P. - Loskot, P. - Janáček, Jiří - Králíčková, M. - Witter, K.
Vasa vasorum in the tunica media and tunica adventitia of the porcine aorta
.
Annals of Anatomy-Anatomischer Anzeiger. 2016, roč. 205, 2016, p. 22-36
.
IF = 1.864
[ASEP]
[
doi
]
Vošahlíková, Miroslava - Svoboda, Petr
.
Lithium - therapeutic tool endowed with multiple beneficiary effects caused by multiple mechanisms
.
Acta Neurobiologiae Experimentalis. 2016, roč. 76, 1, p. 1-19
.
IF = 1.207
[ASEP]
Sládková, J. - Spáčilová, J. - Čapek, Martin - Tesařová, M. - Hansíková, H. - Honzík, T. - Martínek, J. - Zámečník, J. - Kostková, O. - Zeman, J.
Analysis of Mitochondrial Network Morphology in Cultured Myoblasts from Patients with Mitochondrial Disorders
.
Ultrastructural Pathology. 2015, Vol. 39, 5, p. 340-350
.
IF = 0.828
[ASEP]
[
doi
]
Jirák, D. - Janáček, Jiří - Kear, B. P.
A combined MR and CT study for precise quantitative analysis of the avian brain
.
Scientific Reports. 2015, Vol. 5, Oct 30, p. 16002
.
IF = 5.228
[ASEP]
[
doi
]
Roubalová, Lenka - Vošahlíková, Miroslava - Brejchová, Jana - Sýkora, Jan - Rudajev, Vladimír - Svoboda, Petr
.
High Efficacy but Low Potency of delta-Opioid Receptor-G Protein Coupling in Brij-58-Treated, Low-Density Plasma Membrane Fragments
.
PLoS ONE. 2015, Vol. 10, 8, e0135664
.
IF = 3.057
[ASEP]
[
doi
]
Fernandez, V. - Buffetaut, E. - Suteethorn, V. - Rage, J. C. - Tafforeau, P. - Kundrát, Martin
.
Evidence of Egg Diversity in Squamate Evolution from Cretaceous Anguimorph Embryos
.
PLoS ONE. 2015, Vol. 10, 7, e0128610
.
IF = 3.057
[ASEP]
[
doi
]
Wilhelm, Jiří - Ivica, Josko - Veselská, Zdeňka - Uhlík, Jiří - Vajner, Luděk
.
Changes in the composition of fatty acids and lipofuscin-like pigments during development of rat heart
.
Physiological Research. 2015, Vol. 64, 5, p. 643-651
.
IF = 1.618
[ASEP]
Michálek, Jan
.
Total Variation-Based Reduction of Streak Artifacts, Ring Artifacts and Noise in 3D Reconstruction from Optical Projection Tomography
.
Microscopy and Microanalysis. 2015, Vol. 21, 6, p. 1602-1615
.
IF = 1.73
[ASEP]
[
doi
]
Kubínová, Lucie - Janáček, Jiří
.
Confocal stereology: an efficient tool for measurement of microscopic structures
.
Cell and Tissue Research. 2015, Vol. 360, 1, p. 13-28
.
IF = 2.948
[ASEP]
[
doi
]
Brejchová, Jana - Sýkora, Jan - Ostašov, Pavel - Merta, Ladislav - Roubalová, Lenka - Janáček, Jiří - Hof, Martin - Svoboda, Petr
.
TRH-receptor mobility and function in intact and cholesterol-depleted plasma membrane of HEK293 cells stably expressing TRH-R-eGFP
.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. 2015, Vol. 1848, 3, p. 781-796
.
IF = 3.687
[ASEP]
[
doi
]
Cvetko, E. - Čapek, Martin - Damjanovska, M. - Reina, M. A. - Eržen, I. - Stopar-Pintarič, T.
The utility of three-dimensional optical projection tomography in nerve injection injury imaging
.
