Intranet Areál web

Strukturní biologie signálních proteinů

Strukturní biologie signálních proteinů

Naše skupina se zabývá strukturní biologií (vztahy mezi strukturou a funkcí určitých skupin bílkovin), konkrétně se zaměřujeme na proteiny, které se účastní přenosu signálu v buňce. Mezi metody, které využíváme, patří příprava proteinů a jejich komplexů, základní biofyzikální charakterizace, charakterizace mezimolekulových interakcí a studium struktury a interakčních povrchů. Všechny tyto metody nám umožňují lépe pochopit detaily, jak je regulována aktivita a funkce protein-proteinových komplexů. Zabýváme se především výzkumem v těchto oblastech:

  • Strukturní biologie 14-3-3 proteinů a jejich vazebných partnerů
  • Mechanismus regulace proteinkinas CaMKK1, CaMKK2 a ASK1
  • Studium inhibice proteasy caspasy-2 a ligásy Nedd4-2 pomocí proteinu 14-3-3
  • Studium DNA-vazebné domény transkripčního faktoru FOXO4

​EXTERNÍ WEBOVÉ STRÁNKY ODDĚLENÍ

Aktuální projekty

Mechanismus regulace proteinkinasové aktivity ASK1

Náš výzkum umožnil strukturní náhled na komplexy ASK1 kinasy s jejími dvěma přirozenými inhibitory: proteinem 14-3-3 a thioredoxinem. Naše data by mohla být důležitá k porozumění procesu inhibice ASK1 stejně tak jako úlohu proteinů 14-3-3 v regulaci ostatních enzymů. Více

Studium regulačních proteinů účastnících se G-proteinové signalizace: RGS3 a fosducinu.

Regulátor G-proteinové signalizace (RGS3) se váže na Gα-GTP komplex a zvyšuje tak jeho vnitřní GTPasovou aktivitu - ukončuje přenos signálu. Fosducin (Pdc) je vysoce konzervovaný fosfoprotein, který hraje důležitou roli v regulaci G-proteinové signalizace, kontroly transkripce a regulaci krevního tlaku. Pdc i RGS3 jsou negativně regulovány fosforylací a vazbou proteinu 14-3-3.  Více

Úspěchy

NOVÉ POZNATKY O STRUKTUŘE KOMPLEXU FOXO4:p53 – KLÍČOVÉHO FAKTORU V REGULACI STÁRNUTÍ BUNĚK (9.4.2022)

NOVÉ POZNATKY O STRUKTUŘE KOMPLEXU FOXO4:p53 – KLÍČOVÉHO FAKTORU V REGULACI STÁRNUTÍ BUNĚK (9.4.2022)

Transkripční faktor p53 brání tomu, aby se vlivem stresu staly z normálních buněk buňky nádorové. Za stresových podmínek p53 interaguje s dalším transkripčním faktorem FOXO4 (Forkhead box O 4) a společně pak zvyšují produkci proteinu p21, což spouští proces stárnutí buňky (senescenci). Molekulární mechanismus zvyšování transkripce p21 je však stále nejasný. V práci  publikované v časopise Protein Science vědecké týmy Dr. Obšilové (FGÚ AV ČR), prof. Obšila (PřF UK a FGÚ AV ČR) a jejich kolegů z ÚOCHB AV ČR charakterizovali vzájemné interakce proteinů p53 a FOXO4 na molekulární úrovni. Nové poznatky o struktuře komplexu naleznou využití při vývoji specifických inhibitorů interakce mezi oběma proteiny, a následně pak při vývoji nových léčiv zaměřených na selektivní eliminaci senescentních buněk. Více
Naše nové dva články v Communications Biology

Naše nové dva články v Communications Biology

Two accepted papers in Communications Biology: July and August 2021 Pavel Pohl, Rohit Joshi, Olivia Petrvalska, Tomas Obsil and Veronika Obsilova 14-3-3-protein regulates Nedd4-2 by modulating interactions between HECT and WW domains | Communications Biology (nature.com) Commun. Biol. 2021 July 22; 4(1):899. Matej Horvath, Olivia Petrvalska, Petr Herman, Tomas Obsil and Veronika Obsilova 14-3-3 proteins inactivate DAPK2 by promoting its dimerization and protecting key regulatory phosphosites | Communications Biology (nature.com) Commun. Biol. 2021 August 19; 4(1):986. IF = 6.268 Více

Nejlepší publikace s autory z FGÚ za rok 2017

We got the prize for the best publication of the Institute of Physiology for year 2017 for the publication: Alblova M, Smidova A, Docekal V, Vesely J, Herman P, Obsilova V, Obsil T. : Molecular basis of the 14-3-3 protein-dependent activation of yeast neutral trehalase Nth1. Proc Natl Acad Sci U S A. (2017) 114:E9811-E9820. IF = 9.504. Více

