Metabolismus bioaktivních lipidů
Oddělení se zaměřuje na analýzu lipidových mediatorů (eikosanoidů, docosanoidů, endocannabinoidů) v tukové tkáni pomocí metody UPLC-MS/MS, především na identifikaci zdroje produkce jednotlivých mediátorů a jejich vliv na metabolismus a zánětlivé vlastnosti buněk tukové tkáně (adipocyty vs. makrofágy). V současné době zkoumá antidiabetické lipidy z rodiny větvených esterů hydroxymastných kyselin. Dále jsou rozvíjeny nové metody pro studování metabolismu a metabolických drah pomocí platformy LIMeX.
V případě zájmu o Bc., Mgr., Ing. nebo Ph.D. práci v oblasti biochemie, analytické chemie, fyziologie nebo příbuzných oborů pošlete, prosím, email ohledně možných témat a jejich vypsání. Témata se dynamicky mění.
GTTAtlas - interaktivní metabolomický a lipidomický atlas myších tkání během orálního glukózového tolerančního testu (OGTT).
MetaboAtlas21 - zevrubný atlas myšího metabolomu a lipidomu.
Téma bakalářské práce: Analýza vzniku ketolátek během lipogeneze pomocí LC-MS (PřF UK 2022/2023+, Analytická chemie)
Téma diplomové práce: Analýza vzniku a metabolismu ketolátek pomocí LC-MS (PřF UK 2022/2023+, Analytická chemie)
Aktuální projekty
Bílá tuková tkáň (WAT) je komplexní endokrinní orgán a subklinický zánět této tkáně během obezity přispívá s rozvoji metabolických onemocnění. V roce 2014 byla objevena nová třída lipidových mediátorů pocházejících z WAT – větvené estery oxidovaných mastných kyselin (FAHFA). FAHFA jsou endogenní lipidy s protizánětlivými a antidiabetickými vlastnostmi, včetně zvýšení glukózové tolerance a sekrece inzulínu a glukagonu podobného peptidu 1 (GLP-1) při současném snížení zánětlivých odpovědí [1-5].
Více
Software:
GTTAtlas
MetaboAtlas21
Mapper
Reaction network viewer
a výběr speciálních metod z oblasti metabolomiky, lipidomiky a fluxomiky.
Více
Přirozeně se vyskytující omega-3 PUFA s dlouhým řetězcem, jmenovitě kyselina eikosapentaenová (EPA; 20: 5 co-3), kyselina dokosapentaenová (DPA; 22: 5 co-3) a kyselina dokosahexaenová (DHA; 22: 6 co-3) vykazují více biologických účinků ...
Více
Naše laboratoř se účastní projektu Otevřená věda s projekty...
Více
We run local instances of several services focused on Metabolomics, Lipidomics, Statistical analysis and Chemometrics. As the hardware resources are limited, these tools are available only within campus LAN.
Více
Zobrazit více
Úspěchy
Více
Grant GA20-00317S Nové metabolické dráhy syntézy antidiabetických lipokinů (2020-2022) byl udělen naší laboratoři.
Více
Akademie věd ČR rozjíždí velkorysý program dotací pro úspěšné vědce a vědkyně mladší a střední generace s mezinárodními zkušenostmi. Prémie Lumina quaeruntur finančně podpoří perspektivní badatele, kteří si můžou sestavit svůj vlastní výzkumný tým na dobu až pěti let. Akademie věd představila program i jeho prvních šest laureátů na slavnostním ceremoniálu na Národní třídě ve čtvrtek 17. ledna.
Prvními nositeli stipendia je šest vědců z různorodých oborů, přičemž šanci mají i zahraniční vědci, kteří působí v rámci Akademie věd ČR. Mezi oceněnými je i Ondřej Kuda, specialista na metabolismus bioaktivních lipidů, který úzce souvisí s výzkumem cukrovky 2. typu.
Lumina Quaeruntur
Více
Publikace
Štěpán; M. - Daďová; K. - Matouš; M. - Krauzová; E. - Sontáková; L. - Koc; M. - Larsen; T. - Kuda; Ondřej - Štich; V. - Rossmeislová; L. - Šiklová; M.
Exercise Training Combined with Calanus Oil Supplementation Improves the Central Cardiodynamic Function in Older Women
.
Nutrients. 2022; 14(1)); 149
.
IF = 5.719
[ASEP]
[
doi
]
Riečan; Martin - Palůchová; Veronika - Lopes; Magno - Brejchová; Kristýna - Kuda; Ondřej
.
Branched and linear fatty acid esters of hydroxy fatty acids (FAHFA) relevant to human health
.
