- Úvod
- Ústav
- Lidé
- Výzkum
- Aplikace
- Semináře a akce
- Knihovna
- Doktorské studium
- Kariéra
Tým výzkumníků Ústavu informatiky se na jaře 2020 zapojil do multi-disciplinárního projektu tvorby epidemiologických modelů v rámci iniciativy Model antiCOVID-19 pro ČR při CERGE-EI. Vyvinuli jsme detailní simulaci okresního města a okolí, na které lze zkoumat šíření epidemie a vliv proti-epidemických opatření.
V září se Ústav informatiky AV ČR společně s pracovníky Ústavu teorie informace a automatizace AV ČR (ÚTIA) a CERGE-EI stal spoluřešitelským pracovištěm projektu TAČR EpiCity – město pro lidi, ne pro virus (program ETA), v rámci kterého vzniká obecný softwarový nástroj pro simulaci epidemie na grafu sociálních kontaktů. V rámci tohoto projektu se 13.11.2020 uskutečnila konference Covid v modelech a datech, kterou Ústav informatiky AV ČR spolupořádal.
Tým epidemiologického modelování úzce spolupracuje s řadou pracovišť AV ČR (Biologické centrum AV ČR, CERGE-EI, ÚTIA) a dalších subjektů od Univerzity Karlovy (FF UK, 3.LF UK) po projekt Život během pandemie (PAQ research). V rámci nově vzniklého Centra pro modelování biologických a společenských procesů (www.bisop.eu) se výzkumníci z Ústavu informatiky AV ČR snaží prezentovat výsledky svých modelů státní správě i široké veřejnosti (viz například vystoupení našeho pracovníka dr. Romana Nerudy v pořadu Události a komentáře ČT 24 dne 10.11.2020.
In ISCB 2021: 42nd Annual Conference of the International Society for Biostatistics: Final Programme & Book of Abstracts, strana 244-244 , .
The term circular statistics describes a set of techniques used to model distributions of random variables that are cyclic in nature and these approaches can be easily adapted to temporal data recorded, e.g., daily, weekly or monthly. One of the nonparametric possibilities how to analyze these data is through kernel estimations of circular densities where the problem of how much to smooth, i.e., how to choose the bandwidth, is crucial. In this presentation we describe the existing methods: cross-validation method, smoothed cross-validation, adaptive method and propose their modifications. We apply these methods on real data from the Institute of health information and statistics of the Czech Republic about total (cumulative) number of persons with a proven COVID-19 infection according to regional hygienic stations, number of cured persons, number of deaths and tests performed for whole country and regions coded based on nomenclature of territorial units for Statistics (NUTS). The results are visualized as circular histograms (rose diagrams) and calculated standardized characteristics are superimposed with choropleth map, where NUTS are shaded in diverging color scheme. All statistical analyses are performed in the R software.
In Poučení z pandemie COVID-19. Program konference , .
In Poučení z pandemie COVID-19. Program konference , .
ProLekare.cz, 24. 3. 2021,
Proč antigenní test umožňuje poměrně úspěšně potvrdit infekci koronavirem u pacienta testovaného dobře zaškolenými zdravotníky a proč naopak odborníci nedoporučují využití antigenních testů v plošném měřítku, například ve školách. Z čeho mají obavy? Na celou problematiku se podíváme z pohledu matematických zákonitostí i klinické praxe a reality.
ProLekare.cz, 8. 4. 2021,
Koronavirová epidemie omezila přístup ke vzdělání jednomu a čtvrt milionu dětí v Česku již ve dvou školních rocích. Smyslem zavedení distanční výuky bylo zamezit šíření infekce populací, ale při zavádění těchto opatření se nebere zřetel na publikované vědecké studie sledující infekčnost dětí. Cílem tohoto sdělení je upozornit jednak na první českou epidemiologickou studii provedenou u dětí a mladé populace, a zároveň na zahraniční práce, jež se této tématice věnují.
In Deník N, svazek 3. března 2021 , 2021, ISSN 2571-1717.
„Jste plavčík a na obou koncích bazénu se zároveň topí dva lidé. Pak nemáte povinnost zachránit oba. Musíte udělat volbu. A to je přesně ta situace, kdy má lékař jeden ventilátor a dva pacienty,“ říká expert na medicínskou etiku David Černý v rozhovoru o triáži pacientů, ke které už v českých nemocnicích dochází. A o tom, že ministerstvo nechalo lékaře napospas situaci, kterou nezavinili.
CNN Prima News, 2020,
Andrej Babiš by chtěl před Vánoci zrealizovat dobrovolné plošné testování antigenními testy. To by mohlo ze společnosti vyčlenit bezpříznakové jedince, ale právě tyto testy zkreslují realitu, která nyní vypadá pozitivnější, než doopravdy je. V pořadu 360° Pavlíny Wolfové to řekl informatik Roman Neruda.
CNN Prima News, 2020,
Počet nakažených koronavirem stále stoupá a mnoho z nás má své teorie, jak se bude situace vyvíjet dále. Co si o vývoji ale myslí informatici? Na to v Novém dni odpovídal Roman Neruda z Centra pro modelování biologických a společenských procesů
Česká televize, 2020,
Opatření proti šíření nemoci covid-19 by neměla být před Vánoci rozvolňována, domnívá se informatik Roman Neruda z Centra pro modelování biologických a společenských procesů. Epidemie podle něj zpomaluje, ale ne dostatečně rychle. Pokud zůstaneme u současných opatření, nehrozí ale podle něj již větší přetížení nemocnic.
In Sympozium: Změny chování české populace v době COVID-19 a jejich reflexe v epidemiologických modelech , .
In Deník N, svazek Online 2. listopadu 2020 , 2020, ISSN 2571-1717.
Oficiální počty nakažených koronavirem v posledním týdnu mírně poklesly, což po měsících rychlého růstu všichni sledujeme s jistou úlevou. Nejen podle informatika Romana Nerudy, který se podílí na tvorbě epidemiologických modelů, bychom však s optimismem měli zatím šetřit. „Jsme přesvědčení, že i kdyby se to teď opravdu začalo snižovat, pořád by se ještě vyplatilo šlápnout víc na brzdu, abychom denní přírůstky dostali v kratším čase k tisícovce, kdy začne efektivně fungovat trasování. Ted jsme rozhodně vzdáleni od jakéhokoli rozvolňování.“
In Konference COVID v modelech , .
In NZIS Open 2020 , .
In Den otevřených dveří Ústavu informatiky AV ČR , .
In 41. imunoanalytické dny 11. ročník workshopu personalizované medicíny. Sborník abstraktů , .