Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.

Publikováno 02. 01. 2023

Pojďme se krátce ohlédnout za uplynulým rokem 2022 z pohledu publikační aktivity jednotlivých oddělení ÚEM AV ČR. V loňském roce naši vědci publikovali celkem 90 odborných publikací s celkovým IF 595,52 (průměrný IF 6,62). Mezi nejproduktivnější oddělení ÚEM AV ČR patří: 

• Oddělení molekulární biologie nádorů (21 publikací),
• Oddělení regenerace nervové tkáně (15 publikací),
• Centrum rekonstrukčních neurověd  (10 publikací),
• Oddělení nanotoxikologie a molekulární epidemiologie (10 publikací),
• Oddělení genetické toxikologie a epigenetiky (10 publikací).

Přehled nejlepších publikací ÚEM AV ČR:  

Publikace s vysokým příspěvkem autorů z ÚEM AV ČR 

• Fawcett, J.W., Fyhn, M., Jendelová, P., Kwok, J.C.F., Růžička, J., Sorg, B.: (2022) The extracellular matrix and perineuronal nets in memory. Molecular Psychiatry. IN PRESS
• Arzhanov, I., Sintakova, K.,  Romanyuk, N.: (2022) The Role of miR-20 in Health and Disease of the Central Nervous System. Cells. 11(9): 1525.
• Růžička, J.,  Dalecká, M.,  Šafránková, K.,  Peretti, D.,  Jendelová, P., Kwok, J.C.F.,  Fawcet, J.W.: (2022) Perineuronal nets affect memory and learning after synapse withdrawal. Translational Psychiatry. 12(1):480.
• Fábik, J., Psutková, V.,  Machoň, O.: (2022) Meis2 controls skeletal formation in the hyoid region. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 28(10): 951063.
• Vargová, I., Kriška, J., Kwok, J.C.F., Fawcett, J.W., Jendelová, P: (2022) Long-Term Cultures of Spinal Cord Interneurons. Frontiers in Cellular Neuroscience. 16: 827628
• Zahumenský, J. , Fernandes, C.M.,  Veselá, P.,  Del Poeta, M., Konopka, J.B.,  Malínský, J.: (2022) Microdomain Protein Nce102 Is a Local Sensor of Plasma Membrane Sphingolipid Balance. Microbiology Spectrum. 10(4): e0196122.
• Žižková, R., Hedvičáková, V., Blahnová Hefka, V., Sovková, V., Rampichová, M., Filová, E.: (2022) The Effect of Osteoblast Isolation Methods from Adult Rats on Osteoclastogenesis in Co-Cultures. International Journal of Molecular Sciences. 23(14):7875.
• Haveliková, K., Smejkalová, B.,  Jendelová, P.: (2022) Neurogenesis as a Tool for Spinal Cord Injury. International Journal of Molecular Sciences. 23(7): 3728.
• Holáň, V., Echalar, B., Palacká, K., Kössl, J., Bohačová, P., Porubská, B., Krulová, M., Javorková, E., Zajicová, A.: (2022) The Inability of Ex Vivo Expanded Mesenchymal Stem/Stromal Cells to Survive in Newborn Mice and to Induce Transplantation Tolerance. Stem Cell Reviews and Reports. 18(7): 2365-2375.
• Suchá, P.,  Heřmanová, Z., Chmelová, M., Kirdajová, D., Camacho Garcia, S., Marchetti, V., Voříšek, I., Turečková, J., Shany, E., Jirák, D., Anděrová, M., Vargová, L.: (2022) The absence of an AQP4/TRPV4 complex substantially reduces acute cytotoxic edema following ischemic injury. Frontiers in Cellular Neuroscience. IN PRESS
• Hoňková, K., Rössnerová, A., Chvojková, I., Milcová, A., Margaryan, H., Pastorková, A., Ambrož, A., Rössner, P., Jirik, V., Rubeš, J., Šrám, R.J., Topinka, J.: (2022) Genome-Wide DNA Methylation in Policemen Working in Cities Differing by Major Sources of Air Pollution. International Journal of Molecular Sciences. 23(3):1666.
• Paul, J.Ch.,  Fulka, H.: (2022) Nuclear Lamins: Key Proteins for Embryonic Development. Biology-Basel. 11(2): 198.