Anaesthesia. 2015, Vol. 70, 8, p. 939-947
.
IF = 3.794
[ASEP]
[
doi
]
Bačáková, Markéta - Lopot, F. - Hadraba, Daniel - Varga, Marián - Žaloudková, Margit - Stránská, D. - Suchý, Tomáš - Bačáková, Lucie
.
Effects of fiber density and plasma modification of nanofibrous membranes on the adhesion and growth of HaCaT keratinocytes
.
Journal of Biomaterials Applications. 2015, Vol. 29, 6, p. 837-853
.
IF = 1.988
[ASEP]
[
doi
]
Lišková, Jana - Babchenko, Oleg - Varga, Marián - Kromka, Alexander - Hadraba, Daniel - Švindrych, Zdeněk - Burdíková, Zuzana - Bačáková, Lucie
.
Osteogenic cell differentiation on H-terminated and O-terminated nanocrystalline diamond films
.
International Journal of Nanomedicine. 2015, Vol. 10, 2015, p. 869-884
.
IF = 4.32
[ASEP]
[
doi
]
Trojanová, Johana - Kulik, A. - Janáček, Jiří - Králíková, Michaela - Syka, Josef - Tureček, Rostislav
.
Distribution of glycine receptors on the surface of the mature calyx of Held nerve terminal
.
Frontiers in Neural Circuits 2014, roč. 8, oct, p. 120. ISSN 1662-5110.
IF = 3.568
[ASEP]
[
doi
]
Líšková, Silvia - Petrová, M. - Karen, Petr - Behuliak, Michal - Zicha, Josef
.
Contribution of Ca2+-Dependent Cl- Channels to Norepinephrine-Induced Contraction of Femoral Artery Is Replaced by Increasing EDCF Contribution during Ageing
.
BioMed Research International 2014, roč. 2014, 2014, p. 289361. ISSN 2314-6133.
IF = 1.579
[ASEP]
[
doi
]
Kubínová, Z. - Janáček, Jiří - Lhotáková, Z. - Kubínová, Lucie - Albrechtová, J.
Unbiased estimation of chloroplast number in mesophyll cells: advantage of a genuine three-dimensional approach
.
Journal of Experimental Botany 2014, roč. 65, 2, p. 609-620. ISSN 0022-0957.
IF = 5.526
[ASEP]
[
doi
]
Janáček, Jiří - Čapek, Martin - Michálek, Jan - Karen, Petr - Kubínová, Lucie
.
3D microscopic imaging and evaluation of tubular tissue architecture
.
Physiological Research 2014, roč. 63, suppl.1, s49-s55. ISSN 0862-8408.
IF = 1.293
[ASEP]
Vaněčková, Ivana - Vokurková, Martina - Rauchová, Hana - Dobešová, Zdenka - Pecháňová, O. - Kuneš, Jaroslav - Vorlíček, Jaroslav - Zicha, Josef
.
Chronic antioxidant therapy lowers blood pressure in adult but not in young Dahl salt hypertensive rats: the role of sympathetic nervous system
.
Acta Physiologica, 2013, Vol. 208, 4, p. 340-349
.
IF = 4.382
[ASEP]
[
doi
]
Michálek, Jan - Čapek, Martin
.
A Piecewise Monotone Subgradient Algorithm for Accurate L1 -TV Based Registration of Physical Slices With Discontinuities in Microscopy
.
IEEE Transactions on Medical Imaging, 2013, Vol. 32, 5, p. 901-918
.
IF = 4.027
[ASEP]
[
doi
]
Kubínová, Lucie - Mao, X. W. - Janáček, Jiří
.
Blood Capillary Length Estimation from Three-Dimensional Microscopic Data by Image Analysis and Stereology
.
Microscopy and Microanalysis, 2013, Vol. 19, 4, p. 898-906
.
IF = 2.495
[ASEP]
[
doi
]
Cvetko, E. - Janáček, Jiří - Kubínová, Lucie - Eržen, I.
