Naše skupina se zabývá strukturní biologií (vztahy mezi strukturou a funkcí určitých skupin bílkovin), konkrétně se zaměřujeme na proteiny, které se účastní přenosu signálu v buňce. Mezi metody, které využíváme, patří příprava proteinů a jejich komplexů, základní biofyzikální charakterizace, charakterizace mezimolekulových interakcí a studium struktury a interakčních povrchů. Všechny tyto metody nám umožňují lépe pochopit detaily, jak je regulována aktivita a funkce protein-proteinových komplexů. Zabýváme se především výzkumem v těchto oblastech:
- Strukturní biologie 14-3-3 proteinů a jejich vazebných partnerů
- Studium inhibice ubiquitin ligásy Nedd4-2 pomocí proteinu 14-3-3
- Charakterizace interakcí mezi transkripčním faktorem FOXO4 a tumorovým supresorem p53
- Mechanismus regulace proteinkinasy ASK1 pomocí TRX a proteinu 14-3-3
- Mechanismus regulace proteázy kaspazy-2 pomocí proteinu 14-3-3
EXTERNÍ WEBOVÉ STRÁNKY ODDĚLENÍ
Aktuální projekty
Transkripční faktor p53 je klíčovým regulátorem apoptózy, senescence a opravy DNA, který chrání buňky před nádorovým bujením při různých buněčných stresech. Funkce p53 jsou úzce propojeny s funkcí s aktivitou transkripčních faktorů FOXO (Forkhead box O).
Více
Naše výsledky poskytují strukturní pohled na regulaci lidské ubiquitin ligásy Nedd4-2 prostřednictvím proteinů 14-3-3. Naše data by mohla být důležitá k porozumění procesu regulace Nedd4-2 stejně tak jako úloze proteinů 14-3-3 v regulaci ostatních ubiquitin ligáz.
Více
Náš výzkum umožnil strukturní náhled na komplexy ASK1 kinasy s jejími dvěma přirozenými inhibitory: proteinem 14-3-3 a thioredoxinem. Naše data by mohla být důležitá k porozumění procesu inhibice ASK1 stejně tak jako úlohu proteinů 14-3-3 v regulaci ostatních enzymů.
Více
Úspěchy
Prémie Otto Wichterle pro Dalibora Koška.
Více
Transkripční faktor p53 brání tomu, aby se vlivem stresu staly z normálních buněk buňky nádorové. Za stresových podmínek p53 interaguje s dalším transkripčním faktorem FOXO4 (Forkhead box O 4) a společně pak zvyšují produkci proteinu p21, což spouští proces stárnutí buňky (senescenci). Molekulární mechanismus zvyšování transkripce p21 je však stále nejasný. V práci publikované v časopise Protein Science vědecké týmy Dr. Obšilové (FGÚ AV ČR), prof. Obšila (PřF UK a FGÚ AV ČR) a jejich kolegů z ÚOCHB AV ČR charakterizovali vzájemné interakce proteinů p53 a FOXO4 na molekulární úrovni. Nové poznatky o struktuře komplexu naleznou využití při vývoji specifických inhibitorů interakce mezi oběma proteiny, a následně pak při vývoji nových léčiv zaměřených na selektivní eliminaci senescentních buněk.
Více
Two accepted papers in Communications Biology: July and August 2021
Pavel Pohl, Rohit Joshi, Olivia Petrvalska, Tomas Obsil and Veronika Obsilova
14-3-3-protein regulates Nedd4-2 by modulating interactions between HECT and WW domains | Communications Biology (nature.com)
Commun. Biol. 2021 July 22; 4(1):899.
Matej Horvath, Olivia Petrvalska, Petr Herman, Tomas Obsil and Veronika Obsilova
14-3-3 proteins inactivate DAPK2 by promoting its dimerization and protecting key regulatory phosphosites | Communications Biology (nature.com)
Commun. Biol. 2021 August 19; 4(1):986.
IF = 6.268
Více
Studie otištěná v prestižním časopise eLife identifikuje nízkomolekulární sloučeniny, které interagují s transkripčním faktorem Forkhead box O3 (FOXO3) a modulují tak jeho aktivitu.
Více
We obtained the first prize for the best publication in Physiological Research with the young authors from for the year 2018.
Více
Zobrazit více
Publikace
Masaryk; Jakub - Kale; Deepika - Pohl; Pavel - Ruiz-Castilla; F. J. - Zimmermannová; Olga - Obšilová; Veronika - Ramos; J. - Sychrová; Hana
.
The second intracellular loop of the yeast Trk1 potassium transporter is involved in regulation of activity; and interaction with 14–3-3 proteins
.
Computational and Structural Biotechnology Journal. 2023; 21(April); 2705-2716
.
IF = 6.0
[ASEP]
[
doi
]
Sechovcová; Hana - Rudl Kulhavá; Lucie - Fliegerová; Kateřina - Killer; Jiří - Kopečný; Jan
.
Advantages of label free method in comparison with 2DE proteomic analysis of Butyrivibrio fibrisolvens 3071 grown on different carbon sources
.
Italian Journal of Animal Science. 2022; 21(1); 1508-1519
.
IF = 2.5
[ASEP]
[
doi
]
Obšilová; Veronika - Obšil; T.
Structural insights into the functional roles of 14-3-3 proteins
.
Frontiers in molecular biosciences. 2022; 9(Sep 16)); 1016071
.
IF = 5.0
[ASEP]
[
doi
]
Mandal; R. - Kohoutová; Klára - Petrvalská; Olivia - Horváth; M. - Srb; Pavel - Veverka; Václav - Obšilová; Veronika - Obšil; Tomáš
.
FOXO4 interacts with p53 TAD and CRD and inhibits its binding to DNA
.
Protein Science. 2022; 31(5)); e4287
.
IF = 8.0
[ASEP]
[
doi
]
Kohoutová; Klára - Dočekal; V. - Ausserlechner; M. J. - Kaiser; N. - Tekel; A. - Mandal; R. - Horváth; M. - Obšilová; Veronika - Veselý; J. - Hagenbuchner; J. - Obšil; Tomáš
.
Lengthening the Guanidine–Aryl Linker of Phenylpyrimidinylguanidines Increases Their Potency as Inhibitors of FOXO3-Induced Gene Transcription
.
ACS Omega. 2022; 7(38); 34632-34646
.
IF = 4.2
[ASEP]
[
doi
]
Zobrazit více
Detailní náhled na strukturu komplexu proteinů 14-3-3 a Nth1 (PDB 5M4A) Alblova et al. (2017).
A) Identifikace klíčových fosforylačních míst zodpovědných za aktivaci neutrální trehalasy Nth1 proteinem Bmh1. B) Pokles kinetiky výměny vodíku za deuterium indukované vazbou proteinu Bmh1 pro peptid zahrnující vápníkovou doménu, který se nachází na vazebném rozhraní obou proteinů. C) Struktura s nízkým rozlišením komplexu Nth1:Bmh1 získaná z měření maloúhlového rozptylu světla SAXS. Veisova et al. (2012), Macakova et al. (2013), Kopecka et al. (2014).
Protein 14-3-3 interaguje s N- i C-koncovými Gtβγ vazebnými rozhraními fosducinu. Kacirova et al. (2015).