Publikace s vysokým normalizovaným IF

• Tansley, S., Gu, N., Guzman, A. U., Cai, W., Wong, C., Lister, K.C., Munoz-Pino, E., Yousefpour, N., Roome, R. B., Heal, J., Wu, N., Castonguay, A., Lean, G., Muir, E. M., Kania, A., Prager-Khoutorsky, M., Zhang, J., Gkogkas, Ch.G., Fawcett, J.W., Diatchenko, L., Ribeiro-da-Silva, A., De Koninck, Y., Mogil, J., Khoutorsky, A.: (2022) Microglia-mediated degradation of perineuronal nets promotes pain. Science. 377(6601): 80-86.
• Fernandez-Rozadilla, C., Timofeeva, M., Chen, Z., Law, P., Thomas, M., Schmit, S., Díez-Obrero, V., Hsu, L., Fernandez-Tajes, J., Palles, C., Sherwood, K., Briggs, S., Svinti, V., Donnelly, K., Farrington, S., Blackmur, J., Vaughan-Shaw, P., Shu, X., Long, J., Cai, Q., Guo, X., Lu, Y., Broderick, P., Huyghe, H., Harrison, T., Conti, D., Dampier, D., Schumacher, F., Melas, M., Rennert, G., Santacana, M.O., Martín-Sánchez, V., Moratalla-Navarro, F., Hwan, J., Kim, J., Jee, S.H., Jung, K.J., Kweon, S.S., Shin, M.H., Shin, A.,  Ahn, Y.O., Kim, D.H., Oze, I., Wen, W., Matsuo, K., Matsuda, K., Tanikawa, Ch., Ren, Z., Gao, Y.T., Jia, W.H., Hopper, J., Jenkins, M., Win, A.K., Pai, R., Figueiredo, J., Haile4, R., Gallinger, S., Woods, M., Newcomb, P., Duggan, D., Cheadle, J., Kaplan, R., Maughan, T., Kerr, R., Kerr, D., Kirac,I., CORGI study investigators59 16 , SCOT  trial translational group and investigators, Böhm, J., Mecklin, J.P., Jousilahti, P., Knekt, P., Aaltonen, L., Rissanen, H., Pukkala, E., Eriksson, J., Cajuso, T., Hänninen, U., Kondelin, J., Palin, K., Tanskanen, T., Renkonen-Sinisalo, L., Zanke, B., Männistö, S., Albanes, D., Weinstein, S., Ruiz-Narvaez, E., Palmer, J., Buchanan, D., Platz, E., Visvanathan, K., Ulrich, C., Siegel, E., Brezina, S., Gsur, A., Campbell, P., Chang-Claude, J., Hoffmeister, M., Brenner, H.,  Slattery, M., Potter, J., Tsilidis, T., Schulze, M., Gunter, M., Murphy, N., Castells, A., Castellví-Bel, S., Moreira, L., Arndt, V., Shcherbina, A., Stern, M., Pardamean, B., Bishop, T., Giles, G., Southey, M., Idos, G., McDonnell, K., Abu-Ful, Z., Greenson, J., Shulman, K., Lejbkowicz, F., Offit, K., Su, Y.R., Steinfelder, R., Keku, T., van Guelpen, B., Hudson, T., Hampel, H., Pearlman, R., Berndt, S., Hayes, R., Martinez, M.E., Thomas, S., Corley, D., Pharoah, P., Larsson, S., Yen. Y., Lenz, H.J., White, E., Li, L., Doheny, K., Pugh, E., Shelford, T., Chan, A., Cruz-Correa, M., Lindblom, A., Hunter, D., Joshi, A., Schafmayer, C., Scacheri, P., Kundaje, A., Nickerson, D., Schoen, R., Hampe, J., Stadler, Z., Vodička, P., Vodičková, L., Vymetálková, L.,  Papadopoulos, N., Edlund, Ch., Gauderman, W., Thomas, D., Shibata, D., Toland, D., Markowitz, S., Kim, A., Chanock, S., van