Veškerá publikační činnost pracovníků MÚA je evidována v databázi ASEP:
MÚA AV ČR (od r. 2006), Archiv AV ČR (do r. 2005), Masarykův ústav AV ČR (do r . 2005).
Československo a Svatý stolec
Ediční řada je věnována vzájemným vztahům mezi Československem a Svatým stolcem v prvním desetiletí existence meziválečného Československa a je výsledkem několikaletého výzkumu v českých i vatikánských archivech. Dokumenty jsou publikovány v jazyce originálu a doplněny anotacemi, vysvětlivkami a dalším edičním aparátem.
Dosud vyšlo:
- Československo a Svatý stolec. Od nepřátelství ke spolupráci (1918–1928). I. Úvodní studie
- Československo a Svatý stolec. II/1. Kongregace pro mimořádné církevní záležitosti (1919–1925). Výběrová edice dokumentů
- Československo a Svatý stolec. II/3. Kongregace pro mimořádné církevní záležitosti, 1929–1931. Edice dokumentů
- Československo a Svatý stolec. III. Diplomatická korespondence a další dokumenty (1917–1928). Výběrová edice
- Československo a Svatý stolec. IV. Diplomatická korespondence a další dokumenty, 1928–1934. Výběrová edice
- Československo a Svatý stolec. V. Éra nuncia Pietra Ciriaciho
Pavel Helan (ed.)
Eva Hajdinová – Dagmar Hájková – Pavel Helan – Francesco Caccamo – Jitka...
Marek Šmíd a kol. (eds.)
Pavel Helan – Jaroslav Šebek (eds.)
Michal Pehr – Jaroslav Šebek