Publikace

Pohl; Pavel - Joshi; Rohit - Petrvalská; Olivia - Obšil; Tomáš - Obšilová; Veronika . 14-3-3-protein regulates Nedd4-2 by modulating interactions between HECT and WW domains . Communications Biology. 2021; 4(1)); 899 . IF = 6.268 [ASEP] [ doi ]
Obšilová; Veronika - Honzejková; K. - Obšil; Tomáš . Structural Insights Support Targeting ASK1 Kinase for Therapeutic Interventions . International Journal of Molecular Sciences. 2021; 22(24)); 13395 . IF = 5.924 [ASEP] [ doi ]
Neves; J. F. - Petrvalská; Olivia - Bosica; F. - Cantrelle; F. X. - Merzougui; H. - O'Mahony; G. - Hanoulle; X. - Obšil; Tomáš - Landrieu; I. Phosphorylated full-length Tau interacts with 14-3-3 proteins via two short phosphorylated sequences; each occupying a binding groove of 14-3-3 dimer . FEBS Journal. 2021; 288(6); 1918-1934 . IF = 5.542 [ASEP] [ doi ]
Košek; Dalibor - Grabundzija; I. - Lei; H. - Bilic; I. - Wang; H. - Jin; Y. - Peaslee; G. F. - Hickman; A. B. - Dyda; F. The large bat Helitron DNA transposase forms a compact monomeric assembly that buries and protects its covalently bound 5 '-transposon end . Molecular Cell. 2021; 81(20); 4271-4286.e4 . IF = 17.970 [ASEP] [ doi ]
Horváth; Matej - Petrvalská; Olivia - Herman; P. - Obšilová; Veronika - Obšil; Tomáš . 14-3-3 proteins inactivate DAPK2 by promoting its dimerization and protecting key regulatory phosphosites . Communications Biology. 2021; 4(1)); 986 . IF = 6.268 [ASEP] [ doi ]
Boušová; Kristýna - Bednárová; Lucie - Zouharová; Monika - Vetýšková; Veronika - Poštulková; Klára - Hofbauerová; Kateřina - Petrvalská; Olivia - Vaněk; O. - Tripsianes; K. - Vondrášek; Jiří . The order of PDZ3 and TrpCage in fusion chimeras determines their properties—a biophysical characterization . Protein Science. 2021; 30(8); 1653-1666 . IF = 6.725 [ASEP] [ doi ]
Santo Lentini; D. - Petrvalská; Olivia - Obšilová; Veronika - Ottmann; Ch. - Obšil; Tomáš . Stabilization of Protein-Protein Interactions between CaMKK2 and 14-3-3 by Fusicoccins . ACS Chemical Biology. 2020; 15(11); 3060-3071 . IF = 5.100 [ASEP] [ doi ]
Pšenáková; Katarína - Hexnerová; Rozálie - Srb; Pavel - Obšilová; Veronika - Veverka; Václav - Obšil; Tomáš . The redox-active site of thioredoxin is directly involved in apoptosis signal-regulating kinase 1 binding that is modulated by oxidative stress . FEBS Journal. 2020; 287(8); 1626); 1644 . IF = 5.542 [ASEP] [ doi ]
Obšilová; Veronika - Obšil; Tomáš . The 14-3-3 Proteins as Important Allosteric Regulators of Protein Kinases . International Journal of Molecular Sciences. 2020; 21(22)); 8824 . IF = 5.923 [ASEP] [ doi ]
Obšilová; Veronika - Obšil; Tomáš . A new role for 14-3-3 protein in steroidogenesis . FEBS Journal. 2020; 287(18); 3921-3924 . IF = 5.542 [ASEP] [ doi ]

Fotogalerie oddělení

Celá fotogalerie

Lidé

RNDr. Veronika Obšilová, Ph.D.

vedoucí oddělení

Prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.
zástupce vedoucí oddělení (part time)

MgrDalibor Košek, Ph.D.
vědecký pracovník

RNDrOlívia Petrvalská, Ph.D.
vědecký pracovník
Mgr. Pavel Pohl
postgraduální student

M.Sc. Rohit Ashok Joshi
postgraduální student

M.Sc. Maša Janošev
postgraduální student
M.Sc. Raju Mandal
ext.- postgraduální student
Mgr. Karolína Honzejková
postgraduální student (part time)

Mgr. Klára Kohoutová
postgraduální student (part time)

Andrej Tekel
ext.- pregraduální student
Bc. Zuzana Janáčková
ext. - pregraduální student
Adam Brzezina
ext.- pregraduální student

Josef Kočnar
ext.- pregraduální student

Mgr. Dana Kalábová
technický pracovník

Bc. Gabriela Kočárová
technický pracovník