Laboratoř buněčné biologie
Jak rostliny získávají tvar?
Hlavní oblastí našeho zájmu jsou procesy buněčné morfogeneze, tedy způsoby, jakými buňky a v konečném důsledku i celé rostliny určují svůj tvar. Na rozdíl od živočišných buněk nemohou ty rostlinné migrovat. Často nesmírně komplikované tvary rostlin jsou tak pouze výsledkem orientovaného buněčného dělení a orientovaného buněčného růstu.
Aby buňka mohla růst určitým směrem, musí do specifických oblastí (domén) na svém povrchu dopravovat váčky, které obsahují složky buněčné stěny. První kontakt těchto takzvaných sekrečních váčků s cílovou membránou na povrchu buňky zprostředkovává velký proteinový komplex exocyst. Ten jsme v rostlinách objevili a popsali jako první na světě a jeho studium představuje hlavní zaměření laboratoře.
Exocyst: klíčový hráč v životě buňky
Exocyst patří mezi takzvané poutací komplexy. Jeho úkolem je chytit sekreční váčky a opravdu je připoutat k membráně, se kterou následně splývají. Buňka pak přednostně roste v těchto místech – vznikne výběžek či vychlípenina.
Tento způsob růstu je u rostlin velmi častý. Extrémním příkladem jsou kořenové vlásky nebo pylové láčky, kdy se buňka výrazně prodlužuje pouze v jednom směru a vytváří tenké vlákno. Kromě těchto buněk u modelové rostliny huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana) zkoumáme funkci exocystu také v evolučně „starých“ rostlinách, jako jsou mechy nebo játrovky.
Pomocí metod cíleného vyřazování genů z funkce a pokročilé mikroskopie jsme ukázali, že komplex exocyst je nezbytný pro život rostlinných buněk a reguluje jak jejich růst, tak dělení (Hála et al., 2008; Synek et al., 2006; Fendrych et al., 2010, 2103, Synek et al., 2021).
Poutací proteinový komplex exocyst je nezbytný pro růst a vývoj. Rostliny Arabidopsis thaliana s vyřazenou jednou podjednotkou exocystu (vpravo) nejsou schopny normálního růstu a umírají.
Překvapivým zjištěním bylo, že je rovněž velmi důležitý pro rostlinnou imunitu a pro autofagii – proces, jímž buňka během hladovění „požírá“ své vlastní složky. Rostliny bez plně funkčního exocystu jsou mnohem náchylnější k napadení patogenními mikroorganismy (Kulich et al., 2013; Pečenková et al., 2011).
Odhalujeme tajemství membrán
Společně s bílkovinami, které regulují buněčnou morfogenezi, studujeme i jejich partnery z vnitrobuněčných membrán – záporně nabité sloučeniny ze skupiny fosfolipidů.
Vyvinuli jsme mikroskopické senzory pro detekci speciální třídy fosfolipidů v živých buňkách. Díky nim jsme dokázali, že tyto látky pomáhají určovat identitu jednotlivých membránových oblastí (domén), měnit jejich fyzikální vlastnosti a plnit roli „majáků“, na něž se specificky vážou cílové proteiny včetně exocystu.
Molekulární detaily interakcí mezi proteiny a membránami, které jsou důležité pro jejich funkci, studujeme i pomocí počítačových simulací molekulové dynamiky (Pleskot et al., 2012, 2015).
Pracovníci
- Mgr. Eliška Škrabálková
vedoucí skupinyvedoucí vědecký pracovník
- Ing. Martin Potocký Ph.D.
vědecký pracovník
- Mgr. Edita Drdová
- RNDr. Michal Hála Ph.D.
- Tamara Pečenková Ph.D.
- Ing. Přemysl Pejchar Ph.D.
- Mgr. Lukáš Synek PhD.
- RNDr. Viktor Žárský CSc.
vědecký asistent
- Mgr. Lucie Brejšková PhD.
- Ing. Andrea Potocká Ph.D.
- Mgr. Hana Soukupová Ph.D.
postdoktorand
- Mgr. Peter Sabol PhD.
doktorand
- Bc Matěj Drs
- Samuel Haluška
- Ing. Ondřej Novotný
laborant
- Bc. Jana Šťovíčková
Výzkumné projekty
- Good-Cop/Bad-Cop: Distinct roles of anionic phospholipids in plant endocytosis , GA ČR , Martin Potocký
- SIGNALS - The role of anionic phospholipids in the regulation of endocytosis in tip-growing plant cells , MŠMT , Martin Potocký
- Control of plant exocyst function by protein phosphorylation in root hairs and pollen tubes - role of unconventional exocyst complex subunits EXO70C , GA ČR , Viktor Žárský
- Multifaceted analysis of diacylglycerol kinase family in plants , GA ČR , Přemysl Pejchar
- Plant exocyst complex function in autophagy-related membrane transport , GA ČR , Tamara Pečenková
- Multiscale analysis of signalling phospholipids and their interaction protein partners in the regulation of plant tip growth , GA ČR , Martin Potocký
- Funkce rostlinného poutacího komplexu exocyst v exocytóze, buněčném dělení a biogenezi buněčné stěny , GA ČR , Michal Hála
- Úloha diacylglycerolu při toxickém působení hliníku u rostlin , GA ČR , Přemysl Pejchar
- Exocyst, poutací komplex sekretorických váčků, v polarizaci transportu auxinu , GA ČR , Lukáš Synek
- Charakterizace vybraných příslušníků nových skupin rostlinných forminů - třídy II a třídy III. , GA ČR , Viktor Žárský
- Chracterisation of NADPH oxidase from tobacco pollen and its role in regulation of polar cell expansion , GA ČR , Martin Potocký
- Transkriptom mutanta exo70A1 a buněčné funkce EXO70A1, předpokládané podjednotky exocystu , GA AV , Lukáš Synek
- Transkriptom mutanta exo70A1 a buněčné funkce EXO70A1, podjednotky komplexu exocyst, u Arabidopsis thaliana , GA AV , Lukáš Synek
Publikace
2022
- NEW PHYTOLOGIST 233 2185-2202 2022 (External fulltext)
- MOLECULAR PLANT PATHOLOGY 2022 (External fulltext)
- PLANT JOURNAL 2022
2021
- FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 11 609600 2021 (External fulltext)
- SCIENCE ADVANCES 7 eabe7999 2021 (External fulltext)
- NATURE COMMUNICATIONS 12 3050 2021 (External fulltext)
- PROCEEDINGS OF THE NAS OF THE USA 118 e2105287118 2021 (External fulltext)
- JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 2021
- ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 2021
2020
- PLANT JOURNAL 103 212-226 2020 (External fulltext)