Přeskočit na hlavní obsah

Funkční uspořádání biomembrán

Výzkumné oddělení

Skupinový portrét týmu z Oddělení funkčního uspořádání biomembrán

Studujeme laterální uspořádání biologických membrán do mikrodomén, tj. malých oblastí specifického tvaru, složení a funkce. Důraz přitom klademe na jejich zapojení do regulace buněčných procesů v reakci na podněty z okolního prostředí. S maximálním využitím výhod geneticky přístupného kvasinkového modelu zkoumáme zejména roli těchto membránových mikrodomén ve vnímání stresu a stresové adaptaci, v signalizaci a v regulaci buněčného metabolismu. Tyto membránové funkce předpokládají komunikaci mezi různými mikrodoménami, a to jak v jedné konkrétní membráně, tak mezi různými specializovanými membránami v rámci membránového systému eukaryotní buňky. Nedávno jsme například popsali, jak protein přirozeně se vyskytující v doménách plazmatické membrány ovlivňuje morfologii a funkční vlastnosti mikrodomén v membráně vakuoly.

Jan Malínský

Vedoucí
doc. RNDr. Jan Malínský, Ph.D.

Telefonní číslo +420 241 062 597
Mailová adresa jan.malinsky@iem.cas.cz
Zobrazit více
Přeskočit navigaci

Pracovníci

Zástupce vedoucího oddělení

Ing. Petra Veselá


Vědečtí pracovníci

doc. RNDr. Jan Malínský, Ph.D.

Mgr. Jakub Zahumenský, Ph.D.


Odborný pracovník

Ing. Petra Veselá


Postgraduální studenti

Ing. Petra Veselá

BSc. Satyendra Mondal, MSc.

Alena E. Shulutkova, MSc.


Techničtí pracovníci

Jitka Eisensteinová

Lenka Hlavínová

Na mateřské dovolené


Významné výsledky


Dvě různé fosfolipázy C, Isc1 a Pgc1, spolupracují při regulaci mitochondriální funkce

Mitochondrie se neustále přizpůsobují změnám v dostupnosti živin a vnějším stresům. Navrhli jsme model, ve kterém je tato adaptace zprostředkována lipidy. Konkrétně jsme ukázali, že mitochondriální fosfolipidy regulují biosyntézu buněčných sfingolipidů a naopak. Tímto způsobem je buňka schopna koordinovat strukturu a výkonnost mitochondrií s aktuálními potřebami celkového buněčného metabolismu. Zdá se, že jde o univerzálně použitelný princip buněčné regulace.

Mechanismus vzájemné regulace fosfolipáz Isc1 a Pgc1. Dva lipidy, diacylglycerol (DAG) a fosfatidylglycerol (PG), inhibují klíčové enzymy mitochondriální biosyntézy fosfolipidů: (i) PG-fosfát syntázu Pgs1, (ii) fosfatidylserin (PS) dekarboxylázu Psd1 a (iii) inositolfosfingolipid fosfolipázu C Isc1. Posledně jmenovaná je zvláště důležitá, protože ceramid, produkt hydrolýzy katalyzované Isc1, inhibuje Pgc1, PG-specifickou fosfolipázu C, která degraduje PG za vzniku DAG. Celá smyčka zajišťuje účinnou kontrolu syntézy PG (kardiolipinu) a fosfatidyletanolaminu (PE) v kontextu environmentálních stresových podnětů ovlivňujících biosyntetickou dráhu sfingolipidů. OMM – vnější mitochondriální membrána; IMM – vnitřní mitochondriální membrána; IPC – inositolfosfoceramid.

 

Publikace:

Balazova, M., Vesela, P., Babelova, L., Durisova, I., Kanovicova, P., Zahumensky, J., Malinsky, J.: (2022) Two different phospholipases C, Isc1 and Pgc1, cooperate to regulate mitochondrial function. Microbiology Spectrum. 10(6): e02489-22.


Publikace


Spolupráce


Prague Membrane Discussions

je neformální diskusní fórum pro vědce, kteří se zabývají plasmatickou membránou.

Více informací.

Spring Event

March 19, 2020 (Thursday)
J. Heyrovsky Institute of Physical Chemistry (JHI) of the Czech Academy of Sciences (Ladvi)

Where: Brdicka Lecture Hall

9:30 am – 14:00 am

Program

9:30 – 10:00    Meeting Friends – wake-up discussions, coffee, refreshments.

