Veškerá publikační činnost pracovníků MÚA je evidována v databázi ASEP:
MÚA AV ČR (od r. 2006), Archiv AV ČR (do r. 2005), Masarykův ústav AV ČR (do r . 2005).
Pokyny pro autory publikací MÚA AV ČR: zde
Publikace Česko-německé komise historiků
Česko-německá komise historiků má za úkol zkoumat společné dějiny Čechů a Němců. Těžiště její práce spočívá ve 20. století. Komise přistupuje k tématům multidisciplinárně a snaží se analyzovat historické zkušenosti, které spojují Čechy a Němce, v širokém historickém kontextu a ve srovnávací perspektivě. Komise pořádá konference a expertní jednání a vydává vlastní ediční řadu.
Detlef Brandes – Edita Ivaníčková – Jiří Pešek (eds.)
Dušan Kováč – Miloš Řezník – Martin Schulze Wessel (eds.)