S příchodem začátku nového roku bychom Vás rádi pozvali na pokračování ústavních seminářů ÚEM AV ČR, které se uskuteční každý první čtvrtek v měsíci. Již tento týden (tj. 6. 1. 2022 od 14:00 hod.) Vám nově nabídneme 2 semináře:
Úloha mikrodomén plazmatické membrány v homeostázi lipidů
Mgr. Jakub Zahumenský, Ph.D. / Oddělení funkčního uspořádání biomembrán
Sfingolipidy jsou nezbytné stavební jednotky membrán eukaryotických buněk a důležité signální molekuly. Jejich množství je striktně regulováno v závislosti na vlastnostech prostředí a fyziologickém stavu buňky. Dosavadní poznatky naznačují, že senzorem množství sfingolipidův plazmatické membráně kvasinky
Saccharomyces cerevisiae je protein Nce102, který je primárněnahromaděnýve specifickýchmembránových doménách a svoji lokalizaci mění v závislosti na množství sfingolipidů v buňce. Nedávno jsme objevili, že tato změna je lokální, tedy že nastává v oblastech se zvýšenou poptávkou po sfingolipidech, jako jenapříklad membrána rostoucího pupenu. Dále, že inhibice biosyntézy sfingolipidů indukuje navýšení množství proteinu Nce102 a naopak nadbytečné množství prekurzorů sfingolipidů způsobí internalizaci tohoto proteinu.Tyto výsledky naznačují, že celkové množství Nce102 v plazmatické membráně odpovídá aktuální potřebě syntézy sfingolipidů a jeho lokálně homogenní distribuce vyznačuje konkrétní místa zvýšené poptávky. Ukázali jsme také, že se Nce102 chová analogicky v běžném lidském patogenu Candida albicans, což naznačuje zachování principu lokální kontroly množství sfingolipidů napříč druhy.
Zpracování dat pomocí sekvenace nové generace - základní principy
MUDr. Josef Horák / Oddělení molekulární biologie nádorů
Sekvenování nové generace (zkr. NGS - Next Generation of Sequencing) je skupina vysoce výkonných metod využívajících koncept paralelního sekvenování. NGS produkuje velké množství dat, která je třeba zpracovat specifickými postupy. V rámci projektu mezinárodní mobility ÚEM AV ČR jsem absolvoval stáž v Katalánském onkologickém ústavu v Barceloně s cílem naučit se zpracovávat data generované metodami NGS. V rámci přednášky, která je součástí návratové fáze projektu, vám stručně představím základní principy zpracování NGS dat vč. příkladů.
Seminář je součástí projektu Mezinárodní mobility zaměstnanců ÚEM AV ČR a předkládá získané znalosti a dovednosti v rámci odborné stáže v Katalánském onkologickém institutu v Barceloně.
Vzhledem k epidemiologické situaci a aktuálním opatřením budou semináře přenášeny online prostřednictvím aplikace MS Teams.
