Naše skupina se zabývá strukturní biologií (vztahy mezi strukturou a funkcí určitých skupin bílkovin), konkrétně se zaměřujeme na proteiny, které se účastní přenosu signálu v buňce. Mezi metody, které využíváme, patří příprava proteinů a jejich komplexů, základní biofyzikální charakterizace, charakterizace mezimolekulových interakcí a studium struktury a interakčních povrchů. Všechny tyto metody nám umožňují lépe pochopit detaily, jak je regulována aktivita a funkce protein-proteinových komplexů. Zabýváme se především výzkumem v těchto oblastech:
- Strukturní biologie 14-3-3 proteinů a jejich vazebných partnerů
- Mechanismus regulace proteinkinas CaMKK1, CaMKK2 a ASK1
- Studium inhibice proteasy caspasy-2 a ligásy Nedd4-2 pomocí proteinu 14-3-3
- Studium DNA-vazebné domény transkripčního faktoru FOXO4
EXTERNÍ WEBOVÉ STRÁNKY ODDĚLENÍ
Aktuální projekty
Náš výzkum umožnil strukturní náhled na komplexy ASK1 kinasy s jejími dvěma přirozenými inhibitory: proteinem 14-3-3 a thioredoxinem. Naše data by mohla být důležitá k porozumění procesu inhibice ASK1 stejně tak jako úlohu proteinů 14-3-3 v regulaci ostatních enzymů.
Více
Regulátor G-proteinové signalizace (RGS3) se váže na Gα-GTP komplex a zvyšuje tak jeho vnitřní GTPasovou aktivitu - ukončuje přenos signálu. Fosducin (Pdc) je vysoce konzervovaný fosfoprotein, který hraje důležitou roli v regulaci G-proteinové signalizace, kontroly transkripce a regulaci krevního tlaku. Pdc i RGS3 jsou negativně regulovány fosforylací a vazbou proteinu 14-3-3.
Více
Naše výsledky poskytují strukturní pohled na aktivaci kvasničné neutrální trehalasy Nth1 prostřednictvím proteinů 14-3-3. Naše data by mohla být důležitá k porozumění procesu aktivace Nth1 stejně tak jako úloze proteinů 14-3-3 v regulaci ostatních enzymů.
Více
Úspěchy
Studie otištěná v prestižním časopise eLife identifikuje nízkomolekulární sloučeniny, které interagují s transkripčním faktorem Forkhead box O3 (FOXO3) a modulují tak jeho aktivitu.
Více
We obtained the first prize for the best publication in Physiological Research with the young authors from for the year 2018.
Více
We got the prize for the best publication of the Institute of Physiology for year 2017 for the publication:
Alblova M, Smidova A, Docekal V, Vesely J, Herman P, Obsilova V, Obsil T. :
Molecular basis of the 14-3-3 protein-dependent activation of yeast neutral trehalase Nth1.
Proc Natl Acad Sci U S A. (2017) 114:E9811-E9820. IF = 9.504.
Více
Our new paper in PNAS:
Alblova M, Smidova A, Docekal V, Vesely J, Herman P, Obsilova V, Obsil T.
Molecular basis of the 14-3-3 protein-dependent activation of yeast neutral trehalase Nth1.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Oct 30. pii: 201714491. doi: 10.1073/pnas.1714491114.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29087344
Více
Our new paper in JBC: August 2016 Structural Insight into the 14-3-3 Protein-Dependent Inhibition of Protein Kinase ASK1.
Petrvalska O, Kosek D, Kukacka Z, Tosner Z, Man P, Vecer J, Herman P, Obsilova V and Obsil T. J. Biol. Chem. jbc.M116.724310.
First Published on August 11, 2016, doi:10.1074/jbc.M116.724310
Více
Zobrazit více
Publikace
Pšenáková; Katarína - Hexnerová; Rozálie - Srb; Pavel - Obšilová; Veronika - Veverka; Václav - Obšil; Tomáš
.
The redox-active site of thioredoxin is directly involved in apoptosis signal-regulating kinase 1 binding that is modulated by oxidative stress
.
FEBS Journal. 2020; 287(8); 1626); 1644
.
IF = 4.392
[ASEP]
[
doi
]
Kalábová; Dana - Filandr; František - Alblová; Miroslava - Petrvalská; Olivia - Horváth; Matej - Man; Petr - Obšil; Tomáš - Obšilová; Veronika
.
14-3-3 protein binding blocks the dimerization interface of caspase-2
.
FEBS Journal. 2020; 287(16); 3494-3510
.
IF = 4.392
[ASEP]
[
doi
]
Valenti; D. - Neves; J. F. - Cantrelle; F. X. - Hristeva; S. - Santo Lentini; D. - Obšil; Tomáš - Hanoulle; X. - Levy; L. M. - Tzalis; D. - Landrieu; I. - Ottmann; Ch.
Set-up and screening of a fragment library targeting the 14-3-3 protein interface
.
MedChemComm. 2019; 10(10); 1796-1802
.
IF = 2.807
[ASEP]
[
doi
]
Šmídová; Aneta - Staňková; Kateřina - Petrvalská; Olivia - Lazar; Josef - Sychrová; Hana - Obšil; Tomáš - Zimmermannová; Olga - Obšilová; Veronika
.
The activity of Saccharomyces cerevisiae Na+; K+/H+ antiporter Nha1 is negatively regulated by 14-3-3 protein binding at serine 481
.
Biochimica Et Biophysica Acta-Molecular Cell Research. 2019; 1866(12)); 118534
.
IF = 4.105
[ASEP]
[
doi
]
Pšenáková; Katarína - Kohoutová; K. - Obšilová; Veronika - Ausserlechner; M. J. - Veverka; Václav - Obšil; Tomáš
.
Forkhead Domains of FOXO Transcription Factors Differ in both Overall Conformation and Dynamics
.
Cells. 2019; 8(9)); 966
.
IF = 4.366
[ASEP]
[
doi
]
Zobrazit více
Detailní náhled na strukturu komplexu proteinů 14-3-3 a Nth1 (PDB 5M4A) Alblova et al. (2017).
A) Identifikace klíčových fosforylačních míst zodpovědných za aktivaci neutrální trehalasy Nth1 proteinem Bmh1. B) Pokles kinetiky výměny vodíku za deuterium indukované vazbou proteinu Bmh1 pro peptid zahrnující vápníkovou doménu, který se nachází na vazebném rozhraní obou proteinů. C) Struktura s nízkým rozlišením komplexu Nth1:Bmh1 získaná z měření maloúhlového rozptylu světla SAXS. Veisova et al. (2012), Macakova et al. (2013), Kopecka et al. (2014).
Protein 14-3-3 interaguje s N- i C-koncovými Gtβγ vazebnými rozhraními fosducinu. Kacirova et al. (2015).
