Tato skupina zkoumá vztahy mezi hostiteli, symbionty a prostředím. Studujeme rozmanitost a přenosy parazitů mezi primáty a lidmi v afrických lesních ekosystémech pomocí řady parazitologických nástrojů od tradiční morfologie a morfometrie, koproskopie až po nejmodernější metody založené na metagenomických přístupech. Zaměřujeme se zejména na ekologii, epidemiologii a dopad infekcí strongylidních hlístic na populace ohrožených lidoopů. Rovněž studujeme, jak antropogenní vlivy vedoucí k fragmentaci habitatů a populací volně žijících živočichů a rostlin ovlivňují společenství prokaryotických a eukaryotických symbiontů u afrických lidoopů. Naše skupina se rovněž zabývá výzkumem střevního bakteriomu lidí a primátů, především se zaměřujeme na srovnání taxonomického a funkčního složení bakteriomu a metabolomu u lovců -sběračů a sympatrických primátů. Studujeme vliv stravy a střevního bakteriomu na riziko kardiometabolických onemocnění u goril. Naše výsledky mohou najít využití v ochraně zdraví jak ohrožených primátů, tak i lidí.