The capillary pattern in human masseter muscle during ageing
.
Image Analysis and Stereology, 2013, Vol. 32, 3, p. 135-144
.
IF = 0.639
[ASEP]
[
doi
]
Behuliak, Michal - Pintérová, Mária - Bencze, Michal - Petrová, M. - Líšková, Silvia - Karen, Petr - Kuneš, Jaroslav - Vaněčková, Ivana - Zicha, Josef
.
Ca2+ sensitization and Ca2+ entry in the control of blood pressure and adrenergic vasoconstriction in conscious Wistar-Kyoto and spontaneously hypertensive rats
.
Journal of Hypertension, 2013, Vol. 31, 10, p. 2025-2035
.
IF = 3.806
[ASEP]
[
doi
]
Šepitka, J. - Lukeš, J. - Staněk, L. - Filová, Eva - Burdíková, Zuzana - Řezníček, J.
Nanoindentation of intervertebral disc tissues localised by SHG imaging
.
Computer methods in biomechanics and biomedical engineering, 2012, Vol. 15, Suppl.1, p. 335-336
.
IF = 1.393
[ASEP]
[
doi
]
Vohník, Martin - Burdíková, Zuzana - Wilkinson, D. M.
Testate Amoebae Communities in the Rhizosphere of Rhododendron ponticum (Ericaceae) in an Evergreen Broadleaf Forest in Southern Spain
.
Acta Protozoologica, 2012, Vol. 51, Sp. iss.3, p. 259-269
.
IF = 0.984
[ASEP]
[
doi
]
Skalský, I. - Szárszoi, O. - Filová, Elena - Pařízek, Martin - Lytvynets, Andriy - Malušková, J. - Lodererová, A. - Brynda, Eduard - Lisá, Věra - Burdíková, Zuzana - Čapek, Martin - Pirk, J. - Bačáková, Lucie
.
A perivascular system releasing sirolimus prevented intimal hyperplasia in a rabbit model in a medium-term study
.
International Journal of Pharmaceutics, 2012, Vol. 427, 2, p. 311-319
.
IF = 3.458
[ASEP]
[
doi
]
Lhotáková, Z. - Urban, Otmar - Dubánková, M. - Cvikrová, Milena - Tomášková, Ivana - Kubínová, Lucie - Zvára, K. - Marek, Michal V. - Albrechtová, J.
The impact of long-term CO2 enrichment on sun and shade needles of Norway spruce (Picea abies): Photosynthetic performance, needle anatomy and phenolics accumulation
.
Plant Science, 2012, 188-189, JUN, p. 60-70
.
IF = 2.922
[ASEP]
[
doi
]
Jirkovská, M. - Kučera, T. - Kaláb, J. - Jadrníček, M. - Niedobová, V. - Janáček, Jiří - Kubínová, Lucie - Moravcová, M. - Žižka, Z. - Krejčí, V.
The branching pattern of villous capillaries and structural changes of placental terminal villi in type 1 diabetes mellitus
.
Placenta, 2012, Vol. 33, 5, p. 343-351
.
IF = 3.117
[ASEP]
[
doi
]
Janáček, Jiří - Kreft, M. - Čebašek, V. - Eržen, I.
Correcting the axial shrinkage of skeletal muscle thick sections visualized by confocal microscopy
.
Journal of Microscopy, 2012, Vol. 246, 2, p. 107-112
.
IF = 1.633
[ASEP]
[
doi
]
Hudcovic, Tomáš - Kolínská, Jiřina - Klepetář, Jan - Štěpánková, Renata - Řezanka, Tomáš - Šrůtková, Dagmar - Schwarzer, Martin - Erban, V. - Du, Zhengyu - Wells, J. M. - Hrnčíř, Tomáš - Tlaskalová-Hogenová, Helena - Kozáková, Hana
.