10:00 – 11:00    Dominik Wöll, RWTH Aachen University, Germany
„Functional microgels – new insight into their structure and function with super-resolution fluorescence microscopy“

11:00 – 12:00   Christian Franke, Max Planck Institute for Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, Germany
„Elucidating the endosomal machinery with correlative multi-colour SMLM and volumetric electron tomography“

12:00 – 12:30 COFFEE/SNACKS BREAK (drinks, coffee and small snacks available)

12:30 – 13:15       Piotr Jurkiewicz, JHI
„When BOBBING does not mean BOBOVÁNÍ (‚bobsleigh‘ in Czech)“

13:15 – 14:00        Joana Ricardo, JHI
„Characterization of lipid bilayer nanodiscs“

14:00 –>    General discussions

Summer Event

June 21st, 2018; 10 am – 3 pm
 @ Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Flemming Sq., Prague 6
Main Lecture Hall

 

Preliminary program:

Plenary talk

10:00 – 11:00 Ana-Nicoleta Bondar, Freie Universität Berlin, Germany
„Hydrogen bonding and membrane reactions“

11:00 – 11:30 Jana Humpolíčková
„A FLIM-FRET approach for the determination of membrane protein oligomerization in live cell membranes: a case study of rhomboid-like protein 2 (RHBDL2)“

11:30-12:00 Daniel Holý (Jungwirth group)
„Ion binding at curved lipid bilayers“

12:00 – 12:45 Complimentary buffet refreshments / self-paid lunch at the adjacent Cafe Organica

12:45 – 13:15 Josef Lazar
„Making laser scanning polarization microscopy available to everyone“

13:15 – 13:45 Evžen Bouřa
„Membrane recruitment of viral polymerases – Science or Fiction?“

13:45 – 14:15 Andrii Kurochka (Yushchenko group)
„Protein-membrane interaction and alpha-synuclein aggregation“

Spring PMD 2018

March 8th, 2018 ; 10 am – 2 pm
@ Jaroslav Heyrovsky Institute of the CAS, Dolejskova 3, Prague 8
Brdicka lecture room

Program:

10:00 – 11:00 Plenary lecture 1.
Claudia Steinem – Universitaet Goettingen, Germany
Pore-spanning membranes: Is this model system suited for addressing biochemical questions?

11:00 – 12:00 Plenary lecture 2.
Andreas Janshoff – Universitaet Goettingen, Germany
Membrane biophysics in confined geometry

12:00 – 12:30 COFFEE/SNACKS BREAK (drinks, coffee and snacks available)

12:30 – 13:15
Robert Vacha, MU Brno
Translocation of peptides across phospholipid membranes

13:15 – 14:00
Petra Riegrova, JHI
The oxidized phospholipids modify Bax protein ability to induce permeabilization of mitochondrial membranes

2017

Poslední PMD v roce 2017 se uskutečnilo ve čtvrtek 14. 12. a hostitelem byl tentokrát Ústav experimentální botaniky AV ČR.

Konferenci zahájil doktor Jan Petrášek.

Úvodní přednášku měl Charo del Genio z britske University of Warwick.

...kromě přednášek bylo na akci také dost času pro neformální diskuse a setkání s kolegy.

December 14th, 2017; 10 am – 3 pm
@ Institute of Experimental Botany of the CAS, Prague 6 – Lysolaje
Building B1, Ground floor, Library seminar room

Program:

10:00 – 10:30 Charo I. Del Genio
In silico modelling of auxin plasma membrane carrier
Centre for Complexity Science, University of Warvick, UK

10:30 – 11:00 Roman Pleskot
Membrane targeting of Arabidopsis TPLATE complex
Group of Advanced Live Cell Imaging, VIB Center for Plant Systems Biology, Ghent, Belgium
Roman Pleskot, Klaas Yperman, Jie Wang and Daniel Van Damme

11:00 – 11:20 COFFEE BREAK (drinks, coffee and snacks available)

11:20 – 11:50 Martin Potocký
Phosphatidic acid is involved in clathrin-mediated endocytosis in tip-growing plant cells
Laboratory of Cell Biology, Institute of Experimental Botany CAS
Přemysl Pejchar, Juraj Sekereš, Roman Pleskot, Viktor Žárský and Martin Potocký

11:50 – 12:20 Mária Balážová
Subcellular distribution of phosphatidylglycerol is regulated by a lipid droplet protein
Department of Membrane Biochemistry, Institute of Animal Biochemistry and Genetics, Centre of Biosciences SAS, Bratislava, Slovakia

12:20-13:30 Lunch – canteen of IEB CAS or pizza at the site

13:30 – 14:00 Radovan Fišer
Interaction of lipopeptide Daptomycin with the membrane and the pore-formation
Laboratory of Bacterial Physiology, Department of Genetics and Microbiology, Faculty of Science, Charles University

14:00 – 14:30 Michal Daněk
Flotillin2 in Arabidopsis or Do membrane microdomains reflect cell wall integrity?
Laboratory of Signal Transduction, Institute of Experimental Botany CAS
Michal Daněk, Jan Petrášek, Jindřiška Angelini, Kateřina Malínská

14:30 – 15:00 Katarzyna Retzer
SRRF based analysis of the distribution of a mutated variant of the plasma membrane located auxin carrier AtPIN2
Laboratory of Hormonal Regulations in Plants, Institute of Experimental Botany CAS