Duijnhoven, F., Feskens, E., Sakoda, L., Gago-Dominguez, M., Wolk, A., Naccarati, A., Pardini, B., FitzGerald, L., Chin, S., Lee, S.Ch., Ogino, S., Bien, S.,  Kooperberg, Ch., Li, Ch., Lin, Y., Prentice, R., Qu, C., Bézieau, S., Tangen, C., Mardis, E., Marchand, L.L., Wu, A., Qu, Ch., McNeil, C., Coetzee, G., Hayward, C., Deary, I., Harris, S., Theodoratou, E., Reid, S., Walker, M., Ooi, L.Y., Moreno, V., Casey, G., Gruber, S., Tomlinson, I., Zheng, W., Dunlop, M., Houlston, R., Peters, P.: (2022) Multi-omic analysis of 100,204 Europeans and Asians identifies 103 new  2 colorectal cancer risk associations and provides insights into disease etiology. Nature Genetics. IN PRESS
• Grotz, S., Schaefer, J.,Wunderlich, K.A., Ellederova, Z., Auch, H., Baehr, A., Runa-Vochozkova, P., Fadl, J., Arnold, V., Ardan, T., Veith, M., Santamaria, G., Dhom, G., Hitzl, W., Kessler, B., Eckardt, Ch., Klein, J., Brymova, A., Linnert, J., Kurome, M., Zakharchenko, V., Fischer, A., Blutke, A., Doering, A., Suchánková, Š., Popelář, J., Rodriguez-Bocanegra, E., Dlugaiczyk, J., Straka, H., May-Simera, H., Wang, W., Laugwitz, K.L., Vandenberghe, L.H., Wolf, E., Nagel-Wolfrum, K., Peters, T., Motlik, J., Fischer, M.D., Wolfrum, U., Klymiuk, N.: (2022) Early disruption of photoreceptor cell architecture and loss of vision in a humanized pig model of usher syndromes. EMBO Molecular Medicine. 14(4):e14817.
• Fawcett, J.W., Fyhn, M., Jendelová, P., Kwok, J.C.F., Růžička, J., Sorg, B.: (2022) The extracellular matrix and perineuronal nets in memory. Molecular Psychiatry. IN PRESS
• Filová, I., Pysanenko, K., Tavakoli, M., Vochyanova, S., Dvořáková, M., Bohuslavová, R., Smolík, O., Fabriciová, V., Hrabalová, P., Benešová, Š., Valihrach, L.,  Černý, J., Yamoah, E.N., Syka, J., Fritzsch, B., Pavlinková, G.: (2022) ISL1 is necessary for auditory neuron development and contributes toward tonotopic organization. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119(37): e2207433119.
• Barone, D.G., Carnicer-Lombarte, A., Tourlomousis, P., Hamilton, R.S., Prater, M., Rutz, A.L., Dimov, I.B., Malliaras, G.G., Lacour, S.P., Robertson, A.A.B., Franze, K., Fawcett, W.J., Bryant, C.E.: (2022) Prevention of the foreign body response to implantable medical devices by inflammasome inhibition. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119(12): e2115857119
• Murphy, N.,  Song, M., Papadimitriou, N., Carreras-Torres, R., Langenberg, C., Martin, R.M., Tsilidis, K.K., Barroso, I., Chen, J., Frayling, T., Bull, C.J., Vincent, E.E., Cotterchio, M., Gruber, S.B., Pai, R.K., Newcomb, P.A., Perez-Cornago, A., van Duijnhoven, F.J.B., Van Guelpen, B., Vodička, P., Wolk, A., Wu, A.H., Peters, U., Chan, A.T., Gunter, M.: (2022) Associations Between Glycemic Traits and Colorectal Cancer: A Mendelian Randomization Analysis. JNCI-Journal of the National Cancer Institute. 114(5): 740-752.
