Servisní laboratoř funkční genomiky a bioinformatiky
| Místo |
ÚMG – budova F, místnosti 2.51, 2.64 |
| Kontakt |
Tel.: 29644 3148 (laboratoř), 24106 3412 (vedoucí) |
| Dokumenty |
Ceník
Poptávkový formulář(nový ceník je v prípravě) |
O pracovišti
V rámci servisní laboratoře zpracováváme vzorky pro funkční genomiku a transkriptomiku, včetně analýz na úrovni jednotlivých buněk, a poskytujeme NGS sekvenační služby. Nabízíme konzultace k projektům a experimentálnímu designu. Provádíme primární bioinformatickou analýzu dat. Služby poskytujeme výzkumným skupinám Ústavu molekulární genetiky, ostatním akademickým institucím i komerčním subjektům.
Servisní laboratoř je vybavena sekvenátory Illumina NextSeq 500 a Oxford Nanopore Minion Mk1b, dvěma systémy pro přípravu knihoven z jednotlivých buněk (10x Genomics Chromium Controller a Bio-Rad ddSEQ), dvěma RT-qPCR cyklery (Roche LC480), dvěma staršími microarray platformami (Affymetrix GeneChip System a Illumina BeadStation 500) a čtečkou EnVision Plate Reader od PerkinElmer. Laboratoř dále provozuje přístroje pro analýzu kvality a kvantity analyzovaných vzorků (spektrofotometr Nanodrop, fluorimetr Qubit, kapilární elektroforézy Agilent Bioanalyzer 2100 a Agilent Fragment Analyzer 5200). Jako sdílené vybavení jsou k dispozici dva ultrazvukové sonikátory (Covaris ME 220 a Bioruptor).
Servisní laboratoř je součástí Oddělení genomiky a bioinformatiky.
Pracovníci
Galerie
Pravidla pro přístup do laboratoře
Přístup pro interní uživatele
Interním uživatelem servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky je každý uživatel přístrojového vybavení laboratoří, který je zaměstnancem ÚMG.
Pro využívání služeb servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky musí mít interní uživatel založen uživatelský účet v systému pro správu identit uživatelů v síti img.cas.cz s oprávněním pro přihlašování na počítače v servisních laboratořích.
Registrační procedura
Přihlašte se do rezervačního systému Calpendo na ÚMG. Pokud chcete využívat služby servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky (FGB), zaregistrujte se do facility dle instrukcí na stránce Register facility.
Přístup pro externí uživatele
Externím uživatelem servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky je každý uživatel přístrojového vybavení laboratoří, který není zaměstnancem ÚMG.
Pro využívání služeb servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky musí mít externí uživatel založen uživatelský účet v systému pro správu identit uživatelů v síti img.cas.cz s oprávněním pro přihlašování na počítače v servisních laboratořích.
Pracovníci servisní laboratoře mohou kdykoliv požádat o zrušení přístupu externího uživatele.
Registrační procedura
Prosím neregistrujte se, pokud jste již uživatelem rezervačního systému Calpendo na ÚMG. Pokud chcete využívat služby servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky (FGB), zaregistrujte se do facility dle instrukcí na stránce Register facility.
Prosím zaregistrujte se, pokud ještě nejste uživatelem rezervačního systému Calpendo na ÚMG.
- Pro zřízení přístupu ke službám servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky se prosím zaregistrujte prostřednictvím tohoto odkazu.
- Vyplňte prosím formulář a uveďte veškeré potřebné informace o vašem zaměstnavateli, vaše kontaktní údaje a kontaktní údaje na vašeho nadřízeného
- Odešlete žádost o registraci stisknutím Submit.
- Bude vám zasláno potvrzení o příjetí žádosti na vaši emailovou adresu a vaše žádost bude vyřízena pracovníky servisní laboratoře.
- Poté co vám budou předány přístupové údaje a registrace do servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky potvrzena vaším nadřízeným, budete informován prostřednictvím emailu a od té chvíle můžete vstupovat do rezervačního systému a začít využívat služeb servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky.
Poslední změna:
30. srpen 2021