Protective effect of Clostridium tyrobutyricum in acute dextran sodium sulphate-induced colitis: differential regulation of tumour necrosis factor-α and interleukin-18 in BALB/c and severe combined immunodeficiency mice
.
Clinical and Experimental Immunology, 2012, Vol. 167, 2, p. 356-365
.
IF = 3.409
[ASEP]
[
doi
]
Cvetko, E. - Karen, Petr - Eržen, I.
Wearing of complete dentures reduces slow fibre and enhances hybrid fibre fraction in masseter muscle
.
Journal of Oral Rehabilitation, 2012, Vol. 39, 8, p. 608-614
.
IF = 2.344
[ASEP]
[
doi
]
Cvetko, E. - Karen, Petr - Eržen, I.
Myosin heavy chain composition of the human sternocleidomastoid muscle
.
Annals of Anatomy-Anatomischer Anzeiger, 2012, Vol. 194, 5, p. 467-472
.
IF = 1.960
[ASEP]
[
doi
]
Cvetko, E. - Karen, Petr - Janáček, Jiří - Kubínová, Lucie - Plasencia, A.L. - Eržen, I.
Human Masseter Muscle Fibers From the Elderly Express Less Neonatal Myosin Than Those of Young Adults
.
Anatomical Record-Advances in Integrative Anatomy and Evolutionary Biology, 2012, Vol. 295, 8, p. 1364-1372
.
IF = 1.343
[ASEP]
[
doi
]
Burdíková, Zuzana - Čapek, Martin - Švindrych, Zdeněk - Gryndler, M. - Kubínová, Lucie - Holcová, K.
Ecology of Testate Amoebae in the Komořany Ponds in the Vltava Basin
.
Microbial Ecology, 2012, Vol. 64, 1, p. 117-130
.
IF = 3.277
[ASEP]
[
doi
]
Váchová, Libuše - Šťovíček, V. - Hlaváček, Otakar - Chernyavskiy, Oleksandr - Štěpánek, L. - Kubínová, Lucie - Palková, Z.
Flo11p, drug efflux pumps, and the extracellular matrix cooperate to form biofilm yeast colonies
.
Journal of Cell Biology, 2011, Vol. 194, 5, p. 679-687
.
IF = 10.264
[ASEP]
[
doi
]
Vohník, Martin - Burdíková, Zuzana - Vyhnal, Aleš - Koukol, O.
Interactions Between Testate Amoebae and Saprotrophic Microfungi in a Scots Pine Litter Microcosm
.
Microbial Ecology, 2011, Vol. 61, 3, p. 660-668
.
IF = 2.912
[ASEP]
[
doi
]
Skalský, I. - Filová, Elena - Szárszoi, O. - Pařízek, Martin - Lytvynets, Andriy - Malušková, J. - Lodererová, A. - Brynda, Eduard - Lisá, Věra - Burdíková, Zuzana - Čapek, Martin - Pirk, J. - Bačáková, Lucie
.
A periadventitial sirolimus-releasing mesh decreased intimal hyperplasia in a rabbit model
.
Physiological Research, 2011, Vol. 60, 3, p. 585-588
.
IF = 1.555
[ASEP]
Philimonenko, Anatoly - Janáček, Jiří - Snyers, L. - Almeder, M. - Berger, W. - Schmidt, W. - Schofer, C. - Hozák, Pavel
.
Chromosomal dynamics of cell cycle regulator gene p21 during transcriptional activation
.
Journal of Structural Biology, 2011, Vol. 173, 2, p. 382-390
.
IF = 3.406
[ASEP]
[
doi
]
Michálek, Jan - Čapek, Martin - Kubínová, Lucie
.
Nonrigid Registration of CLSM Images of Physical Sections with Discontinuous Deformations
.
Microscopy and Microanalysis, 2011, Vol. 17, 6, p. 923-936
.
IF = 3.007
[ASEP]
[
doi
]
Michálek, Jan - Čapek, Martin - Kubínová, Lucie
.