• Clay-Gilmour, A., Chattopadhyay, S., Hildebrandt, M.A.T., Thomsen, H., Weinhold, N., Vodička, P., Vodičková, L., Hoffmann, P., Nothen, M.M., Jockel, K.H., Schmidt, B., Langer, Ch.,Hájek, R., Hallmans, G., Pettersson-Kymmer, U., Ohlsson, C., Spath, F., Houlston, R., Goldschmidt, H., Manasanch, E.E., Norman, A., Kumar, S., Rajkumar, S.V., Slager, S., Forsti, A., Vachon, C.M., Hemminki, K.: (2022) Genome-wide meta-analysis of monoclonal gammopathy of undetermined signifikance (MGUS) identifies risk loci impacting IRF-6. Blood Cancer Journal. 12(4):60
• Tsilidis, K.K.,  Papadimitriou, N., Dimou, N., Gill, D., Lewis, S.J., Martin, R.M., Murphy, N., Markozannes, G., Zuber, V., Cross, A.J., Burrows, K., Lopez, D.S., Key, T.J., Travis, R.C., Perez-Cornago, A., Hunter, D.J., van Duijnhoven, F.J.B., Albanes, D., Arndt, V., Berndt, S.I., Bezieau, S., Bishop, D. T., Boehm, J., Brenner, H., Burnett-Hartman, A., Campbell, P.T., Casey, G., Castellvi-Bel, S., Chan, A.T., Chang-Claude, J., de la Chapelle, A., Figueiredo, J.C., Gallinger, S.J., Giles, G.G., Goodman, P.J., Gsur, A., Hampe, J., Hampel, H., Hoffmeister, M., Jenkins, M., Keku, T.O., Kweon, S.S., Larsson, S.C., Le Marchand, L., Li, Ch.I., Li, L., Lindblom, A., Martin, V., Milne, R.L., Moreno, V., Nan, H., Nassir, R., Newcomb, P.A., Offit, K., Pharoah, P.D.P., Platz, E.A., Potter, J.D., Qi, L., Rennert, G., Sakoda, L.C., Schafmayer, C., Slattery, M.L., Snetselaar, L., Schenk, J., Thibodeau, S.N., Ulrich, C.M., Van Guelpen, B., Harlid, S., Visvanathan, K., Vodičková, L., Wang, H., White, E., Wolk, A., Woods, M.O., Wu, A.H., Zheng, W., Bueno-de-Mesquita, B., Boutron-Ruault, M.Ch., Hughes, D.J., Jakszyn, P., Kuehn, T., Palli, D., Riboli, E., Giovannucci, E.L., Banbury, B.L., Gruber, S.B., Peters, U., Gunter, M.J.: (2021) Genetically predicted circulating concentrations of micronutrients and risk of colorectal cancer among individuals of European descent: a Mendelian randomization study. American Journal of Clinical Nutrition. 113(6): 1490-1502.
• Zahumenský, J. , Fernandes, C.M., Veselá, P., Del Poeta, M., Konopka, J.B., Malínský, J.: (2022) Microdomain Protein Nce102 Is a Local Sensor of Plasma Membrane Sphingolipid Balance. Microbiology Spectrum. 10(4): e0196122.
• Balažová, M.,  Veselá, P., Babelová, L., Durisová, I., Kanovicová, P., Záhumenský, J., Malínský, J.: (2022) Two different phospholipases C, Isc1 and Pgc1, cooperate to regulate mitochondrial function. Microbiology Spectrum. IN PRESS.
• Zhang, X., Lu, Ch., Li, Y., Norbäck, D., Murthy, P., Šrám, R.J., Deng, Q.: (2023) Early-life exposure to air pollution associated with food allergy in children: Implications for 'one allergy' concept. Environmental Research. 216: 114713