Kancelář AV ČR je od 1. 1. 2001 vnitřní organizační jednotkou Akademie věd ČR zřízenou na dobu neurčitou, se sídlem v Praze 1, Národní 3. Její právní postavení upravují zákony č. 283/1992 Sb. (o Akademii věd České republiky) ve znění zákona č. 533/2006 Sb., zákon č. 219/2000 Sb. (o majetku České republiky a jejím vystupování v právních vztazích) ve znění pozdějších předpisů a dále čl. 46 Stanov Akademie věd ČR.
Kancelář AV ČR jako výkonný aparát volených řídících orgánů Akademie věd ČR zajišťuje:
- odbornou, právní a organizační agendu související s činností orgánů AV ČR, zejména jejího předsedy, Akademického sněmu, Akademické rady, jejího předsednictva, Vědecké rady AV ČR a dalších poradních a pomocných orgánů,
- funkce Akademie věd ČR týkající se zřizování, změn a rušení pracovišť AV ČR jako veřejných výzkumných institucí,
- správu kapitoly státního rozpočtu a rozdělování finančních prostředků pracovištím AV ČR včetně vnitřního kontrolního systému,
- periodické hodnocení výzkumné a odborné činnosti pracovišť AV ČR a jejich vědeckých útvarů,
- finanční podporu pracovišť Akademie věd ČR prostřednictvím interních programů a podpory excelence,
- činnosti v oblastech mezinárodní spolupráce a styku s médii a veřejností.