Pharmacology and Therapeutics. 2022; 231(Mar)); 107972
.
IF = 12.310
[ASEP]
[
doi
]
Fisk; H. L. - Childs; C. E. - Miles; E. A. - Ayres; R. - Noakes; P. S. - Paras-Chavez; C. - Kuda; Ondřej - Kopecký; Jan - Antoun; E. - Lillycrop; K. A. - Calder; P. C.
Modification of subcutaneous white adipose tissue inflammation by omega-3 fatty acids is limited in human obesity-a double blind; randomised clinical trial
.
EBioMedicine. 2022; 77(Mar)); 103909
.
IF = 8.143
[ASEP]
[
doi
]
Sistilli; Gabriella - Kalendová; Veronika - Čajka; Tomáš - Irodenko; Ilaria - Bardová; Kristina - Oseeva; Marina - Žáček; P. - Kroupová; Petra - Horáková; Olga - Lackner; K. - Gastaldelli; A. - Kuda; Ondřej - Kopecký; Jan - Rossmeisl; Martin
.
Krill Oil Supplementation Reduces Exacerbated Hepatic Steatosis Induced by Thermoneutral Housing in Mice with Diet-Induced Obesity
.
Nutrients. 2021; 13(2)); 437
.
IF = 5.717
[ASEP]
[
doi
]
Lopes; Magno Alves - Brejchová; Kristýna - Riečan; Martin - Nováková; Michaela - Rossmeisl; Martin - Čajka; Tomáš - Kuda; Ondřej
.
Metabolomics atlas of oral 13C-glucose tolerance test in mice
.
Cell Reports. 2021; 37(2)); 109833
.
IF = 9.423
[ASEP]
[
doi
]
Leal; L. G. - Lopes; Magno Alves - Peres; S. B. - Batista; M. L.; Jr.
Exercise Training as Therapeutic Approach in Cancer Cachexia: A Review of Potential Anti-inflammatory Effect on Muscle Wasting
.
Frontiers in physiology. 2021; 11(Feb 4)); 570170
.
IF = 4.566
[ASEP]
[
doi
]
Jacome-Sosa; M. - Miao; Z.-F. - Peche; V. S. - Morris; E. F. - Narendran; R. - Pietka; K. M. - Samovski; D. - Lo; H.-Y. G. - Pietka; T. - Varro; A. - Love-Gregory; L. - Goldenring; J. R. - Kuda; Ondřej - Gamanzon; E. R. - Mills; J. C. - Abumrad; N. A.
CD36 maintains the gastric mucosa and associates with gastric disease
.
Communications Biology. 2021; 4(1)); 1247
.
IF = 6.268
[ASEP]
[
doi
]
Fisk; H. L. - Childs; C. E. - Miles; E. A. - Ayres; R. - Noakes; P. S. - Paras-Chaves; C. - Kuda; Ondřej - Kopecký; Jan - Antoun; E. - Lillycrop; K. A. - Calder; P. C.
Dysregulation of endocannabinoid concentrations in human subcutaneous adipose tissue in obesity and modulation by omega-3 polyunsaturated fatty acids
.
Clinical science. 2021; 135(1); 185-200
.
IF = 6.124
[ASEP]
[
doi
]
Daňhelovská; T. - Zdražilová; L. - Štufková; H. - Vanišová; M. - Volfová; N. - Křížová; J. - Kuda; Ondřej - Sládková; J. - Tesařová; M.
Knock-Out of ACBD3 Leads to Dispersed Golgi Structure; but Unaffected Mitochondrial Functions in HEK293 and HeLa Cells
.
International Journal of Molecular Sciences. 2021; 22(14)); 7270
.
IF = 5.923
[ASEP]
[
doi
]
Bugajev; Viktor - Paulenda; Tomáš - Utekal; Pavol - Mrkáček; Michal - Hálová; Ivana - Kuchař; L. - Kuda; Ondřej - Vávrová; Petra - Schuster; Bjorn - Fuentes-Liso; Sergio - Potůčková; Lucie - Smrž; D. - Černohouzová; Sára - Dráberová; Lubica - Bambousková; Monika - Dráber; Petr
.
Crosstalk between ORMDL3; serine palmitoyltransferase; and 5-lipoxygenase in the sphingolipid and eicosanoid metabolic pathways
.
Journal of Lipid Research. 2021; 62(September)); 100121
.
IF = 5.922
[ASEP]
[
doi
]
Zobrazit více
Zobrazit více
Kristyna Magno Ondrej Veronika Marina
Speedvac
Growing cells
QTRAP 5500 / SelexION
Growing cells
Solid Phase Extraction
