13. května 2008: Bývalá ředitelka našeho ústavu, doktorka Ivana Macháčková, obdržela Medaili za zásluhy Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy. Převzala ji dnes od děkana fakulty, profesora Pavla Kováře.

21. dubna 2008: Renomovaný chemický časopis Journal of Chromatography ocenil práci doktorů Petra Dobreva a Miroslava Kamínka. Jednu z jejich publikací zařadil mezi nejcitovanější články z let 2002 až 2007.

28. února 2008: Náš kolega, docent Jan Krekule, v krátké době již podruhé „zabodoval“. Dnes mu byla v Karolinu předána Stříbrná medaile Univerzity Karlovy v Praze. Získal ji za celoživotní vědeckou činnost a popularizaci experimentální biologie rostlin.

29. ledna 2008: Docent Jan Krekule, dlouholetý pracovník našeho ústavu a vynikající popularizátor rostlinné biologie, získal za svou popularizační práci prestižní ocenění - medaili Vojtěcha Náprstka, kterou uděluje Akademie věd České Republiky.

26. listopadu 2007: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy udělilo Medaili I. stupně doktoru Janu Petráškovi z Ústavu experimentální botaniky. Doktor Petrášek zkoumá, jak je řízen pohyb hormonu auxinu rostlinným tělem. Jde bez přehánění o horké téma dnešní biologie.

15. května 2007: Doktor Jiří Velemínský získal nejvyšší ocenění Akademie věd České Republiky, medaili „De scientia et humanitate optime meritis“.

15. května 2007: Předseda Akademie věd České republiky, profesor Václav Pačes, udělil Medaili Gregora Johanna Mendela za zásluhy v biologických vědách doktorce Ivaně Macháčkové.