Compensation of inhomogeneous fluorescence signal distribution in 2D images acquired by confocal microscopy
.
Microscopy Research Technique, 2011, Vol. 74, 9, p. 831-838
.
IF = 1.792
[ASEP]
[
doi
]
Líšková, Silvia - Petrová, M. - Karen, Petr - Kuneš, Jaroslav - Zicha, Josef
.
Effects of aging and hypertension on the participation of endothelium-derived constricting factor (EDCF) in norepinephrine-induced contraction of rat femoral artery
.
European Journal of Pharmacology, 2011, Vol. 667, 1-3, p. 265-270
.
IF = 2.516
[ASEP]
[
doi
]
Kozina, V. - Geist, D. - Kubínová, Lucie - Bilic, E. - Karnthaler, H. P. - Waitz, T. - Janáček, Jiří - Chernyavskiy, Oleksandr - Krhen, I. - Ježek, D.
Visualization of Reinke’s crystals in normal and cryptorchid testis
.
Histochemistry and Cell Biology, 2011, Vol. 135, 2, p. 215-228
.
IF = 2.588
[ASEP]
[
doi
]
Kozina, V. - Banek, L. - Kneževič, N. - Geist, D. - Kubínová, Lucie - Kosovič, M. - Rentenberger, Ch. - Vukasovič, A. - Ježek, D.
Reinke´s Crystals in Perivascular and Peritubular Leydig Cells
.
Croatica Chemica Acta, 2011, Vol. 84, 2, p. 159-167
.
IF = 0.763
[ASEP]
[
doi
]
Kochová, P. - Cimrman, R. - Janáček, Jiří - Witter, K. - Tonar, Z.
How to asses, visualize and compare the anisotropy of linear structures reconstructed from optical sections ? A study based on histopathological quantification of human brain microvessels
.
Journal of Theoretical Biology, 2011, Vol. 286, -, p. 67-78
.
IF = 2.208
[ASEP]
[
doi
]
Janáček, Jiří - Cvetko, E. - Kubínová, Lucie - Travnik, L. - Eržen, I.
A novel method for evaluation of capillarity in human skeletal muscles from confocal 3D images
.
Microvascular Research, 2011, Vol. 81, 2, p. 231-238
.
IF = 2.828
[ASEP]
[
doi
]
Hájková, Zuzana - Bugajev, Viktor - Dráberová, Eduarda - Vinopal, Stanislav - Dráberová, Lubica - Janáček, Jiří - Dráber, Petr - Dráber, Pavel
.
STIM1-Directed Reorganization of Microtubules in Activated Mast Cells
.
Journal of Immunology, 2011, Vol. 186, 2, p. 913-923
.
IF = 5.788
[ASEP]
Grausová, Ľubica - Kromka, Alexander - Burdíková, Zuzana - Eckhardt, Adam - Rezek, Bohuslav - Vacík, Jiří - Haenen, K. - Lisá, Věra - Bačáková, Lucie
.
Enhanced Growth and Osteogenic Differentiation of Human Osteoblast-Like Cells on Boron-Doped Nanocrystalline Diamond Thin Films
.
PLoS ONE, 2011, Vol. 6, 6, e20943
.
IF = 4.092
[ASEP]
[
doi
]
Eržen, I. - Janáček, Jiří - Kubínová, Lucie
.
Characterization of the capillary network in skeletal muscles from 3D data
.
Physiological Research, 2011, Vol. 60, 1, p. 1-13
.
IF = 1.555
[ASEP]
Zobrazit více
Buňky linie HEK 293 exprimující fúzní protein receptoru TRH a zeleného fluoreskujícího proteinu (GFP)
A: Laserový konfokální mikroskop Leica SPE s jednofotonovou excitací. B: Laserový konfokální mikroskop Leica SP2 AOBS MP s jedno- i dvoufotonovou excitací.
.jpg)
